106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4247 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
448 aa  918    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  41.1 
 
 
475 aa  321  9.999999999999999e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  39.17 
 
 
463 aa  296  7e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  37.79 
 
 
470 aa  295  1e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  39.39 
 
 
865 aa  292  7e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0483  glycoside hydrolase family protein  39.11 
 
 
446 aa  290  4e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  38.88 
 
 
446 aa  289  7e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  34.22 
 
 
554 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  34.07 
 
 
544 aa  244  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4285  glycoside hydrolase family protein  35.22 
 
 
543 aa  244  3e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  36.71 
 
 
447 aa  237  3e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  36.98 
 
 
455 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  33.18 
 
 
551 aa  230  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  37.47 
 
 
542 aa  230  4e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2567  glycoside hydrolase family protein  34.81 
 
 
474 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  34.31 
 
 
522 aa  212  9e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  31.52 
 
 
727 aa  212  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4858  glycoside hydrolase family 28  30.85 
 
 
671 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0653045  normal  0.492882 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4603  glycoside hydrolase family protein  30.13 
 
 
665 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.039982  hitchhiker  0.000685896 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4904  glycoside hydrolase family protein  29.68 
 
 
665 aa  193  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  30.84 
 
 
560 aa  193  5e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3221  glycoside hydrolase family protein  30.11 
 
 
665 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.301284  normal  0.0580699 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5453  glycoside hydrolase family protein  29.44 
 
 
664 aa  190  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.34591 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  31.27 
 
 
431 aa  189  8e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  31.04 
 
 
541 aa  189  9e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0230  glycoside hydrolase family protein  30.23 
 
 
462 aa  176  8e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  32.13 
 
 
528 aa  172  6.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0833  polygalacturonase transmembrane protein  29.75 
 
 
680 aa  168  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00798361 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2532  glycoside hydrolase family 28  30.58 
 
 
459 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  29.26 
 
 
518 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0700  glycoside hydrolase family 28  30.92 
 
 
509 aa  162  8.000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  32.56 
 
 
390 aa  160  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5903  glycoside hydrolase family 28  32.82 
 
 
521 aa  152  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.672596 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46668  predicted protein  29.97 
 
 
451 aa  150  3e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000812304  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3977  glycoside hydrolase family 28  29.13 
 
 
543 aa  140  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.722531  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  29.44 
 
 
467 aa  138  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  31.93 
 
 
460 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  32.21 
 
 
460 aa  136  7.000000000000001e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  31 
 
 
460 aa  133  6.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2125  glycoside hydrolase family 28  27.42 
 
 
437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  29.84 
 
 
524 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3334  galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  25.92 
 
 
478 aa  131  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  31.17 
 
 
443 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3217  glycoside hydrolase family protein  27.34 
 
 
491 aa  127  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2457  glycoside hydrolase family 28  26.51 
 
 
508 aa  125  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140372  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  29 
 
 
479 aa  123  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4228  glycoside hydrolase family protein  23.53 
 
 
442 aa  123  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0153  glycoside hydrolase family 28  27.89 
 
 
604 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.90665  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5374  glycoside hydrolase family 28  26.02 
 
 
442 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  25.22 
 
 
518 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  30.42 
 
 
492 aa  117  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  27.99 
 
 
509 aa  110  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0152  glycoside hydrolase family 28  29.51 
 
 
602 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1529  glycoside hydrolase family 28  26.84 
 
 
442 aa  110  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604094  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0200  glycoside hydrolase family 28  25.68 
 
 
605 aa  110  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  27.02 
 
 
530 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3321  glycoside hydrolase family 28  29.17 
 
 
402 aa  101  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0972  glycoside hydrolase family 28  23.92 
 
 
448 aa  99.8  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0989  glycoside hydrolase family 28  28.18 
 
 
402 aa  99  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1581  glycoside hydrolase family 28  27.69 
 
 
489 aa  97.1  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0871574 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1884  glycoside hydrolase family protein  27.54 
 
 
606 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185674  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7020  hypothetical protein  24.85 
 
 
449 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361507  normal  0.742896 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1410  Fibronectin type III domain protein  24.94 
 
 
659 aa  92.8  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  21.56 
 
 
444 aa  89.7  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3960  polygalacturonase  25 
 
 
532 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0761528  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2862  Fibronectin type III domain protein  25.74 
 
 
659 aa  88.6  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3629  glycoside hydrolase family 28  24.01 
 
 
488 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  25.71 
 
 
559 aa  88.2  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3630  glycoside hydrolase family 28  21.97 
 
 
513 aa  86.7  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370863  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1489  Polygalacturonase/Pectinase  25.46 
 
 
544 aa  86.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00376  polygalacturonase  25.26 
 
 
602 aa  84.3  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3371  glycoside hydrolase family 28  23.53 
 
 
444 aa  80.1  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5359  putative polygalacturonase protein  24.62 
 
 
454 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071082  normal  0.281824 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1756  exo-poly-galacturonase signal peptide protein  22.37 
 
 
702 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0518728  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5759  polygalacturonase  23.68 
 
 
416 aa  76.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5079  Parallel beta-helix repeat protein  23.49 
 
 
454 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416725  normal  0.142328 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1170  glycoside hydrolase family protein  23.23 
 
 
548 aa  73.2  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3719  exo-poly-alpha-D-galacturonosidase precursor  22.17 
 
 
537 aa  72  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1628  polygalacturonase precursor  26.48 
 
 
544 aa  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0124  Endopygalactorunase-like protein  32.2 
 
 
641 aa  64.3  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.778802  normal  0.020189 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1570  glycoside hydrolase family protein  25.78 
 
 
544 aa  63.2  0.000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0125  Endopygalactorunase-like protein  30.77 
 
 
633 aa  60.1  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300956  normal  0.0208856 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6920  glycoside hydrolase family protein  24.77 
 
 
458 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1396  Endopygalactorunase-like protein  30.6 
 
 
642 aa  59.7  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230855  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4887  glycoside hydrolase family protein  24.46 
 
 
458 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3277  glycoside hydrolase family protein  24.46 
 
 
458 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.113275 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46492  predicted protein  24.63 
 
 
563 aa  57.4  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.481419  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0880  polygalacturonase precursor (pectinase) signal peptide protein  22.22 
 
 
531 aa  56.2  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609321  normal  0.0402395 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02590  polygalacturonase, putative  23.89 
 
 
478 aa  55.1  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08761  Exo-polygalacturonasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ASG9]  21.38 
 
 
434 aa  54.7  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.987401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  21.35 
 
 
649 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06656  endopolygalacturonase (Eurofung)  21.53 
 
 
514 aa  54.3  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16052  predicted protein  28.49 
 
 
271 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032394  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3754  Endopygalactorunase  23.08 
 
 
983 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1922  Endopygalactorunase-like protein  26.72 
 
 
669 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.449199  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1711  endopygalactorunase-like protein  22.98 
 
 
620 aa  52.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1580  Endopygalactorunase  28.33 
 
 
246 aa  50.8  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0127  PKD domain containing protein  29.66 
 
 
931 aa  50.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00188311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6877  hypothetical protein  21.23 
 
 
543 aa  47  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0249011  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08327  Endo-polygalacturonasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ATQ3]  22.4 
 
 
380 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.23769  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>