90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1170 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1170  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 548 aa  1093    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3719  exo-poly-alpha-D-galacturonosidase precursor  54.75 
 
 		 537 aa  503  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  30.06 
 
 		 649 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  29.29 
 
 		 524 aa  191  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  27.8 
 
 		 492 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  29.16 
 
 		 509 aa  170  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3977  glycoside hydrolase family 28  24.82 
 
 		 543 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.722531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  28.73 
 
 		 447 aa  155  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1581  glycoside hydrolase family 28  25.75 
 
 		 489 aa  155  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0871574 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  26.54 
 
 		 530 aa  150  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  27.85 
 
 		 518 aa  147  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  25.55 
 
 		 475 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  26.71 
 
 		 559 aa  139  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  27.46 
 
 		 542 aa  136  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  27.05 
 
 		 522 aa  135  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  27.07 
 
 		 479 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  27.97 
 
 		 541 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  26.92 
 
 		 544 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  27.29 
 
 		 551 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  27.75 
 
 		 463 aa  125  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3754  Endopygalactorunase  24.28 
 
 		 983 aa  124  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3217  glycoside hydrolase family protein  26.16 
 
 		 491 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  27.77 
 
 		 554 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  27.34 
 
 		 431 aa  116  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4285  glycoside hydrolase family protein  28.99 
 
 		 543 aa  116  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  23.6 
 
 		 443 aa  113  9e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  27.92 
 
 		 865 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3334  galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  28.09 
 
 		 478 aa  111  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  25.38 
 
 		 560 aa  110  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2532  glycoside hydrolase family 28  28.74 
 
 		 459 aa  109  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0230  glycoside hydrolase family protein  26.54 
 
 		 462 aa  107  4e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  27.03 
 
 		 470 aa  105  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  26.39 
 
 		 390 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0972  glycoside hydrolase family 28  26.77 
 
 		 448 aa  102  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2567  glycoside hydrolase family protein  27.6 
 
 		 474 aa  102  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3371  glycoside hydrolase family 28  24.22 
 
 		 444 aa  101  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  25.34 
 
 		 455 aa  94.7  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0483  glycoside hydrolase family protein  22.7 
 
 		 446 aa  92.8  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  23.09 
 
 		 446 aa  92.4  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  23.64 
 
 		 444 aa  90.5  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  23.23 
 
 		 448 aa  88.6  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  24.89 
 
 		 528 aa  87.8  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  25.72 
 
 		 460 aa  85.5  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  23.56 
 
 		 518 aa  82  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  23.31 
 
 		 460 aa  82  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  23.31 
 
 		 460 aa  80.9  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5759  polygalacturonase  25.06 
 
 		 416 aa  79.7  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1410  Fibronectin type III domain protein  24.27 
 
 		 659 aa  79  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0700  glycoside hydrolase family 28  22.59 
 
 		 509 aa  79  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  23.48 
 
 		 467 aa  78.6  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5903  glycoside hydrolase family 28  25.86 
 
 		 521 aa  77.4  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.672596 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2862  Fibronectin type III domain protein  22.89 
 
 		 659 aa  76.6  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  26.24 
 
 		 727 aa  74.3  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5359  putative polygalacturonase protein  27.94 
 
 		 454 aa  73.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071082  normal  0.281824 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2457  glycoside hydrolase family 28  26.06 
 
 		 508 aa  71.6  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140372  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5079  Parallel beta-helix repeat protein  26.82 
 
 		 454 aa  71.2  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416725  normal  0.142328 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5374  glycoside hydrolase family 28  25.48 
 
 		 442 aa  70.9  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0153  glycoside hydrolase family 28  25 
 
 		 604 aa  69.7  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.90665  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0200  glycoside hydrolase family 28  23.26 
 
 		 605 aa  69.3  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4228  glycoside hydrolase family protein  23.18 
 
 		 442 aa  66.6  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46668  predicted protein  23.2 
 
 		 451 aa  63.5  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000812304  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1580  Endopygalactorunase  32.54 
 
 		 246 aa  63.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1884  glycoside hydrolase family protein  28.31 
 
 		 606 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0152  glycoside hydrolase family 28  23.9 
 
 		 602 aa  61.2  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4858  glycoside hydrolase family 28  24.93 
 
 		 671 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0653045  normal  0.492882 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2125  glycoside hydrolase family 28  23.92 
 
 		 437 aa  59.7  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0125  Endopygalactorunase-like protein  27.38 
 
 		 633 aa  58.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300956  normal  0.0208856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6877  hypothetical protein  22.86 
 
 		 543 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0249011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1529  glycoside hydrolase family 28  22.35 
 
 		 442 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1922  Endopygalactorunase-like protein  36.97 
 
 		 669 aa  54.3  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.449199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1396  Endopygalactorunase-like protein  55.93 
 
 		 642 aa  53.5  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0124  Endopygalactorunase-like protein  37.4 
 
 		 641 aa  53.5  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.778802  normal  0.020189 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3618  hypothetical protein  61.9 
 
 		 547 aa  50.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.216975 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0127  PKD domain containing protein  35.59 
 
 		 931 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00188311 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1756  exo-poly-galacturonase signal peptide protein  22.97 
 
 		 702 aa  50.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0518728  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4603  glycoside hydrolase family protein  24.31 
 
 		 665 aa  47.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.039982  hitchhiker  0.000685896 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  67.44 
 
 		 856 aa  46.6  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5453  glycoside hydrolase family protein  24.58 
 
 		 664 aa  46.2  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.34591 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5633  hypothetical protein  39.56 
 
 		 866 aa  45.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.175065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3630  glycoside hydrolase family 28  31.82 
 
 		 513 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  44.44 
 
 		 582 aa  44.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0833  polygalacturonase transmembrane protein  24.02 
 
 		 680 aa  45.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00798361 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49400  Secreted mannuronan C5-epimerase-like protein  72.09 
 
 		 532 aa  44.7  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3221  glycoside hydrolase family protein  26.81 
 
 		 665 aa  44.3  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.301284  normal  0.0580699 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6273  hypothetical protein  28.4 
 
 		 503 aa  43.9  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1183  hypothetical protein  45 
 
 		 632 aa  43.5  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  69.77 
 
 		 1403 aa  43.5  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  69.77 
 
 		 998 aa  43.5  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  69.77 
 
 		 998 aa  43.5  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00779  exo-beta-1,3-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11980)  49.02 
 
 		 781 aa  43.5  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.913287  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>