107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4088 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 522 aa  1063    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  54.49 
 
 		 542 aa  561  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  40.92 
 
 		 447 aa  353  5e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0230  glycoside hydrolase family protein  39.73 
 
 		 462 aa  338  9.999999999999999e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  36.78 
 
 		 541 aa  323  6e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4285  glycoside hydrolase family protein  32.98 
 
 		 543 aa  310  5e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  38.2 
 
 		 431 aa  309  8e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  37.71 
 
 		 554 aa  306  7e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  36.8 
 
 		 551 aa  298  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  37.36 
 
 		 544 aa  296  7e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2532  glycoside hydrolase family 28  38.34 
 
 		 459 aa  294  3e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  38.34 
 
 		 727 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  36.66 
 
 		 470 aa  278  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  35.58 
 
 		 560 aa  273  4.0000000000000004e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  40.15 
 
 		 463 aa  272  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  34.48 
 
 		 528 aa  272  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2567  glycoside hydrolase family protein  38.95 
 
 		 474 aa  268  2e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  38.1 
 
 		 865 aa  268  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  36.46 
 
 		 475 aa  267  4e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0483  glycoside hydrolase family protein  36.65 
 
 		 446 aa  248  3e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  34.76 
 
 		 446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  36.34 
 
 		 455 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5903  glycoside hydrolase family 28  32.09 
 
 		 521 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.672596 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0700  glycoside hydrolase family 28  36.93 
 
 		 509 aa  228  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  32.64 
 
 		 518 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  34.31 
 
 		 448 aa  212  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3334  galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  32.64 
 
 		 478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  31.39 
 
 		 460 aa  192  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  29.73 
 
 		 467 aa  189  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2125  glycoside hydrolase family 28  32.56 
 
 		 437 aa  187  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  29.26 
 
 		 390 aa  186  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2457  glycoside hydrolase family 28  30.32 
 
 		 508 aa  181  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140372  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  31.23 
 
 		 460 aa  179  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  30.75 
 
 		 460 aa  176  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4228  glycoside hydrolase family protein  30.39 
 
 		 442 aa  161  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3221  glycoside hydrolase family protein  26.4 
 
 		 665 aa  156  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.301284  normal  0.0580699 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  30.05 
 
 		 443 aa  155  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4858  glycoside hydrolase family 28  26.63 
 
 		 671 aa  154  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0653045  normal  0.492882 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46668  predicted protein  28.43 
 
 		 451 aa  153  8.999999999999999e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000812304  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4603  glycoside hydrolase family protein  28.65 
 
 		 665 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.039982  hitchhiker  0.000685896 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4904  glycoside hydrolase family protein  25.5 
 
 		 665 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  28.2 
 
 		 524 aa  149  9e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5453  glycoside hydrolase family protein  28.92 
 
 		 664 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.34591 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3217  glycoside hydrolase family protein  29.71 
 
 		 491 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5374  glycoside hydrolase family 28  30.29 
 
 		 442 aa  147  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0833  polygalacturonase transmembrane protein  26.14 
 
 		 680 aa  143  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00798361 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  27.15 
 
 		 444 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0972  glycoside hydrolase family 28  29.17 
 
 		 448 aa  140  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  28.74 
 
 		 479 aa  140  7.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  28.07 
 
 		 492 aa  136  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  25.84 
 
 		 509 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  30.03 
 
 		 530 aa  134  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  26.32 
 
 		 518 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0200  glycoside hydrolase family 28  28.77 
 
 		 605 aa  130  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1529  glycoside hydrolase family 28  26.67 
 
 		 442 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1884  glycoside hydrolase family protein  25.44 
 
 		 606 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0152  glycoside hydrolase family 28  28.63 
 
 		 602 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  30.62 
 
 		 559 aa  121  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5759  polygalacturonase  28.33 
 
 		 416 aa  120  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1581  glycoside hydrolase family 28  27.2 
 
 		 489 aa  120  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0871574 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1170  glycoside hydrolase family protein  26.56 
 
 		 548 aa  120  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3719  exo-poly-alpha-D-galacturonosidase precursor  27.06 
 
 		 537 aa  119  9e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2862  Fibronectin type III domain protein  27.14 
 
 		 659 aa  118  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1410  Fibronectin type III domain protein  26.75 
 
 		 659 aa  117  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3977  glycoside hydrolase family 28  26.23 
 
 		 543 aa  116  8.999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.722531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5359  putative polygalacturonase protein  25.92 
 
 		 454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071082  normal  0.281824 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3371  glycoside hydrolase family 28  25.85 
 
 		 444 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0153  glycoside hydrolase family 28  27.74 
 
 		 604 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.90665  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7020  hypothetical protein  27.58 
 
 		 449 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361507  normal  0.742896 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5079  Parallel beta-helix repeat protein  24.78 
 
 		 454 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416725  normal  0.142328 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3960  polygalacturonase  27.19 
 
 		 532 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0761528  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0989  glycoside hydrolase family 28  30.18 
 
 		 402 aa  104  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3321  glycoside hydrolase family 28  29.7 
 
 		 402 aa  99.4  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0880  polygalacturonase precursor (pectinase) signal peptide protein  28.76 
 
 		 531 aa  99  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609321  normal  0.0402395 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1489  Polygalacturonase/Pectinase  23.95 
 
 		 544 aa  95.9  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00376  polygalacturonase  25.75 
 
 		 602 aa  88.6  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6920  glycoside hydrolase family protein  25.84 
 
 		 458 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1580  Endopygalactorunase  30.48 
 
 		 246 aa  86.3  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4887  glycoside hydrolase family protein  25.6 
 
 		 458 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3277  glycoside hydrolase family protein  25.6 
 
 		 458 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.113275 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1756  exo-poly-galacturonase signal peptide protein  24.24 
 
 		 702 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0518728  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3630  glycoside hydrolase family 28  24.94 
 
 		 513 aa  84.7  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16052  predicted protein  25.74 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032394  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08891  Exopolygalacturonase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q873X6]  25.45 
 
 		 440 aa  80.9  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.47713 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3629  glycoside hydrolase family 28  25 
 
 		 488 aa  80.1  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08327  Endo-polygalacturonasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ATQ3]  24.38 
 
 		 380 aa  73.6  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.23769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46492  predicted protein  27.25 
 
 		 563 aa  73.6  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.481419  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6877  hypothetical protein  21.03 
 
 		 543 aa  71.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0249011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5982  glycoside hydrolase family protein  23.03 
 
 		 716 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.113133 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1628  polygalacturonase precursor  25.58 
 
 		 544 aa  67.4  0.0000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1711  endopygalactorunase-like protein  28.02 
 
 		 620 aa  67  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04372  Endo-polygalacturonase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT2]  27.32 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.217421 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  24.16 
 
 		 649 aa  64.3  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1570  glycoside hydrolase family protein  24.82 
 
 		 544 aa  63.9  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06656  endopolygalacturonase (Eurofung)  22.88 
 
 		 514 aa  62.8  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1922  Endopygalactorunase-like protein  39.39 
 
 		 669 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.449199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5664  glycoside hydrolase family protein  29.22 
 
 		 725 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6029  glycoside hydrolase family protein  29.22 
 
 		 725 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0491802  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0125  Endopygalactorunase-like protein  34.34 
 
 		 633 aa  58.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300956  normal  0.0208856 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1396  Endopygalactorunase-like protein  36.36 
 
 		 642 aa  58.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230855  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>