92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1884 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1884  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 606 aa  1256    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0200  glycoside hydrolase family 28  52.69 
 
 		 605 aa  604  1.0000000000000001e-171  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0152  glycoside hydrolase family 28  51.54 
 
 		 602 aa  600  1e-170  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1410  Fibronectin type III domain protein  53.07 
 
 		 659 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2862  Fibronectin type III domain protein  51.06 
 
 		 659 aa  570  1e-161  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0153  glycoside hydrolase family 28  48.8 
 
 		 604 aa  559  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.90665  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1756  exo-poly-galacturonase signal peptide protein  47.09 
 
 		 702 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0518728  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  30.56 
 
 		 447 aa  145  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  28.17 
 
 		 528 aa  130  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  29.27 
 
 		 551 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  30.08 
 
 		 542 aa  128  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  25.82 
 
 		 518 aa  125  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  27.14 
 
 		 463 aa  124  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  25.44 
 
 		 522 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  28.05 
 
 		 865 aa  122  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  27.47 
 
 		 470 aa  122  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  25.74 
 
 		 475 aa  120  7.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2567  glycoside hydrolase family protein  26.52 
 
 		 474 aa  118  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  25.05 
 
 		 560 aa  118  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5903  glycoside hydrolase family 28  28.24 
 
 		 521 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.672596 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  26.68 
 
 		 544 aa  115  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  28.29 
 
 		 541 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  26.94 
 
 		 554 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  27.78 
 
 		 467 aa  105  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4285  glycoside hydrolase family protein  26.45 
 
 		 543 aa  103  9e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  25.29 
 
 		 460 aa  103  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  25.44 
 
 		 460 aa  100  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  25.06 
 
 		 727 aa  99.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  25.29 
 
 		 460 aa  97.4  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  25.22 
 
 		 492 aa  96.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  27.54 
 
 		 448 aa  95.5  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  23.93 
 
 		 446 aa  95.9  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0483  glycoside hydrolase family protein  23.93 
 
 		 446 aa  95.1  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  24.34 
 
 		 455 aa  93.6  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  26.19 
 
 		 390 aa  93.2  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0230  glycoside hydrolase family protein  25.43 
 
 		 462 aa  92  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0700  glycoside hydrolase family 28  24.32 
 
 		 509 aa  91.7  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  28.63 
 
 		 479 aa  91.7  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2457  glycoside hydrolase family 28  25.94 
 
 		 508 aa  89.7  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140372  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3977  glycoside hydrolase family 28  44 
 
 		 543 aa  89.4  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.722531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  27.46 
 
 		 509 aa  89.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  45.76 
 
 		 524 aa  85.9  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  25.14 
 
 		 443 aa  85.9  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3334  galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  26.25 
 
 		 478 aa  85.1  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2125  glycoside hydrolase family 28  25.45 
 
 		 437 aa  85.1  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  40.62 
 
 		 559 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  25.45 
 
 		 431 aa  78.6  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  40.83 
 
 		 518 aa  78.2  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1489  Polygalacturonase/Pectinase  27.56 
 
 		 544 aa  76.6  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1581  glycoside hydrolase family 28  25.56 
 
 		 489 aa  72  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0871574 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2532  glycoside hydrolase family 28  27.15 
 
 		 459 aa  70.5  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3719  exo-poly-alpha-D-galacturonosidase precursor  24.06 
 
 		 537 aa  68.9  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3960  polygalacturonase  26.97 
 
 		 532 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0761528  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3321  glycoside hydrolase family 28  24.52 
 
 		 402 aa  68.2  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  23.67 
 
 		 530 aa  67.8  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0989  glycoside hydrolase family 28  23.71 
 
 		 402 aa  66.6  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1570  glycoside hydrolase family protein  25.59 
 
 		 544 aa  65.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7020  hypothetical protein  26.67 
 
 		 449 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361507  normal  0.742896 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00376  polygalacturonase  27.06 
 
 		 602 aa  65.9  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5374  glycoside hydrolase family 28  38.14 
 
 		 442 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4228  glycoside hydrolase family protein  34.43 
 
 		 442 aa  63.5  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  34.65 
 
 		 649 aa  61.6  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1580  Endopygalactorunase  32.21 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1529  glycoside hydrolase family 28  37.4 
 
 		 442 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1628  polygalacturonase precursor  24.87 
 
 		 544 aa  60.1  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0972  glycoside hydrolase family 28  35.71 
 
 		 448 aa  58.2  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3217  glycoside hydrolase family protein  35.43 
 
 		 491 aa  58.2  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3754  Endopygalactorunase  27.87 
 
 		 983 aa  57.4  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6877  hypothetical protein  26.28 
 
 		 543 aa  57  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0249011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3629  glycoside hydrolase family 28  24.77 
 
 		 488 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0125  Endopygalactorunase-like protein  40 
 
 		 633 aa  55.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300956  normal  0.0208856 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3221  glycoside hydrolase family protein  22.26 
 
 		 665 aa  54.7  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.301284  normal  0.0580699 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0833  polygalacturonase transmembrane protein  21.72 
 
 		 680 aa  53.9  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00798361 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1396  Endopygalactorunase-like protein  39.17 
 
 		 642 aa  53.5  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4858  glycoside hydrolase family 28  21.2 
 
 		 671 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0653045  normal  0.492882 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  21.89 
 
 		 444 aa  50.8  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1170  glycoside hydrolase family protein  26.57 
 
 		 548 aa  50.4  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0124  Endopygalactorunase-like protein  36.67 
 
 		 641 aa  50.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.778802  normal  0.020189 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5453  glycoside hydrolase family protein  21.34 
 
 		 664 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.34591 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4603  glycoside hydrolase family protein  22.87 
 
 		 665 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.039982  hitchhiker  0.000685896 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3371  glycoside hydrolase family 28  20.94 
 
 		 444 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0880  polygalacturonase precursor (pectinase) signal peptide protein  28.36 
 
 		 531 aa  48.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609321  normal  0.0402395 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5664  glycoside hydrolase family protein  27.67 
 
 		 725 aa  47.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6029  glycoside hydrolase family protein  27.67 
 
 		 725 aa  47.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0491802  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4904  glycoside hydrolase family protein  21.88 
 
 		 665 aa  47.4  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3581  hypothetical protein  24.02 
 
 		 791 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5982  glycoside hydrolase family protein  26.53 
 
 		 716 aa  45.8  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.113133 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  38.6 
 
 		 582 aa  45.8  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3654  hypothetical protein  24.02 
 
 		 791 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2384  hypothetical protein  52.5 
 
 		 415 aa  45.8  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.458902  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1453  hypothetical protein  43.08 
 
 		 365 aa  44.3  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3586  hypothetical protein  23.7 
 
 		 784 aa  44.3  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>