101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1158 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  100 
 
 		 554 aa  1138    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  69.65 
 
 		 727 aa  650    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  59.35 
 
 		 544 aa  649    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  55.74 
 
 		 551 aa  628  1e-179  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  46.22 
 
 		 560 aa  509  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2567  glycoside hydrolase family protein  47.59 
 
 		 474 aa  414  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0230  glycoside hydrolase family protein  41.23 
 
 		 462 aa  359  8e-98  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2457  glycoside hydrolase family 28  39.82 
 
 		 508 aa  306  5.0000000000000004e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140372  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  37.71 
 
 		 522 aa  306  7e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  38.76 
 
 		 542 aa  303  6.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  38.77 
 
 		 865 aa  285  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4285  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 543 aa  283  8.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  35.59 
 
 		 447 aa  278  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  35.27 
 
 		 470 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  34.65 
 
 		 541 aa  259  1e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  32.48 
 
 		 528 aa  252  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2532  glycoside hydrolase family 28  34 
 
 		 459 aa  249  1e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  34.93 
 
 		 463 aa  244  3e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  34.22 
 
 		 448 aa  244  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  32.55 
 
 		 475 aa  243  7e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5903  glycoside hydrolase family 28  32.54 
 
 		 521 aa  243  7e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.672596 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0700  glycoside hydrolase family 28  32.65 
 
 		 509 aa  239  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  34.16 
 
 		 431 aa  236  1.0000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0483  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 446 aa  233  1e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 446 aa  232  1e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  32.15 
 
 		 518 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  34.07 
 
 		 455 aa  210  7e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  29.44 
 
 		 460 aa  181  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3334  galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  30.63 
 
 		 478 aa  179  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  28.41 
 
 		 467 aa  176  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  27.82 
 
 		 460 aa  172  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  28.02 
 
 		 460 aa  172  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4858  glycoside hydrolase family 28  29.06 
 
 		 671 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0653045  normal  0.492882 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  28.41 
 
 		 390 aa  166  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4904  glycoside hydrolase family protein  26.76 
 
 		 665 aa  154  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5453  glycoside hydrolase family protein  26.76 
 
 		 664 aa  154  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.34591 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46668  predicted protein  27.56 
 
 		 451 aa  154  4e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000812304  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2125  glycoside hydrolase family 28  27.93 
 
 		 437 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4603  glycoside hydrolase family protein  26.96 
 
 		 665 aa  151  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.039982  hitchhiker  0.000685896 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0200  glycoside hydrolase family 28  28.31 
 
 		 605 aa  150  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3221  glycoside hydrolase family protein  26.56 
 
 		 665 aa  150  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.301284  normal  0.0580699 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  25.17 
 
 		 518 aa  140  7e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0833  polygalacturonase transmembrane protein  28.97 
 
 		 680 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00798361 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2862  Fibronectin type III domain protein  26.1 
 
 		 659 aa  139  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1410  Fibronectin type III domain protein  26.95 
 
 		 659 aa  139  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0152  glycoside hydrolase family 28  29.54 
 
 		 602 aa  137  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3977  glycoside hydrolase family 28  29.38 
 
 		 543 aa  128  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.722531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0153  glycoside hydrolase family 28  30.37 
 
 		 604 aa  127  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.90665  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  26.32 
 
 		 443 aa  124  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  28.79 
 
 		 492 aa  121  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1884  glycoside hydrolase family protein  26.94 
 
 		 606 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  24.15 
 
 		 479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3217  glycoside hydrolase family protein  24.64 
 
 		 491 aa  111  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0972  glycoside hydrolase family 28  23.86 
 
 		 448 aa  110  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  27.32 
 
 		 509 aa  107  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5759  polygalacturonase  27.08 
 
 		 416 aa  107  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3719  exo-poly-alpha-D-galacturonosidase precursor  26.1 
 
 		 537 aa  106  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  26.79 
 
 		 530 aa  105  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1581  glycoside hydrolase family 28  26.54 
 
 		 489 aa  104  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0871574 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  22.22 
 
 		 444 aa  103  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1170  glycoside hydrolase family protein  27.77 
 
 		 548 aa  103  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  25.84 
 
 		 524 aa  103  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1756  exo-poly-galacturonase signal peptide protein  23.56 
 
 		 702 aa  102  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0518728  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5359  putative polygalacturonase protein  23.99 
 
 		 454 aa  100  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071082  normal  0.281824 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  27.09 
 
 		 559 aa  100  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5374  glycoside hydrolase family 28  23.6 
 
 		 442 aa  100  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5079  Parallel beta-helix repeat protein  23.67 
 
 		 454 aa  96.3  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416725  normal  0.142328 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3371  glycoside hydrolase family 28  22.04 
 
 		 444 aa  96.3  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4228  glycoside hydrolase family protein  23.43 
 
 		 442 aa  93.6  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0989  glycoside hydrolase family 28  28.08 
 
 		 402 aa  92.8  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1529  glycoside hydrolase family 28  24.18 
 
 		 442 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3321  glycoside hydrolase family 28  28.37 
 
 		 402 aa  91.7  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5664  glycoside hydrolase family protein  25.6 
 
 		 725 aa  90.5  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6029  glycoside hydrolase family protein  25.6 
 
 		 725 aa  90.5  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0491802  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3960  polygalacturonase  24.79 
 
 		 532 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0761528  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5982  glycoside hydrolase family protein  23.37 
 
 		 716 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.113133 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1489  Polygalacturonase/Pectinase  26.8 
 
 		 544 aa  77.4  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7020  hypothetical protein  25.22 
 
 		 449 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361507  normal  0.742896 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00376  polygalacturonase  25.7 
 
 		 602 aa  74.3  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3630  glycoside hydrolase family 28  30.15 
 
 		 513 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6877  hypothetical protein  25.19 
 
 		 543 aa  72.8  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0249011  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0880  polygalacturonase precursor (pectinase) signal peptide protein  34.33 
 
 		 531 aa  71.2  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609321  normal  0.0402395 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16052  predicted protein  30.43 
 
 		 271 aa  70.1  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032394  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3629  glycoside hydrolase family 28  29.7 
 
 		 488 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1580  Endopygalactorunase  26.77 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1628  polygalacturonase precursor  26.95 
 
 		 544 aa  57.8  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1570  glycoside hydrolase family protein  26.95 
 
 		 544 aa  57.4  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0125  Endopygalactorunase-like protein  29.06 
 
 		 633 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300956  normal  0.0208856 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3754  Endopygalactorunase  24.12 
 
 		 983 aa  54.3  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46492  predicted protein  30.77 
 
 		 563 aa  53.9  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.481419  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4887  glycoside hydrolase family protein  23.77 
 
 		 458 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3277  glycoside hydrolase family protein  23.77 
 
 		 458 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.113275 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6920  glycoside hydrolase family protein  23.64 
 
 		 458 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0124  Endopygalactorunase-like protein  28.33 
 
 		 641 aa  52.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.778802  normal  0.020189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  28.81 
 
 		 649 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08891  Exopolygalacturonase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q873X6]  25.53 
 
 		 440 aa  50.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.47713 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1396  Endopygalactorunase-like protein  29.66 
 
 		 642 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1922  Endopygalactorunase-like protein  32.43 
 
 		 669 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.449199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0127  PKD domain containing protein  36.99 
 
 		 931 aa  48.5  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00188311 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1711  endopygalactorunase-like protein  22.9 
 
 		 620 aa  47.8  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>