14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4192 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4192  hypothetical protein  100 
 
 		 544 aa  1122    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.667797  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0697  hypothetical protein  46.63 
 
 		 564 aa  488  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000189598  hitchhiker  0.0000524761 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0242  Band 7 protein  30.6 
 
 		 681 aa  120  9e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3862  hypothetical protein  37.68 
 
 		 582 aa  81.6  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00590592  normal  0.508788 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2692  hypothetical protein  36.03 
 
 		 503 aa  75.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.996294  decreased coverage  0.00255233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2787  hypothetical protein  23.76 
 
 		 1037 aa  62  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.595004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2831  hypothetical protein  25.14 
 
 		 535 aa  60.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776559  normal  0.785726 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4090  hypothetical protein  22.47 
 
 		 1061 aa  56.6  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.872685  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1840  hypothetical protein  21.95 
 
 		 538 aa  54.3  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000982396 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2193  carbohydrate-binding family V/XII protein  21.43 
 
 		 790 aa  50.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00201516  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  29.79 
 
 		 1418 aa  47.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2872  hypothetical protein  23.59 
 
 		 877 aa  47.4  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.44334  normal  0.168301 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2687  hypothetical protein  23.91 
 
 		 508 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1803  hypothetical protein  21.92 
 
 		 1030 aa  43.9  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000714199  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>