92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3629 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3629  glycoside hydrolase family 28  100 
 
 		 488 aa  978    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3630  glycoside hydrolase family 28  51.32 
 
 		 513 aa  452  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7020  hypothetical protein  39.72 
 
 		 449 aa  273  6e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361507  normal  0.742896 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3321  glycoside hydrolase family 28  40.49 
 
 		 402 aa  256  6e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0989  glycoside hydrolase family 28  39.85 
 
 		 402 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0880  polygalacturonase precursor (pectinase) signal peptide protein  34.81 
 
 		 531 aa  229  9e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609321  normal  0.0402395 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1489  Polygalacturonase/Pectinase  34.76 
 
 		 544 aa  217  5e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3960  polygalacturonase  33.61 
 
 		 532 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0761528  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00376  polygalacturonase  32.45 
 
 		 602 aa  196  6e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1570  glycoside hydrolase family protein  32.27 
 
 		 544 aa  187  3e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1628  polygalacturonase precursor  31.54 
 
 		 544 aa  181  2e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  31.25 
 
 		 460 aa  146  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5982  glycoside hydrolase family protein  27.09 
 
 		 716 aa  146  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.113133 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5664  glycoside hydrolase family protein  27.47 
 
 		 725 aa  143  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6029  glycoside hydrolase family protein  27.47 
 
 		 725 aa  143  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0491802  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  35.97 
 
 		 467 aa  143  9e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  29.88 
 
 		 460 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  29.63 
 
 		 460 aa  141  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3334  galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  31.58 
 
 		 478 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  29.62 
 
 		 390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  28.3 
 
 		 447 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  27.1 
 
 		 541 aa  103  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46668  predicted protein  26.71 
 
 		 451 aa  97.1  6e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000812304  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  30.08 
 
 		 431 aa  95.9  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0700  glycoside hydrolase family 28  30.97 
 
 		 509 aa  93.6  8e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  24.01 
 
 		 448 aa  88.2  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2532  glycoside hydrolase family 28  26.06 
 
 		 459 aa  86.7  8e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  28.12 
 
 		 518 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2125  glycoside hydrolase family 28  27 
 
 		 437 aa  85.1  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  29.2 
 
 		 475 aa  82.8  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04250  endopolygalacturonase  36.69 
 
 		 135 aa  82  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  22.77 
 
 		 542 aa  80.9  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 522 aa  80.1  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  28.87 
 
 		 463 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  25.15 
 
 		 479 aa  78.2  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  33.99 
 
 		 560 aa  74.7  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  22.26 
 
 		 446 aa  72.4  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0483  glycoside hydrolase family protein  22.26 
 
 		 446 aa  72.4  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2567  glycoside hydrolase family protein  28.09 
 
 		 474 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2457  glycoside hydrolase family 28  29.41 
 
 		 508 aa  70.9  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140372  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1529  glycoside hydrolase family 28  27.14 
 
 		 442 aa  70.9  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  22.71 
 
 		 470 aa  70.5  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  29.7 
 
 		 554 aa  68.2  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06656  endopolygalacturonase (Eurofung)  25.7 
 
 		 514 aa  68.2  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  24.85 
 
 		 544 aa  68.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  23.77 
 
 		 551 aa  67.8  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  25.62 
 
 		 524 aa  67.4  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4228  glycoside hydrolase family protein  25.59 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  28.65 
 
 		 455 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4858  glycoside hydrolase family 28  32.05 
 
 		 671 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0653045  normal  0.492882 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3217  glycoside hydrolase family protein  26.36 
 
 		 491 aa  61.6  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0152  glycoside hydrolase family 28  23.3 
 
 		 602 aa  60.8  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5374  glycoside hydrolase family 28  27.59 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3277  glycoside hydrolase family protein  25.37 
 
 		 458 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.113275 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4887  glycoside hydrolase family protein  25.37 
 
 		 458 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0200  glycoside hydrolase family 28  26.18 
 
 		 605 aa  59.7  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0230  glycoside hydrolase family protein  28.32 
 
 		 462 aa  59.3  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  24.55 
 
 		 865 aa  58.9  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4603  glycoside hydrolase family protein  30.13 
 
 		 665 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.039982  hitchhiker  0.000685896 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3221  glycoside hydrolase family protein  29.3 
 
 		 665 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.301284  normal  0.0580699 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16052  predicted protein  27.68 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032394  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08761  Exo-polygalacturonasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ASG9]  30.19 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.987401 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1884  glycoside hydrolase family protein  24.77 
 
 		 606 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  21.2 
 
 		 518 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  31.75 
 
 		 727 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4904  glycoside hydrolase family protein  27.39 
 
 		 665 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1410  Fibronectin type III domain protein  28 
 
 		 659 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5079  Parallel beta-helix repeat protein  23.26 
 
 		 454 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416725  normal  0.142328 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09045  Exo-polygalacturonasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARN5]  27.32 
 
 		 449 aa  55.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787834  normal  0.693442 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2862  Fibronectin type III domain protein  28.16 
 
 		 659 aa  55.1  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0833  polygalacturonase transmembrane protein  35.51 
 
 		 680 aa  55.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00798361 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4285  glycoside hydrolase family protein  25.45 
 
 		 543 aa  54.3  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04372  Endo-polygalacturonase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT2]  26.75 
 
 		 361 aa  53.9  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.217421 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6920  glycoside hydrolase family protein  24.88 
 
 		 458 aa  53.9  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5453  glycoside hydrolase family protein  27.56 
 
 		 664 aa  53.9  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.34591 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5359  putative polygalacturonase protein  26.83 
 
 		 454 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071082  normal  0.281824 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  23.62 
 
 		 443 aa  52.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3310  hypothetical protein  23.37 
 
 		 518 aa  52  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  24.24 
 
 		 559 aa  52  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0153  glycoside hydrolase family 28  23.1 
 
 		 604 aa  50.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.90665  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0972  glycoside hydrolase family 28  20.92 
 
 		 448 aa  50.8  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08327  Endo-polygalacturonasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ATQ3]  25.94 
 
 		 380 aa  50.4  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.23769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  22.12 
 
 		 509 aa  50.1  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1756  exo-poly-galacturonase signal peptide protein  25 
 
 		 702 aa  49.7  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0518728  normal  0.59815 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03389  xylogalacturonan hydrolase (Eurofung)  26.11 
 
 		 399 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.176918  normal  0.718699 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  23.08 
 
 		 492 aa  48.1  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  26.17 
 
 		 528 aa  47  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10274  exo-polygalacturonase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06410)  26.92 
 
 		 424 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3371  glycoside hydrolase family 28  20.26 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  18.31 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5759  polygalacturonase  23.16 
 
 		 416 aa  45.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46492  predicted protein  28.25 
 
 		 563 aa  43.5  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.481419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>