99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2391 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  100 
 
 		 470 aa  963    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  56.45 
 
 		 463 aa  521  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  56.58 
 
 		 865 aa  518  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  48.29 
 
 		 475 aa  467  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  50.81 
 
 		 446 aa  464  1e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0483  glycoside hydrolase family protein  50.81 
 
 		 446 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4285  glycoside hydrolase family protein  43.95 
 
 		 543 aa  329  5.0000000000000004e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  39.14 
 
 		 455 aa  316  5e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  37.79 
 
 		 448 aa  295  1e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  37.14 
 
 		 542 aa  280  4e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  35.67 
 
 		 544 aa  277  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  36.66 
 
 		 522 aa  278  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4858  glycoside hydrolase family 28  36.33 
 
 		 671 aa  265  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0653045  normal  0.492882 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  35.27 
 
 		 554 aa  263  4.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3221  glycoside hydrolase family protein  36.02 
 
 		 665 aa  259  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.301284  normal  0.0580699 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  38.12 
 
 		 447 aa  258  2e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2567  glycoside hydrolase family protein  33.55 
 
 		 474 aa  251  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4603  glycoside hydrolase family protein  36.74 
 
 		 665 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.039982  hitchhiker  0.000685896 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5453  glycoside hydrolase family protein  38.32 
 
 		 664 aa  246  6e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.34591 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  34.14 
 
 		 551 aa  245  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4904  glycoside hydrolase family protein  39.3 
 
 		 665 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  32.24 
 
 		 560 aa  239  5.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  35.15 
 
 		 541 aa  238  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  36.75 
 
 		 528 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  33.18 
 
 		 727 aa  230  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0833  polygalacturonase transmembrane protein  36.62 
 
 		 680 aa  229  8e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00798361 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0230  glycoside hydrolase family protein  33.41 
 
 		 462 aa  223  8e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  36.01 
 
 		 431 aa  210  5e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5903  glycoside hydrolase family 28  33.41 
 
 		 521 aa  208  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.672596 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0700  glycoside hydrolase family 28  30.32 
 
 		 509 aa  195  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2532  glycoside hydrolase family 28  34.11 
 
 		 459 aa  189  7e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  28.85 
 
 		 518 aa  177  4e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3334  galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  33.02 
 
 		 478 aa  171  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  29.95 
 
 		 390 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  31.3 
 
 		 467 aa  145  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  28.92 
 
 		 460 aa  144  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  32.37 
 
 		 460 aa  144  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  32.08 
 
 		 460 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46668  predicted protein  27.72 
 
 		 451 aa  139  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000812304  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  28.05 
 
 		 443 aa  133  9e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2457  glycoside hydrolase family 28  28.38 
 
 		 508 aa  131  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140372  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2125  glycoside hydrolase family 28  27.62 
 
 		 437 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  25.21 
 
 		 492 aa  127  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  29.64 
 
 		 530 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  25.97 
 
 		 509 aa  124  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5374  glycoside hydrolase family 28  26.16 
 
 		 442 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1884  glycoside hydrolase family protein  27.47 
 
 		 606 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  27.37 
 
 		 524 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  24.03 
 
 		 518 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0153  glycoside hydrolase family 28  30.11 
 
 		 604 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.90665  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3977  glycoside hydrolase family 28  22.84 
 
 		 543 aa  116  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.722531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3217  glycoside hydrolase family protein  26.46 
 
 		 491 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0200  glycoside hydrolase family 28  24.81 
 
 		 605 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1529  glycoside hydrolase family 28  26.11 
 
 		 442 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0972  glycoside hydrolase family 28  26.99 
 
 		 448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  28.36 
 
 		 479 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0152  glycoside hydrolase family 28  27.32 
 
 		 602 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  29.01 
 
 		 444 aa  111  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5359  putative polygalacturonase protein  30.23 
 
 		 454 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071082  normal  0.281824 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4228  glycoside hydrolase family protein  22.51 
 
 		 442 aa  107  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5759  polygalacturonase  28.25 
 
 		 416 aa  106  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  28.72 
 
 		 559 aa  103  9e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5079  Parallel beta-helix repeat protein  29.19 
 
 		 454 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416725  normal  0.142328 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3371  glycoside hydrolase family 28  26.01 
 
 		 444 aa  94  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1581  glycoside hydrolase family 28  26.32 
 
 		 489 aa  93.2  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0871574 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1410  Fibronectin type III domain protein  23.46 
 
 		 659 aa  86.3  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1170  glycoside hydrolase family protein  26.59 
 
 		 548 aa  86.3  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0989  glycoside hydrolase family 28  25.46 
 
 		 402 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2862  Fibronectin type III domain protein  24.67 
 
 		 659 aa  84.3  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7020  hypothetical protein  27.18 
 
 		 449 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361507  normal  0.742896 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1756  exo-poly-galacturonase signal peptide protein  25.54 
 
 		 702 aa  83.2  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0518728  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3960  polygalacturonase  24.4 
 
 		 532 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0761528  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3321  glycoside hydrolase family 28  24.74 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3719  exo-poly-alpha-D-galacturonosidase precursor  26.33 
 
 		 537 aa  79.7  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1489  Polygalacturonase/Pectinase  26.22 
 
 		 544 aa  70.9  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3629  glycoside hydrolase family 28  22.71 
 
 		 488 aa  70.5  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3630  glycoside hydrolase family 28  21.93 
 
 		 513 aa  68.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1628  polygalacturonase precursor  23.54 
 
 		 544 aa  65.9  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0125  Endopygalactorunase-like protein  34.75 
 
 		 633 aa  63.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300956  normal  0.0208856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  23.62 
 
 		 649 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1922  Endopygalactorunase-like protein  38.46 
 
 		 669 aa  60.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.449199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1396  Endopygalactorunase-like protein  33.33 
 
 		 642 aa  60.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1570  glycoside hydrolase family protein  23.02 
 
 		 544 aa  60.5  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0124  Endopygalactorunase-like protein  35.48 
 
 		 641 aa  60.8  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.778802  normal  0.020189 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0127  PKD domain containing protein  38.58 
 
 		 931 aa  59.7  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00188311 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6920  glycoside hydrolase family protein  23.12 
 
 		 458 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1580  Endopygalactorunase  26.63 
 
 		 246 aa  58.9  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4887  glycoside hydrolase family protein  22.86 
 
 		 458 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3277  glycoside hydrolase family protein  22.86 
 
 		 458 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.113275 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04372  Endo-polygalacturonase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT2]  24.64 
 
 		 361 aa  55.1  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.217421 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1711  endopygalactorunase-like protein  29.41 
 
 		 620 aa  55.1  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5982  glycoside hydrolase family protein  20.62 
 
 		 716 aa  54.7  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.113133 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0880  polygalacturonase precursor (pectinase) signal peptide protein  22.51 
 
 		 531 aa  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609321  normal  0.0402395 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16052  predicted protein  26.19 
 
 		 271 aa  51.2  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032394  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6877  hypothetical protein  20.71 
 
 		 543 aa  50.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0249011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3754  Endopygalactorunase  37.5 
 
 		 983 aa  50.4  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00376  polygalacturonase  24.68 
 
 		 602 aa  50.1  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3618  hypothetical protein  35.29 
 
 		 547 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.216975 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3310  hypothetical protein  25.33 
 
 		 518 aa  43.9  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>