99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0717 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  100 
 
 		 559 aa  1150    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  31.66 
 
 		 518 aa  208  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  31.95 
 
 		 524 aa  206  6e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  28.48 
 
 		 509 aa  189  9e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3977  glycoside hydrolase family 28  28.96 
 
 		 543 aa  169  9e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.722531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  27.24 
 
 		 492 aa  156  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  26.94 
 
 		 530 aa  155  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  26.98 
 
 		 541 aa  150  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  32.65 
 
 		 479 aa  147  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3217  glycoside hydrolase family protein  28.76 
 
 		 491 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  27.74 
 
 		 542 aa  140  7.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1581  glycoside hydrolase family 28  24.89 
 
 		 489 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0871574 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0972  glycoside hydrolase family 28  27.38 
 
 		 448 aa  137  7.000000000000001e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  31.1 
 
 		 447 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3371  glycoside hydrolase family 28  28.04 
 
 		 444 aa  130  8.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  30.97 
 
 		 443 aa  125  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3719  exo-poly-alpha-D-galacturonosidase precursor  27.34 
 
 		 537 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  26.78 
 
 		 444 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  30.62 
 
 		 522 aa  121  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  23.83 
 
 		 551 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  29.08 
 
 		 649 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1170  glycoside hydrolase family protein  26.71 
 
 		 548 aa  116  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5374  glycoside hydrolase family 28  30.63 
 
 		 442 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  27.61 
 
 		 431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  22.64 
 
 		 544 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  31 
 
 		 460 aa  110  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  26.98 
 
 		 865 aa  110  8.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  26.73 
 
 		 475 aa  105  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  28.72 
 
 		 470 aa  103  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  29.47 
 
 		 460 aa  102  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  29.33 
 
 		 460 aa  102  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4228  glycoside hydrolase family protein  28.89 
 
 		 442 aa  100  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  27.09 
 
 		 554 aa  100  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5079  Parallel beta-helix repeat protein  26.16 
 
 		 454 aa  99.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416725  normal  0.142328 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2532  glycoside hydrolase family 28  30.9 
 
 		 459 aa  97.8  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0483  glycoside hydrolase family protein  25.91 
 
 		 446 aa  97.4  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  28.09 
 
 		 467 aa  97.4  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1529  glycoside hydrolase family 28  27.72 
 
 		 442 aa  97.1  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  25.91 
 
 		 446 aa  96.7  9e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  29.05 
 
 		 390 aa  95.1  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  29.02 
 
 		 455 aa  94  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0200  glycoside hydrolase family 28  31.3 
 
 		 605 aa  92.4  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3334  galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  25.81 
 
 		 478 aa  91.7  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  25.71 
 
 		 448 aa  88.2  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5359  putative polygalacturonase protein  25.71 
 
 		 454 aa  85.9  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071082  normal  0.281824 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0153  glycoside hydrolase family 28  31.62 
 
 		 604 aa  85.5  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.90665  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  27.8 
 
 		 463 aa  84  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0152  glycoside hydrolase family 28  30.86 
 
 		 602 aa  83.2  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  24.73 
 
 		 518 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6877  hypothetical protein  33.8 
 
 		 543 aa  83.2  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0249011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1884  glycoside hydrolase family protein  40.62 
 
 		 606 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  26.68 
 
 		 727 aa  80.9  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4285  glycoside hydrolase family protein  24.15 
 
 		 543 aa  79.7  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2457  glycoside hydrolase family 28  26.45 
 
 		 508 aa  79.3  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140372  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2567  glycoside hydrolase family protein  23.2 
 
 		 474 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5759  polygalacturonase  25.82 
 
 		 416 aa  77.8  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1580  Endopygalactorunase  27.6 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  23.94 
 
 		 560 aa  77  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  27.71 
 
 		 528 aa  77  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0700  glycoside hydrolase family 28  25.28 
 
 		 509 aa  75.9  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2125  glycoside hydrolase family 28  28.7 
 
 		 437 aa  75.5  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1396  Endopygalactorunase-like protein  38.52 
 
 		 642 aa  72.8  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1410  Fibronectin type III domain protein  26.77 
 
 		 659 aa  70.1  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5903  glycoside hydrolase family 28  28.41 
 
 		 521 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.672596 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1922  Endopygalactorunase-like protein  42.98 
 
 		 669 aa  68.2  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.449199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0125  Endopygalactorunase-like protein  27.06 
 
 		 633 aa  67.8  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300956  normal  0.0208856 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2862  Fibronectin type III domain protein  25.84 
 
 		 659 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3754  Endopygalactorunase  32.76 
 
 		 983 aa  65.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16052  predicted protein  27.27 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032394  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1756  exo-poly-galacturonase signal peptide protein  41.38 
 
 		 702 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0518728  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4603  glycoside hydrolase family protein  35 
 
 		 665 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.039982  hitchhiker  0.000685896 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0230  glycoside hydrolase family protein  22.88 
 
 		 462 aa  59.7  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4858  glycoside hydrolase family 28  34.75 
 
 		 671 aa  57  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0653045  normal  0.492882 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4904  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 665 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0127  PKD domain containing protein  48.53 
 
 		 931 aa  55.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00188311 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3221  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 665 aa  54.7  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.301284  normal  0.0580699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0124  Endopygalactorunase-like protein  42.65 
 
 		 641 aa  53.5  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.778802  normal  0.020189 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7020  hypothetical protein  23.71 
 
 		 449 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361507  normal  0.742896 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5453  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 664 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.34591 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3862  hypothetical protein  39.13 
 
 		 582 aa  52.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00590592  normal  0.508788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3629  glycoside hydrolase family 28  24.24 
 
 		 488 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0432  hypothetical protein  39.51 
 
 		 495 aa  51.6  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.435778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3618  hypothetical protein  39.74 
 
 		 547 aa  50.8  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.216975 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46668  predicted protein  20.35 
 
 		 451 aa  50.4  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000812304  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6273  hypothetical protein  41.25 
 
 		 503 aa  50.4  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06656  endopolygalacturonase (Eurofung)  23.08 
 
 		 514 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10274  exo-polygalacturonase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06410)  23.89 
 
 		 424 aa  48.5  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  54.1 
 
 		 856 aa  47.4  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2384  hypothetical protein  36.11 
 
 		 415 aa  47.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.458902  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00376  polygalacturonase  24.78 
 
 		 602 aa  47.4  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1183  hypothetical protein  45.31 
 
 		 632 aa  47  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03389  xylogalacturonan hydrolase (Eurofung)  23.91 
 
 		 399 aa  47  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.176918  normal  0.718699 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2692  hypothetical protein  35.62 
 
 		 503 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.996294  decreased coverage  0.00255233 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3960  polygalacturonase  30.57 
 
 		 532 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0761528  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1489  Polygalacturonase/Pectinase  33.87 
 
 		 544 aa  45.4  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46492  predicted protein  24.66 
 
 		 563 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.481419  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1884  hypothetical protein  42.19 
 
 		 427 aa  45.4  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3630  glycoside hydrolase family 28  24.73 
 
 		 513 aa  44.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3321  glycoside hydrolase family 28  25.25 
 
 		 402 aa  44.3  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>