25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3862 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3862  hypothetical protein  100 
 
 		 582 aa  1205    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00590592  normal  0.508788 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2692  hypothetical protein  43.98 
 
 		 503 aa  441  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.996294  decreased coverage  0.00255233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2687  hypothetical protein  26.38 
 
 		 508 aa  95.1  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0242  Band 7 protein  26.3 
 
 		 681 aa  94.7  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0697  hypothetical protein  24.79 
 
 		 564 aa  87  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000189598  hitchhiker  0.0000524761 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4192  hypothetical protein  37.68 
 
 		 544 aa  81.6  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.667797  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4090  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1061 aa  79.7  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.872685  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2193  carbohydrate-binding family V/XII protein  23.14 
 
 		 790 aa  70.1  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00201516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2787  hypothetical protein  24.51 
 
 		 1037 aa  67.4  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.595004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1840  hypothetical protein  24.38 
 
 		 538 aa  63.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000982396 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  25.4 
 
 		 582 aa  61.6  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3726  hypothetical protein  24.37 
 
 		 997 aa  61.2  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.036218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2831  hypothetical protein  20.63 
 
 		 535 aa  58.9  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776559  normal  0.785726 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  40.26 
 
 		 455 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2150  hypothetical protein  24.22 
 
 		 1043 aa  54.7  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  39.13 
 
 		 559 aa  52.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0432  hypothetical protein  24.91 
 
 		 495 aa  52.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.435778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  46.38 
 
 		 518 aa  52  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  43.1 
 
 		 649 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1803  hypothetical protein  23.37 
 
 		 1030 aa  48.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000714199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  53.49 
 
 		 542 aa  48.1  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  42.86 
 
 		 509 aa  47.4  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4228  glycoside hydrolase family protein  30.91 
 
 		 442 aa  45.4  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5374  glycoside hydrolase family 28  29.9 
 
 		 442 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3618  hypothetical protein  32.35 
 
 		 547 aa  43.5  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.216975 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>