81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5079 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5359  putative polygalacturonase protein  88.11 
 
 		 454 aa  811    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071082  normal  0.281824 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5079  Parallel beta-helix repeat protein  100 
 
 		 454 aa  912    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416725  normal  0.142328 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5759  polygalacturonase  65.22 
 
 		 416 aa  560  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  37.21 
 
 		 444 aa  296  4e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0972  glycoside hydrolase family 28  37.06 
 
 		 448 aa  291  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3371  glycoside hydrolase family 28  35.78 
 
 		 444 aa  276  7e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  32.21 
 
 		 479 aa  187  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3217  glycoside hydrolase family protein  27.07 
 
 		 491 aa  162  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  35.97 
 
 		 431 aa  151  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2532  glycoside hydrolase family 28  36.96 
 
 		 459 aa  139  7e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  27.25 
 
 		 443 aa  134  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  29.93 
 
 		 447 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16052  predicted protein  29.26 
 
 		 271 aa  123  5e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032394  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  29.2 
 
 		 509 aa  123  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  29.58 
 
 		 865 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  25.51 
 
 		 524 aa  119  9e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4285  glycoside hydrolase family protein  31.73 
 
 		 543 aa  115  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  24.78 
 
 		 522 aa  112  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  29.03 
 
 		 541 aa  111  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3977  glycoside hydrolase family 28  23.91 
 
 		 543 aa  107  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.722531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  27.69 
 
 		 518 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  24.85 
 
 		 530 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  25.86 
 
 		 492 aa  104  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  29.08 
 
 		 446 aa  104  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0483  glycoside hydrolase family protein  29.08 
 
 		 446 aa  103  6e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  29.19 
 
 		 470 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5374  glycoside hydrolase family 28  28.57 
 
 		 442 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  25.4 
 
 		 542 aa  100  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1581  glycoside hydrolase family 28  24.07 
 
 		 489 aa  100  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0871574 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  26.16 
 
 		 559 aa  99.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2125  glycoside hydrolase family 28  28.1 
 
 		 437 aa  98.2  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  27.3 
 
 		 463 aa  97.4  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  27.07 
 
 		 528 aa  96.3  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  23.67 
 
 		 554 aa  96.3  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  25.42 
 
 		 544 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0700  glycoside hydrolase family 28  25.41 
 
 		 509 aa  94  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  24.58 
 
 		 455 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5903  glycoside hydrolase family 28  25.56 
 
 		 521 aa  90.9  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.672596 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  24.43 
 
 		 551 aa  90.9  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1529  glycoside hydrolase family 28  25.19 
 
 		 442 aa  90.9  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  23.99 
 
 		 475 aa  90.9  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  24.83 
 
 		 518 aa  90.1  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4228  glycoside hydrolase family protein  25.09 
 
 		 442 aa  88.2  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2567  glycoside hydrolase family protein  25.59 
 
 		 474 aa  87.4  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  26.09 
 
 		 727 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  25.08 
 
 		 560 aa  85.9  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46668  predicted protein  25.6 
 
 		 451 aa  83.6  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000812304  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  26.62 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1580  Endopygalactorunase  24.49 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3334  galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  25.19 
 
 		 478 aa  79.7  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  26.55 
 
 		 460 aa  77.4  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  28.04 
 
 		 467 aa  76.6  0.0000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  23.49 
 
 		 448 aa  76.3  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  26.21 
 
 		 460 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3221  glycoside hydrolase family protein  31.11 
 
 		 665 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.301284  normal  0.0580699 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0230  glycoside hydrolase family protein  25.41 
 
 		 462 aa  72.4  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  25.86 
 
 		 460 aa  71.2  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6877  hypothetical protein  27.11 
 
 		 543 aa  70.1  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0249011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2457  glycoside hydrolase family 28  23.71 
 
 		 508 aa  70.1  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140372  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4603  glycoside hydrolase family protein  30.88 
 
 		 665 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.039982  hitchhiker  0.000685896 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3719  exo-poly-alpha-D-galacturonosidase precursor  25.58 
 
 		 537 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0833  polygalacturonase transmembrane protein  29.01 
 
 		 680 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00798361 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5453  glycoside hydrolase family protein  27.96 
 
 		 664 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.34591 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4904  glycoside hydrolase family protein  29.38 
 
 		 665 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4858  glycoside hydrolase family 28  27.74 
 
 		 671 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0653045  normal  0.492882 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3630  glycoside hydrolase family 28  25.4 
 
 		 513 aa  63.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1170  glycoside hydrolase family protein  25.93 
 
 		 548 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7020  hypothetical protein  24.09 
 
 		 449 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361507  normal  0.742896 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  21.64 
 
 		 649 aa  56.6  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3629  glycoside hydrolase family 28  23.26 
 
 		 488 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1711  endopygalactorunase-like protein  21.32 
 
 		 620 aa  53.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3310  hypothetical protein  21.12 
 
 		 518 aa  52.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0989  glycoside hydrolase family 28  22.13 
 
 		 402 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6920  glycoside hydrolase family protein  22.55 
 
 		 458 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3321  glycoside hydrolase family 28  22.13 
 
 		 402 aa  51.6  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4887  glycoside hydrolase family protein  22.32 
 
 		 458 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3277  glycoside hydrolase family protein  22.32 
 
 		 458 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.113275 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0124  Endopygalactorunase-like protein  25.33 
 
 		 641 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.778802  normal  0.020189 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0125  Endopygalactorunase-like protein  31.73 
 
 		 633 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300956  normal  0.0208856 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1396  Endopygalactorunase-like protein  33.04 
 
 		 642 aa  44.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230855  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08891  Exopolygalacturonase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q873X6]  25.88 
 
 		 440 aa  43.5  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.47713 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>