42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46492 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_46492  predicted protein  100 
 
 		 563 aa  1166    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.481419  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08327  Endo-polygalacturonasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ATQ3]  27.37 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.23769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  27.25 
 
 		 522 aa  74.3  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  23.58 
 
 		 467 aa  72.4  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  22.91 
 
 		 479 aa  72.8  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0989  glycoside hydrolase family 28  28.28 
 
 		 402 aa  69.7  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  24.23 
 
 		 541 aa  68.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  23.54 
 
 		 447 aa  65.9  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  27.43 
 
 		 431 aa  63.2  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  28.35 
 
 		 542 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0230  glycoside hydrolase family protein  28.02 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0700  glycoside hydrolase family 28  25.16 
 
 		 509 aa  62  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3321  glycoside hydrolase family 28  26.94 
 
 		 402 aa  62  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06656  endopolygalacturonase (Eurofung)  25.88 
 
 		 514 aa  61.6  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  22.42 
 
 		 460 aa  60.1  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  23.94 
 
 		 518 aa  60.1  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  22.67 
 
 		 460 aa  59.7  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  23.89 
 
 		 460 aa  59.3  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2532  glycoside hydrolase family 28  24.28 
 
 		 459 aa  58.5  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  24.63 
 
 		 448 aa  57.8  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3630  glycoside hydrolase family 28  26.84 
 
 		 513 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46668  predicted protein  26.78 
 
 		 451 aa  55.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000812304  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0972  glycoside hydrolase family 28  24.24 
 
 		 448 aa  54.3  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  30.77 
 
 		 554 aa  54.3  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2125  glycoside hydrolase family 28  24.78 
 
 		 437 aa  51.6  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  30.15 
 
 		 544 aa  51.2  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  28.19 
 
 		 390 aa  50.4  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  23.48 
 
 		 444 aa  50.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09134  Rhamnogalacturonase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFQ2]  23.64 
 
 		 517 aa  48.1  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.252064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3217  glycoside hydrolase family protein  20.83 
 
 		 491 aa  46.6  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08891  Exopolygalacturonase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q873X6]  24.66 
 
 		 440 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.47713 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  26.52 
 
 		 865 aa  46.2  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  24.66 
 
 		 559 aa  45.4  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  27.6 
 
 		 524 aa  45.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02590  polygalacturonase, putative  26.67 
 
 		 478 aa  44.7  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16052  predicted protein  24.46 
 
 		 271 aa  44.3  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032394  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6920  glycoside hydrolase family protein  26.52 
 
 		 458 aa  44.3  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3277  glycoside hydrolase family protein  29.35 
 
 		 458 aa  44.3  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.113275 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  24.38 
 
 		 463 aa  43.9  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  27.18 
 
 		 551 aa  43.9  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4887  glycoside hydrolase family protein  29.35 
 
 		 458 aa  44.3  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3629  glycoside hydrolase family 28  28.25 
 
 		 488 aa  43.9  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>