107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2115 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
460 aa  947    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  78.9 
 
 
467 aa  728    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  80.66 
 
 
460 aa  776    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  81.1 
 
 
460 aa  776    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  36.13 
 
 
447 aa  219  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  36.52 
 
 
390 aa  214  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  35.03 
 
 
431 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3334  galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  34.16 
 
 
478 aa  197  4.0000000000000005e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  33.17 
 
 
541 aa  196  6e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  33.11 
 
 
542 aa  193  6e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  31.39 
 
 
522 aa  192  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2125  glycoside hydrolase family 28  32.54 
 
 
437 aa  188  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  28.72 
 
 
560 aa  183  7e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  29.44 
 
 
554 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  31.23 
 
 
518 aa  179  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  29.57 
 
 
551 aa  177  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  30.46 
 
 
544 aa  175  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2532  glycoside hydrolase family 28  32.89 
 
 
459 aa  166  9e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0230  glycoside hydrolase family protein  28.06 
 
 
462 aa  165  1.0000000000000001e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0700  glycoside hydrolase family 28  29.33 
 
 
509 aa  154  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  29.86 
 
 
865 aa  152  8.999999999999999e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3321  glycoside hydrolase family 28  37.29 
 
 
402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4285  glycoside hydrolase family protein  29.54 
 
 
543 aa  147  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0989  glycoside hydrolase family 28  36.63 
 
 
402 aa  147  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3629  glycoside hydrolase family 28  31.25 
 
 
488 aa  146  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  28.71 
 
 
518 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  31.03 
 
 
463 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2567  glycoside hydrolase family protein  28.35 
 
 
474 aa  145  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  28.92 
 
 
470 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  29.16 
 
 
475 aa  139  8.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7020  hypothetical protein  31.31 
 
 
449 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361507  normal  0.742896 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  27.4 
 
 
727 aa  136  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  32.4 
 
 
530 aa  133  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1489  Polygalacturonase/Pectinase  31.66 
 
 
544 aa  133  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  31 
 
 
448 aa  133  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  29.1 
 
 
528 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5903  glycoside hydrolase family 28  27.7 
 
 
521 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.672596 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3960  polygalacturonase  29.62 
 
 
532 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0761528  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  29.95 
 
 
455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00376  polygalacturonase  30.75 
 
 
602 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2457  glycoside hydrolase family 28  28.18 
 
 
508 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140372  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  29.46 
 
 
446 aa  125  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0483  glycoside hydrolase family protein  28.87 
 
 
446 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0880  polygalacturonase precursor (pectinase) signal peptide protein  30.86 
 
 
531 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609321  normal  0.0402395 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  32.08 
 
 
509 aa  117  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3630  glycoside hydrolase family 28  29.05 
 
 
513 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370863  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  33.23 
 
 
524 aa  116  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  27.94 
 
 
443 aa  114  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0152  glycoside hydrolase family 28  30.9 
 
 
602 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5374  glycoside hydrolase family 28  35.39 
 
 
442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1628  polygalacturonase precursor  26.69 
 
 
544 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1570  glycoside hydrolase family protein  26.9 
 
 
544 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46668  predicted protein  27.16 
 
 
451 aa  112  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000812304  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1410  Fibronectin type III domain protein  25.77 
 
 
659 aa  111  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  31 
 
 
559 aa  110  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0200  glycoside hydrolase family 28  28.82 
 
 
605 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  26.03 
 
 
479 aa  107  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2862  Fibronectin type III domain protein  25.42 
 
 
659 aa  107  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4228  glycoside hydrolase family protein  26.72 
 
 
442 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1529  glycoside hydrolase family 28  28.26 
 
 
442 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604094  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3217  glycoside hydrolase family protein  31.21 
 
 
491 aa  103  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1884  glycoside hydrolase family protein  25.29 
 
 
606 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185674  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6920  glycoside hydrolase family protein  26.2 
 
 
458 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0972  glycoside hydrolase family 28  28.47 
 
 
448 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1581  glycoside hydrolase family 28  27.94 
 
 
489 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0871574 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4887  glycoside hydrolase family protein  26.09 
 
 
458 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3277  glycoside hydrolase family protein  26.09 
 
 
458 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.113275 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3977  glycoside hydrolase family 28  27.03 
 
 
543 aa  101  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.722531  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  25.84 
 
 
492 aa  98.6  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1756  exo-poly-galacturonase signal peptide protein  26.26 
 
 
702 aa  98.2  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0518728  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0153  glycoside hydrolase family 28  27.43 
 
 
604 aa  98.2  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.90665  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5982  glycoside hydrolase family protein  26.2 
 
 
716 aa  94.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.113133 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5664  glycoside hydrolase family protein  25.19 
 
 
725 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6029  glycoside hydrolase family protein  25.19 
 
 
725 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0491802  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  23.35 
 
 
444 aa  87.8  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3371  glycoside hydrolase family 28  24.36 
 
 
444 aa  82.8  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  25.71 
 
 
649 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6877  hypothetical protein  27.39 
 
 
543 aa  83.2  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0249011  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1922  Endopygalactorunase-like protein  31.33 
 
 
669 aa  81.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.449199  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1580  Endopygalactorunase  30.21 
 
 
246 aa  75.1  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5079  Parallel beta-helix repeat protein  25.86 
 
 
454 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416725  normal  0.142328 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5759  polygalacturonase  24.81 
 
 
416 aa  69.7  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3719  exo-poly-alpha-D-galacturonosidase precursor  24.33 
 
 
537 aa  67.8  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5359  putative polygalacturonase protein  25.61 
 
 
454 aa  67.4  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071082  normal  0.281824 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10274  exo-polygalacturonase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06410)  24 
 
 
424 aa  63.9  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1170  glycoside hydrolase family protein  25.61 
 
 
548 aa  64.3  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.591559 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08761  Exo-polygalacturonasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ASG9]  28.26 
 
 
434 aa  61.2  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.987401 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08891  Exopolygalacturonase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q873X6]  22.82 
 
 
440 aa  61.6  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.47713 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16052  predicted protein  29.03 
 
 
271 aa  60.8  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032394  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46492  predicted protein  23.89 
 
 
563 aa  59.3  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.481419  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0127  PKD domain containing protein  27.65 
 
 
931 aa  58.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00188311 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0833  polygalacturonase transmembrane protein  25.76 
 
 
680 aa  57  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00798361 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4858  glycoside hydrolase family 28  29.59 
 
 
671 aa  57  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0653045  normal  0.492882 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0125  Endopygalactorunase-like protein  28.76 
 
 
633 aa  57  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300956  normal  0.0208856 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08327  Endo-polygalacturonasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ATQ3]  21.26 
 
 
380 aa  55.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.23769  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1396  Endopygalactorunase-like protein  39.39 
 
 
642 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230855  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04372  Endo-polygalacturonase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT2]  26.5 
 
 
361 aa  54.7  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.217421 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09045  Exo-polygalacturonasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARN5]  22.73 
 
 
449 aa  53.9  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787834  normal  0.693442 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06656  endopolygalacturonase (Eurofung)  25 
 
 
514 aa  53.9  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03389  xylogalacturonan hydrolase (Eurofung)  22.88 
 
 
399 aa  53.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.176918  normal  0.718699 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>