84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1410 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1410  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 659 aa  1362    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2862  Fibronectin type III domain protein  93.17 
 
 		 659 aa  1279    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1884  glycoside hydrolase family protein  53.07 
 
 		 606 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0152  glycoside hydrolase family 28  47.66 
 
 		 602 aa  540  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0200  glycoside hydrolase family 28  47.75 
 
 		 605 aa  523  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1756  exo-poly-galacturonase signal peptide protein  46.74 
 
 		 702 aa  503  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0518728  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0153  glycoside hydrolase family 28  47.34 
 
 		 604 aa  499  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.90665  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  26.95 
 
 		 554 aa  139  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2567  glycoside hydrolase family protein  25.61 
 
 		 474 aa  120  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  27.32 
 
 		 447 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  25.6 
 
 		 518 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  26.51 
 
 		 541 aa  117  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  26.75 
 
 		 522 aa  117  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  27.15 
 
 		 551 aa  115  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  25.77 
 
 		 460 aa  111  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  25.24 
 
 		 544 aa  110  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  24.84 
 
 		 528 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  28.89 
 
 		 542 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  26.89 
 
 		 460 aa  108  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0230  glycoside hydrolase family protein  23.94 
 
 		 462 aa  108  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  26.37 
 
 		 463 aa  106  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  26.39 
 
 		 460 aa  103  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  26.62 
 
 		 865 aa  101  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  24.12 
 
 		 475 aa  98.6  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  21.88 
 
 		 560 aa  98.2  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  24.23 
 
 		 467 aa  95.5  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  23.25 
 
 		 390 aa  94.7  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4285  glycoside hydrolase family protein  24.01 
 
 		 543 aa  94.7  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0700  glycoside hydrolase family 28  23.18 
 
 		 509 aa  93.2  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  24.94 
 
 		 448 aa  92.8  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5903  glycoside hydrolase family 28  23.04 
 
 		 521 aa  87.8  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.672596 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  22.68 
 
 		 727 aa  87.4  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2457  glycoside hydrolase family 28  25.34 
 
 		 508 aa  86.3  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140372  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  23.46 
 
 		 470 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  22.25 
 
 		 446 aa  86.3  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2125  glycoside hydrolase family 28  24.15 
 
 		 437 aa  85.5  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0483  glycoside hydrolase family protein  22.48 
 
 		 446 aa  85.5  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3334  galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  24.02 
 
 		 478 aa  78.6  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  25.85 
 
 		 455 aa  74.7  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3321  glycoside hydrolase family 28  26.26 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  23.8 
 
 		 443 aa  70.5  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2532  glycoside hydrolase family 28  29.25 
 
 		 459 aa  70.1  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  26.77 
 
 		 559 aa  70.1  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0989  glycoside hydrolase family 28  24.93 
 
 		 402 aa  70.1  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1489  Polygalacturonase/Pectinase  25.34 
 
 		 544 aa  68.2  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3960  polygalacturonase  24.49 
 
 		 532 aa  68.2  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0761528  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  22.39 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  23.05 
 
 		 431 aa  67.4  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3977  glycoside hydrolase family 28  24.82 
 
 		 543 aa  66.6  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.722531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  35.61 
 
 		 524 aa  66.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  36.15 
 
 		 509 aa  66.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00376  polygalacturonase  27.48 
 
 		 602 aa  65.9  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1170  glycoside hydrolase family protein  23.86 
 
 		 548 aa  65.5  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  23.42 
 
 		 479 aa  63.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  24.11 
 
 		 518 aa  63.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3217  glycoside hydrolase family protein  24.68 
 
 		 491 aa  62.8  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0880  polygalacturonase precursor (pectinase) signal peptide protein  32.35 
 
 		 531 aa  62  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609321  normal  0.0402395 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5374  glycoside hydrolase family 28  23.99 
 
 		 442 aa  61.6  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  21.33 
 
 		 492 aa  60.5  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  24.85 
 
 		 530 aa  58.9  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3629  glycoside hydrolase family 28  28 
 
 		 488 aa  55.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5664  glycoside hydrolase family protein  24.49 
 
 		 725 aa  55.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6029  glycoside hydrolase family protein  24.49 
 
 		 725 aa  55.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0491802  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7020  hypothetical protein  24.87 
 
 		 449 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361507  normal  0.742896 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1581  glycoside hydrolase family 28  21.85 
 
 		 489 aa  55.1  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0871574 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4228  glycoside hydrolase family protein  23.34 
 
 		 442 aa  54.7  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0125  Endopygalactorunase-like protein  34.4 
 
 		 633 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300956  normal  0.0208856 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1570  glycoside hydrolase family protein  24.21 
 
 		 544 aa  53.5  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0972  glycoside hydrolase family 28  19.59 
 
 		 448 aa  53.1  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3719  exo-poly-alpha-D-galacturonosidase precursor  22.12 
 
 		 537 aa  53.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1628  polygalacturonase precursor  25.6 
 
 		 544 aa  51.6  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1529  glycoside hydrolase family 28  23.78 
 
 		 442 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4887  glycoside hydrolase family protein  22.22 
 
 		 458 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6920  glycoside hydrolase family protein  22.22 
 
 		 458 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3277  glycoside hydrolase family protein  22.22 
 
 		 458 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.113275 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3371  glycoside hydrolase family 28  21.16 
 
 		 444 aa  49.7  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4858  glycoside hydrolase family 28  24 
 
 		 671 aa  48.9  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0653045  normal  0.492882 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5982  glycoside hydrolase family protein  27.85 
 
 		 716 aa  48.5  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.113133 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1396  Endopygalactorunase-like protein  33.59 
 
 		 642 aa  46.6  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1922  Endopygalactorunase-like protein  41.1 
 
 		 669 aa  45.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.449199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1711  endopygalactorunase-like protein  34.21 
 
 		 620 aa  44.7  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3630  glycoside hydrolase family 28  22.15 
 
 		 513 aa  44.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1580  Endopygalactorunase  31.25 
 
 		 246 aa  44.3  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4904  glycoside hydrolase family protein  24.24 
 
 		 665 aa  43.9  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.399094 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>