95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1710 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  100 
 
 		 518 aa  1060    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  36.03 
 
 		 509 aa  291  1e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  35.54 
 
 		 524 aa  282  1e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3977  glycoside hydrolase family 28  31.21 
 
 		 543 aa  251  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.722531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  30.95 
 
 		 530 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  31.82 
 
 		 492 aa  226  9e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1581  glycoside hydrolase family 28  30.4 
 
 		 489 aa  217  4e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0871574 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  31.66 
 
 		 559 aa  211  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3217  glycoside hydrolase family protein  31 
 
 		 491 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3719  exo-poly-alpha-D-galacturonosidase precursor  30.77 
 
 		 537 aa  166  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  27.41 
 
 		 447 aa  161  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  32.56 
 
 		 444 aa  159  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  28.94 
 
 		 460 aa  149  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  25.41 
 
 		 554 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  27.64 
 
 		 542 aa  146  9e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5374  glycoside hydrolase family 28  35.04 
 
 		 442 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  26.54 
 
 		 649 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  26.48 
 
 		 443 aa  139  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  26.75 
 
 		 475 aa  139  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0972  glycoside hydrolase family 28  32.14 
 
 		 448 aa  137  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3371  glycoside hydrolase family 28  31.1 
 
 		 444 aa  136  7.000000000000001e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  24.12 
 
 		 541 aa  136  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  26.38 
 
 		 865 aa  133  6.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  26.37 
 
 		 522 aa  133  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  25.24 
 
 		 551 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  26.7 
 
 		 560 aa  132  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  29.17 
 
 		 455 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  25.71 
 
 		 544 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1170  glycoside hydrolase family protein  27.85 
 
 		 548 aa  130  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  27.43 
 
 		 460 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  25.45 
 
 		 518 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  27.43 
 
 		 460 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  25.68 
 
 		 448 aa  123  9e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4285  glycoside hydrolase family protein  28.93 
 
 		 543 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  26 
 
 		 479 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  26.44 
 
 		 467 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0230  glycoside hydrolase family protein  25.99 
 
 		 462 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1529  glycoside hydrolase family 28  30 
 
 		 442 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  23.59 
 
 		 470 aa  120  7e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  29.43 
 
 		 431 aa  120  7e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2567  glycoside hydrolase family protein  25.94 
 
 		 474 aa  118  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  28.38 
 
 		 390 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0700  glycoside hydrolase family 28  25.73 
 
 		 509 aa  117  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  26.76 
 
 		 463 aa  114  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4228  glycoside hydrolase family protein  25.07 
 
 		 442 aa  113  9e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2125  glycoside hydrolase family 28  26.6 
 
 		 437 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2532  glycoside hydrolase family 28  29.02 
 
 		 459 aa  111  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3334  galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  28.16 
 
 		 478 aa  110  8.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  25.17 
 
 		 727 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5759  polygalacturonase  25.91 
 
 		 416 aa  107  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5359  putative polygalacturonase protein  26.5 
 
 		 454 aa  106  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071082  normal  0.281824 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  26.69 
 
 		 446 aa  106  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5903  glycoside hydrolase family 28  25.39 
 
 		 521 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.672596 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0483  glycoside hydrolase family protein  26.69 
 
 		 446 aa  105  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  25.46 
 
 		 528 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5079  Parallel beta-helix repeat protein  27.41 
 
 		 454 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416725  normal  0.142328 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1580  Endopygalactorunase  31.82 
 
 		 246 aa  99  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6877  hypothetical protein  28.9 
 
 		 543 aa  88.2  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0249011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2457  glycoside hydrolase family 28  23.13 
 
 		 508 aa  82  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140372  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0152  glycoside hydrolase family 28  29.53 
 
 		 602 aa  79.3  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1884  glycoside hydrolase family protein  40.83 
 
 		 606 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0153  glycoside hydrolase family 28  26.06 
 
 		 604 aa  78.2  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.90665  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46668  predicted protein  25 
 
 		 451 aa  76.3  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000812304  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3754  Endopygalactorunase  20.93 
 
 		 983 aa  75.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0200  glycoside hydrolase family 28  28.9 
 
 		 605 aa  73.9  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1410  Fibronectin type III domain protein  23.46 
 
 		 659 aa  66.6  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3310  hypothetical protein  27.16 
 
 		 518 aa  65.1  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1489  Polygalacturonase/Pectinase  24.23 
 
 		 544 aa  65.1  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3321  glycoside hydrolase family 28  24.49 
 
 		 402 aa  64.7  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2862  Fibronectin type III domain protein  23.41 
 
 		 659 aa  64.3  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1396  Endopygalactorunase-like protein  35.71 
 
 		 642 aa  62  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0127  PKD domain containing protein  26.99 
 
 		 931 aa  61.6  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00188311 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3221  glycoside hydrolase family protein  28.87 
 
 		 665 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.301284  normal  0.0580699 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1756  exo-poly-galacturonase signal peptide protein  41.3 
 
 		 702 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0518728  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0989  glycoside hydrolase family 28  23.29 
 
 		 402 aa  60.1  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16052  predicted protein  22.82 
 
 		 271 aa  59.7  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032394  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4603  glycoside hydrolase family protein  28.17 
 
 		 665 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.039982  hitchhiker  0.000685896 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0125  Endopygalactorunase-like protein  33.9 
 
 		 633 aa  57.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300956  normal  0.0208856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3629  glycoside hydrolase family 28  21.67 
 
 		 488 aa  57.4  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4904  glycoside hydrolase family protein  27.46 
 
 		 665 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1922  Endopygalactorunase-like protein  27.04 
 
 		 669 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.449199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7020  hypothetical protein  25.61 
 
 		 449 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361507  normal  0.742896 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5453  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 664 aa  54.7  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.34591 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0124  Endopygalactorunase-like protein  33.33 
 
 		 641 aa  53.9  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.778802  normal  0.020189 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3862  hypothetical protein  46.38 
 
 		 582 aa  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00590592  normal  0.508788 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08761  Exo-polygalacturonasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ASG9]  24.34 
 
 		 434 aa  52.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.987401 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4858  glycoside hydrolase family 28  26.24 
 
 		 671 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0653045  normal  0.492882 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0833  polygalacturonase transmembrane protein  23.94 
 
 		 680 aa  49.7  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00798361 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3618  hypothetical protein  37.88 
 
 		 547 aa  49.3  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.216975 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6273  hypothetical protein  40.79 
 
 		 503 aa  48.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1711  endopygalactorunase-like protein  22.39 
 
 		 620 aa  46.6  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02590  polygalacturonase, putative  21.43 
 
 		 478 aa  44.3  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1183  hypothetical protein  40.74 
 
 		 632 aa  43.9  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0432  hypothetical protein  48.78 
 
 		 495 aa  43.9  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.435778  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3960  polygalacturonase  28.12 
 
 		 532 aa  43.5  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0761528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>