96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3217 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3217  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 491 aa  1020    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  34.32 
 
 		 479 aa  238  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  31.72 
 
 		 444 aa  211  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3371  glycoside hydrolase family 28  31.12 
 
 		 444 aa  207  5e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0972  glycoside hydrolase family 28  30.61 
 
 		 448 aa  200  6e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3977  glycoside hydrolase family 28  31.58 
 
 		 543 aa  187  4e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.722531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  30.32 
 
 		 518 aa  173  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  30.95 
 
 		 447 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5759  polygalacturonase  27.16 
 
 		 416 aa  164  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  29.27 
 
 		 443 aa  164  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  30.23 
 
 		 492 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5359  putative polygalacturonase protein  28.71 
 
 		 454 aa  163  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071082  normal  0.281824 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5079  Parallel beta-helix repeat protein  27.07 
 
 		 454 aa  162  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416725  normal  0.142328 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  30.57 
 
 		 524 aa  157  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  34.73 
 
 		 530 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  29 
 
 		 542 aa  155  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  27.35 
 
 		 475 aa  153  8e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  29.71 
 
 		 522 aa  147  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  30.71 
 
 		 509 aa  146  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0700  glycoside hydrolase family 28  30.17 
 
 		 509 aa  145  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  32.37 
 
 		 431 aa  144  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  28.76 
 
 		 559 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2532  glycoside hydrolase family 28  33.81 
 
 		 459 aa  141  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  25.26 
 
 		 541 aa  136  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5374  glycoside hydrolase family 28  32.57 
 
 		 442 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  27.94 
 
 		 865 aa  134  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  27.2 
 
 		 518 aa  134  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  30.85 
 
 		 455 aa  133  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4285  glycoside hydrolase family protein  29.44 
 
 		 543 aa  133  9e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4228  glycoside hydrolase family protein  27.53 
 
 		 442 aa  131  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  27.34 
 
 		 448 aa  127  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1581  glycoside hydrolase family 28  27.71 
 
 		 489 aa  127  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0871574 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  26.35 
 
 		 560 aa  126  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  26.62 
 
 		 463 aa  125  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  25.8 
 
 		 551 aa  124  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0230  glycoside hydrolase family protein  28.07 
 
 		 462 aa  122  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2567  glycoside hydrolase family protein  24.6 
 
 		 474 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16052  predicted protein  25.8 
 
 		 271 aa  118  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032394  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3719  exo-poly-alpha-D-galacturonosidase precursor  25.86 
 
 		 537 aa  118  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  31.85 
 
 		 467 aa  116  7.999999999999999e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  26.95 
 
 		 390 aa  116  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1529  glycoside hydrolase family 28  31.03 
 
 		 442 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  26.46 
 
 		 470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  29.9 
 
 		 528 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  25.64 
 
 		 544 aa  114  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0483  glycoside hydrolase family protein  25.55 
 
 		 446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  25.55 
 
 		 446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  24.64 
 
 		 554 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  26.27 
 
 		 727 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  31.91 
 
 		 460 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1170  glycoside hydrolase family protein  25.78 
 
 		 548 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  31.56 
 
 		 460 aa  106  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  31.21 
 
 		 460 aa  103  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6877  hypothetical protein  30.39 
 
 		 543 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0249011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2457  glycoside hydrolase family 28  25.29 
 
 		 508 aa  99.8  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140372  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5903  glycoside hydrolase family 28  27.15 
 
 		 521 aa  97.1  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.672596 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3334  galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  24.42 
 
 		 478 aa  95.1  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4858  glycoside hydrolase family 28  27.09 
 
 		 671 aa  90.5  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0653045  normal  0.492882 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2125  glycoside hydrolase family 28  26.34 
 
 		 437 aa  88.2  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  26.56 
 
 		 649 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4603  glycoside hydrolase family protein  25.14 
 
 		 665 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.039982  hitchhiker  0.000685896 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0833  polygalacturonase transmembrane protein  23.18 
 
 		 680 aa  84  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00798361 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3221  glycoside hydrolase family protein  28.48 
 
 		 665 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.301284  normal  0.0580699 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5453  glycoside hydrolase family protein  23.43 
 
 		 664 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.34591 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4904  glycoside hydrolase family protein  23.64 
 
 		 665 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7020  hypothetical protein  29.63 
 
 		 449 aa  74.7  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361507  normal  0.742896 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46668  predicted protein  24.23 
 
 		 451 aa  73.2  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000812304  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0152  glycoside hydrolase family 28  27.07 
 
 		 602 aa  71.6  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0200  glycoside hydrolase family 28  25.47 
 
 		 605 aa  69.3  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0153  glycoside hydrolase family 28  25.4 
 
 		 604 aa  68.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.90665  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3321  glycoside hydrolase family 28  24.73 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0989  glycoside hydrolase family 28  25.98 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1922  Endopygalactorunase-like protein  28.25 
 
 		 669 aa  65.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.449199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1580  Endopygalactorunase  39.82 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1410  Fibronectin type III domain protein  24.68 
 
 		 659 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1711  endopygalactorunase-like protein  24.48 
 
 		 620 aa  62  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3629  glycoside hydrolase family 28  26.36 
 
 		 488 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0125  Endopygalactorunase-like protein  25.58 
 
 		 633 aa  60.1  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300956  normal  0.0208856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3630  glycoside hydrolase family 28  24.54 
 
 		 513 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1884  glycoside hydrolase family protein  35.43 
 
 		 606 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2862  Fibronectin type III domain protein  23.48 
 
 		 659 aa  57.8  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3960  polygalacturonase  22.89 
 
 		 532 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0761528  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0124  Endopygalactorunase-like protein  33.33 
 
 		 641 aa  55.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.778802  normal  0.020189 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3310  hypothetical protein  26.53 
 
 		 518 aa  51.6  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09134  Rhamnogalacturonase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFQ2]  25.89 
 
 		 517 aa  51.2  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.252064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1396  Endopygalactorunase-like protein  33.63 
 
 		 642 aa  50.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230855  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1756  exo-poly-galacturonase signal peptide protein  36.59 
 
 		 702 aa  50.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0518728  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00376  polygalacturonase  24.2 
 
 		 602 aa  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0681  hypothetical protein  21.96 
 
 		 425 aa  47.8  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46492  predicted protein  20.83 
 
 		 563 aa  47  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.481419  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0880  polygalacturonase precursor (pectinase) signal peptide protein  30.11 
 
 		 531 aa  46.6  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609321  normal  0.0402395 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08327  Endo-polygalacturonasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ATQ3]  24.53 
 
 		 380 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.23769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0172  coagulation factor 5/8 type domain protein  23.18 
 
 		 685 aa  45.8  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.238557  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0127  PKD domain containing protein  27.23 
 
 		 931 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00188311 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10274  exo-polygalacturonase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06410)  24.4 
 
 		 424 aa  44.3  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3754  Endopygalactorunase  24.86 
 
 		 983 aa  43.5  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>