86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1581 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1581  glycoside hydrolase family 28  100 
 
 		 489 aa  990    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0871574 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  52.24 
 
 		 492 aa  506  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  38.76 
 
 		 509 aa  347  3e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  40.22 
 
 		 530 aa  342  7e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  31.25 
 
 		 524 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  30.33 
 
 		 518 aa  212  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3977  glycoside hydrolase family 28  29.79 
 
 		 543 aa  200  5e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.722531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  29.77 
 
 		 447 aa  157  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1580  Endopygalactorunase  42.92 
 
 		 246 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3719  exo-poly-alpha-D-galacturonosidase precursor  26.74 
 
 		 537 aa  149  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1170  glycoside hydrolase family protein  25.75 
 
 		 548 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  28.67 
 
 		 542 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  24.89 
 
 		 559 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0972  glycoside hydrolase family 28  29.05 
 
 		 448 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3217  glycoside hydrolase family protein  27.71 
 
 		 491 aa  127  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  26.3 
 
 		 444 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  28.46 
 
 		 390 aa  120  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  27.2 
 
 		 522 aa  120  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  26.69 
 
 		 551 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  27.4 
 
 		 443 aa  117  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3371  glycoside hydrolase family 28  27.7 
 
 		 444 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  26.67 
 
 		 544 aa  113  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  30.07 
 
 		 528 aa  113  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  23.11 
 
 		 649 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  25.76 
 
 		 479 aa  110  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  29.18 
 
 		 475 aa  110  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5359  putative polygalacturonase protein  25.31 
 
 		 454 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071082  normal  0.281824 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5903  glycoside hydrolase family 28  29.59 
 
 		 521 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.672596 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  26.98 
 
 		 560 aa  108  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  26.54 
 
 		 554 aa  104  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5759  polygalacturonase  24.6 
 
 		 416 aa  104  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2567  glycoside hydrolase family protein  28.24 
 
 		 474 aa  103  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  27.94 
 
 		 460 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  24.27 
 
 		 431 aa  101  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  28.47 
 
 		 467 aa  100  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5079  Parallel beta-helix repeat protein  24.07 
 
 		 454 aa  100  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416725  normal  0.142328 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  30.1 
 
 		 463 aa  98.2  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  27.69 
 
 		 448 aa  97.1  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  28.16 
 
 		 460 aa  94.4  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  26.32 
 
 		 470 aa  93.2  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  24.46 
 
 		 455 aa  91.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  28.52 
 
 		 460 aa  90.9  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6877  hypothetical protein  28.52 
 
 		 543 aa  90.9  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0249011  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2125  glycoside hydrolase family 28  28.19 
 
 		 437 aa  90.5  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  22.18 
 
 		 541 aa  90.1  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0700  glycoside hydrolase family 28  26.51 
 
 		 509 aa  87.4  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 446 aa  87  6e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  24.67 
 
 		 865 aa  87  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0483  glycoside hydrolase family protein  25.28 
 
 		 446 aa  85.9  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0230  glycoside hydrolase family protein  24.77 
 
 		 462 aa  86.3  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4228  glycoside hydrolase family protein  26.99 
 
 		 442 aa  85.9  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5374  glycoside hydrolase family 28  27.6 
 
 		 442 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4285  glycoside hydrolase family protein  27.19 
 
 		 543 aa  85.9  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3334  galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  23.31 
 
 		 478 aa  84.3  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1529  glycoside hydrolase family 28  26.99 
 
 		 442 aa  83.6  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  23.7 
 
 		 727 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2457  glycoside hydrolase family 28  24.16 
 
 		 508 aa  82.4  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140372  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2532  glycoside hydrolase family 28  23.68 
 
 		 459 aa  81.6  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  24.08 
 
 		 518 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16052  predicted protein  24.59 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032394  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1884  glycoside hydrolase family protein  25.56 
 
 		 606 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0152  glycoside hydrolase family 28  23.74 
 
 		 602 aa  72.4  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0200  glycoside hydrolase family 28  26.19 
 
 		 605 aa  71.6  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46668  predicted protein  22.8 
 
 		 451 aa  70.5  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000812304  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0153  glycoside hydrolase family 28  24.87 
 
 		 604 aa  65.9  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.90665  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3754  Endopygalactorunase  19.89 
 
 		 983 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0989  glycoside hydrolase family 28  24.91 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3321  glycoside hydrolase family 28  24.79 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1410  Fibronectin type III domain protein  21.85 
 
 		 659 aa  55.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2862  Fibronectin type III domain protein  21.74 
 
 		 659 aa  54.7  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1711  endopygalactorunase-like protein  24.63 
 
 		 620 aa  54.3  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1756  exo-poly-galacturonase signal peptide protein  20.52 
 
 		 702 aa  53.5  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0518728  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1396  Endopygalactorunase-like protein  28.15 
 
 		 642 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1922  Endopygalactorunase-like protein  26.73 
 
 		 669 aa  50.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.449199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3221  glycoside hydrolase family protein  27.82 
 
 		 665 aa  49.7  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.301284  normal  0.0580699 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4603  glycoside hydrolase family protein  23.48 
 
 		 665 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.039982  hitchhiker  0.000685896 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0833  polygalacturonase transmembrane protein  27.27 
 
 		 680 aa  49.7  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00798361 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4858  glycoside hydrolase family 28  27.69 
 
 		 671 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0653045  normal  0.492882 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0127  PKD domain containing protein  22.47 
 
 		 931 aa  48.5  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00188311 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7020  hypothetical protein  21.43 
 
 		 449 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361507  normal  0.742896 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3960  polygalacturonase  22.13 
 
 		 532 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0761528  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0172  coagulation factor 5/8 type domain protein  21.33 
 
 		 685 aa  47  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.238557  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3310  hypothetical protein  23.38 
 
 		 518 aa  44.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4904  glycoside hydrolase family protein  26.92 
 
 		 665 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0124  Endopygalactorunase-like protein  28.21 
 
 		 641 aa  43.9  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.778802  normal  0.020189 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0125  Endopygalactorunase-like protein  22.85 
 
 		 633 aa  43.5  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300956  normal  0.0208856 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>