111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2736 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 518 aa  1071    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0700  glycoside hydrolase family 28  49.51 
 
 		 509 aa  525  1e-148  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  38.99 
 
 		 447 aa  318  1e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  35.7 
 
 		 431 aa  272  9e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2532  glycoside hydrolase family 28  34.98 
 
 		 459 aa  263  6e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  31.9 
 
 		 541 aa  236  1.0000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  32.64 
 
 		 522 aa  222  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  32.15 
 
 		 554 aa  222  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  30.16 
 
 		 544 aa  209  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0230  glycoside hydrolase family protein  31.02 
 
 		 462 aa  207  3e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  33.25 
 
 		 542 aa  206  9e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  31.09 
 
 		 551 aa  205  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  29.32 
 
 		 560 aa  196  7e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  29.98 
 
 		 865 aa  194  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  31 
 
 		 475 aa  192  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4285  glycoside hydrolase family protein  29.63 
 
 		 543 aa  183  8.000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2567  glycoside hydrolase family protein  29.26 
 
 		 474 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  31.23 
 
 		 460 aa  179  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  28.85 
 
 		 470 aa  177  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  32.77 
 
 		 463 aa  177  6e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  27.85 
 
 		 727 aa  176  9e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  31.3 
 
 		 460 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  31.14 
 
 		 460 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46668  predicted protein  30 
 
 		 451 aa  171  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000812304  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  29.26 
 
 		 448 aa  165  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  30.02 
 
 		 528 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  31.3 
 
 		 467 aa  164  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  30.21 
 
 		 390 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0483  glycoside hydrolase family protein  29.54 
 
 		 446 aa  157  6e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  29.54 
 
 		 446 aa  156  9e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2125  glycoside hydrolase family 28  29.05 
 
 		 437 aa  154  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4228  glycoside hydrolase family protein  29.11 
 
 		 442 aa  146  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5374  glycoside hydrolase family 28  31.76 
 
 		 442 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  31.65 
 
 		 455 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3334  galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  29.44 
 
 		 478 aa  137  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5903  glycoside hydrolase family 28  29.1 
 
 		 521 aa  136  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.672596 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3217  glycoside hydrolase family protein  27.2 
 
 		 491 aa  134  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1529  glycoside hydrolase family 28  30.16 
 
 		 442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  25.9 
 
 		 479 aa  130  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3321  glycoside hydrolase family 28  30.16 
 
 		 402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  29.78 
 
 		 443 aa  126  8.000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1884  glycoside hydrolase family protein  25.82 
 
 		 606 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  25.67 
 
 		 518 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0200  glycoside hydrolase family 28  26.78 
 
 		 605 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3977  glycoside hydrolase family 28  26.93 
 
 		 543 aa  121  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.722531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1410  Fibronectin type III domain protein  25.6 
 
 		 659 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0989  glycoside hydrolase family 28  29.37 
 
 		 402 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0153  glycoside hydrolase family 28  26.68 
 
 		 604 aa  118  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.90665  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2862  Fibronectin type III domain protein  25.6 
 
 		 659 aa  118  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2457  glycoside hydrolase family 28  24.55 
 
 		 508 aa  117  6.9999999999999995e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140372  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0152  glycoside hydrolase family 28  24.66 
 
 		 602 aa  114  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  25.11 
 
 		 524 aa  110  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4858  glycoside hydrolase family 28  37.87 
 
 		 671 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0653045  normal  0.492882 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0833  polygalacturonase transmembrane protein  39.53 
 
 		 680 aa  106  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00798361 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0972  glycoside hydrolase family 28  27.2 
 
 		 448 aa  105  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  24.28 
 
 		 444 aa  105  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  26.3 
 
 		 492 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  23.59 
 
 		 509 aa  98.6  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5453  glycoside hydrolase family protein  35.5 
 
 		 664 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.34591 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3630  glycoside hydrolase family 28  25.38 
 
 		 513 aa  96.7  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4904  glycoside hydrolase family protein  34.91 
 
 		 665 aa  96.3  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4603  glycoside hydrolase family protein  34.91 
 
 		 665 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.039982  hitchhiker  0.000685896 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  22.92 
 
 		 530 aa  95.9  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5759  polygalacturonase  28.07 
 
 		 416 aa  94.7  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7020  hypothetical protein  28.43 
 
 		 449 aa  94  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361507  normal  0.742896 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3221  glycoside hydrolase family protein  33.73 
 
 		 665 aa  93.6  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.301284  normal  0.0580699 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3960  polygalacturonase  27.43 
 
 		 532 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0761528  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5079  Parallel beta-helix repeat protein  24.83 
 
 		 454 aa  90.1  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416725  normal  0.142328 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5359  putative polygalacturonase protein  25.75 
 
 		 454 aa  89.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071082  normal  0.281824 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3371  glycoside hydrolase family 28  24.91 
 
 		 444 aa  89.7  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1489  Polygalacturonase/Pectinase  24.75 
 
 		 544 aa  87.4  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3629  glycoside hydrolase family 28  28.12 
 
 		 488 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  24.73 
 
 		 559 aa  83.2  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00376  polygalacturonase  24.7 
 
 		 602 aa  82  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1581  glycoside hydrolase family 28  24.08 
 
 		 489 aa  80.9  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0871574 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1756  exo-poly-galacturonase signal peptide protein  23.71 
 
 		 702 aa  80.5  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0518728  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0880  polygalacturonase precursor (pectinase) signal peptide protein  27.25 
 
 		 531 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609321  normal  0.0402395 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16052  predicted protein  28.14 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032394  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  23.75 
 
 		 649 aa  73.6  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1170  glycoside hydrolase family protein  23.33 
 
 		 548 aa  69.3  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3719  exo-poly-alpha-D-galacturonosidase precursor  24.32 
 
 		 537 aa  68.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4887  glycoside hydrolase family protein  27.24 
 
 		 458 aa  67  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3277  glycoside hydrolase family protein  27.24 
 
 		 458 aa  67  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.113275 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6920  glycoside hydrolase family protein  27.24 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1570  glycoside hydrolase family protein  25.14 
 
 		 544 aa  64.3  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08327  Endo-polygalacturonasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ATQ3]  25.26 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.23769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1628  polygalacturonase precursor  25.14 
 
 		 544 aa  63.5  0.000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08891  Exopolygalacturonase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q873X6]  23.47 
 
 		 440 aa  61.2  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.47713 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04372  Endo-polygalacturonase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT2]  28.25 
 
 		 361 aa  59.7  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.217421 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5982  glycoside hydrolase family protein  25.21 
 
 		 716 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.113133 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46492  predicted protein  23.94 
 
 		 563 aa  59.7  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.481419  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0124  Endopygalactorunase-like protein  26.32 
 
 		 641 aa  56.6  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.778802  normal  0.020189 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3754  Endopygalactorunase  22.47 
 
 		 983 aa  56.6  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0125  Endopygalactorunase-like protein  32.84 
 
 		 633 aa  54.7  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300956  normal  0.0208856 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5664  glycoside hydrolase family protein  24.36 
 
 		 725 aa  53.9  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6029  glycoside hydrolase family protein  24.36 
 
 		 725 aa  53.9  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0491802  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2384  hypothetical protein  49.02 
 
 		 415 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.458902  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6877  hypothetical protein  20.89 
 
 		 543 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0249011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1396  Endopygalactorunase-like protein  25.32 
 
 		 642 aa  51.2  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230855  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08761  Exo-polygalacturonasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ASG9]  26.48 
 
 		 434 aa  50.1  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.987401 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>