92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1569 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  100 
 
 		 443 aa  904    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  40.07 
 
 		 447 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  31.3 
 
 		 479 aa  172  6.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3217  glycoside hydrolase family protein  29.27 
 
 		 491 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  30.33 
 
 		 542 aa  159  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0972  glycoside hydrolase family 28  28.73 
 
 		 448 aa  159  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  30.05 
 
 		 522 aa  155  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  26.4 
 
 		 444 aa  144  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  30.96 
 
 		 865 aa  143  6e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3371  glycoside hydrolase family 28  25.4 
 
 		 444 aa  142  9e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  27.62 
 
 		 541 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  27.14 
 
 		 492 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  31.45 
 
 		 431 aa  138  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5359  putative polygalacturonase protein  26.46 
 
 		 454 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071082  normal  0.281824 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  26.48 
 
 		 518 aa  137  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5079  Parallel beta-helix repeat protein  27.25 
 
 		 454 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416725  normal  0.142328 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  28.05 
 
 		 509 aa  133  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  28.05 
 
 		 470 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  27.81 
 
 		 524 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  31.17 
 
 		 448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  28.06 
 
 		 455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  27.25 
 
 		 475 aa  126  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  29.78 
 
 		 518 aa  126  6e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  28.4 
 
 		 544 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  30.97 
 
 		 559 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  26.85 
 
 		 560 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  31.8 
 
 		 463 aa  125  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  26.32 
 
 		 554 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0483  glycoside hydrolase family protein  29.49 
 
 		 446 aa  124  5e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  29.49 
 
 		 446 aa  123  6e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  27.33 
 
 		 551 aa  119  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2567  glycoside hydrolase family protein  27.99 
 
 		 474 aa  117  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1581  glycoside hydrolase family 28  27.4 
 
 		 489 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0871574 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  29.82 
 
 		 460 aa  117  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  27.7 
 
 		 530 aa  116  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  29.45 
 
 		 528 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5759  polygalacturonase  24.64 
 
 		 416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5903  glycoside hydrolase family 28  29.43 
 
 		 521 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.672596 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0700  glycoside hydrolase family 28  31.23 
 
 		 509 aa  114  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  27.94 
 
 		 460 aa  114  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  29.24 
 
 		 460 aa  114  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4228  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 442 aa  113  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2125  glycoside hydrolase family 28  27.32 
 
 		 437 aa  113  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2532  glycoside hydrolase family 28  27.74 
 
 		 459 aa  113  8.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4285  glycoside hydrolase family protein  28.34 
 
 		 543 aa  112  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0230  glycoside hydrolase family protein  27.11 
 
 		 462 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5374  glycoside hydrolase family 28  27.68 
 
 		 442 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  27.93 
 
 		 467 aa  110  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16052  predicted protein  28.93 
 
 		 271 aa  108  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032394  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  25.94 
 
 		 727 aa  107  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3719  exo-poly-alpha-D-galacturonosidase precursor  25.4 
 
 		 537 aa  106  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3977  glycoside hydrolase family 28  29.67 
 
 		 543 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.722531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6877  hypothetical protein  24.68 
 
 		 543 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0249011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46668  predicted protein  27.44 
 
 		 451 aa  102  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000812304  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  27.85 
 
 		 390 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1529  glycoside hydrolase family 28  27.89 
 
 		 442 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2457  glycoside hydrolase family 28  24.34 
 
 		 508 aa  97.1  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140372  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1170  glycoside hydrolase family protein  23.78 
 
 		 548 aa  96.7  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1884  glycoside hydrolase family protein  25.14 
 
 		 606 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3334  galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  22.04 
 
 		 478 aa  86.3  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0153  glycoside hydrolase family 28  26.27 
 
 		 604 aa  85.1  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.90665  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0152  glycoside hydrolase family 28  25.95 
 
 		 602 aa  85.5  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0200  glycoside hydrolase family 28  24.48 
 
 		 605 aa  81.3  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3321  glycoside hydrolase family 28  25.85 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1410  Fibronectin type III domain protein  23.8 
 
 		 659 aa  70.5  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0989  glycoside hydrolase family 28  24.71 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1396  Endopygalactorunase-like protein  22.83 
 
 		 642 aa  69.3  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1580  Endopygalactorunase  29.86 
 
 		 246 aa  68.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2862  Fibronectin type III domain protein  25.94 
 
 		 659 aa  67.8  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3221  glycoside hydrolase family protein  24.06 
 
 		 665 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.301284  normal  0.0580699 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0833  polygalacturonase transmembrane protein  25.68 
 
 		 680 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00798361 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1756  exo-poly-galacturonase signal peptide protein  22.16 
 
 		 702 aa  63.9  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0518728  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  24.03 
 
 		 649 aa  63.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7020  hypothetical protein  24.48 
 
 		 449 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361507  normal  0.742896 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0125  Endopygalactorunase-like protein  25.85 
 
 		 633 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300956  normal  0.0208856 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4603  glycoside hydrolase family protein  23.86 
 
 		 665 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.039982  hitchhiker  0.000685896 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3630  glycoside hydrolase family 28  23.77 
 
 		 513 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4858  glycoside hydrolase family 28  28.72 
 
 		 671 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0653045  normal  0.492882 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3310  hypothetical protein  25.37 
 
 		 518 aa  61.6  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5453  glycoside hydrolase family protein  23.86 
 
 		 664 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.34591 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1711  endopygalactorunase-like protein  26.67 
 
 		 620 aa  57  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4904  glycoside hydrolase family protein  23.35 
 
 		 665 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3754  Endopygalactorunase  43.94 
 
 		 983 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0124  Endopygalactorunase-like protein  22.76 
 
 		 641 aa  53.5  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.778802  normal  0.020189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3629  glycoside hydrolase family 28  23.62 
 
 		 488 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0127  PKD domain containing protein  20.76 
 
 		 931 aa  50.8  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00188311 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1922  Endopygalactorunase-like protein  28.57 
 
 		 669 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.449199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3618  hypothetical protein  32.14 
 
 		 547 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.216975 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3960  polygalacturonase  22.08 
 
 		 532 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0761528  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08891  Exopolygalacturonase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q873X6]  24.39 
 
 		 440 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.47713 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1489  Polygalacturonase/Pectinase  23.64 
 
 		 544 aa  48.5  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0172  coagulation factor 5/8 type domain protein  22.19 
 
 		 685 aa  46.6  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.238557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>