35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3628 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4103  hypothetical protein  95.75 
 
 		 424 aa  767    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3628  hypothetical protein  100 
 
 		 424 aa  845    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4400  hypothetical protein  68.56 
 
 		 423 aa  550  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0913462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1813  hypothetical protein  67.52 
 
 		 429 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.679097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0792  hypothetical protein  57.44 
 
 		 431 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.992362  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3715  parallel beta-helix repeat-containing protein  64.42 
 
 		 563 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.145721 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2429  parallel beta-helix repeat-containing protein  56.4 
 
 		 372 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2293  parallel beta-helix repeat-containing protein  56.13 
 
 		 372 aa  359  6e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1320  putative lipoprotein  56.35 
 
 		 420 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1457  putative lipoprotein  56.53 
 
 		 419 aa  349  5e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0434  putative lipoprotein  56.27 
 
 		 421 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1808  putative lipoprotein  56.27 
 
 		 420 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00934071  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0716  putative lipoprotein  56.27 
 
 		 421 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1151  putative lipoprotein  56.27 
 
 		 421 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.403494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1311  putative lipoprotein  56 
 
 		 420 aa  344  1e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1329  hypothetical protein  36.93 
 
 		 376 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.415289 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1312  hypothetical protein  36.93 
 
 		 359 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1348  hypothetical protein  36.51 
 
 		 364 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7522  hypothetical protein  27.31 
 
 		 807 aa  86.7  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.856232  normal  0.934418 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  22.79 
 
 		 1410 aa  72  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1308  APHP domain-containing protein  25.93 
 
 		 1085 aa  58.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0025589  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4658  mycodextranase  26.5 
 
 		 671 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  25.55 
 
 		 1200 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.89 
 
 		 1109 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.32 
 
 		 1448 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1017  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.32 
 
 		 584 aa  46.6  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.25 
 
 		 510 aa  46.6  0.0009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3140  hypothetical protein  27.12 
 
 		 1213 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242437  normal  0.09538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3706  coagulation factor 5/8 type domain protein  23.85 
 
 		 823 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301567  normal  0.394151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7012  hypothetical protein  28.45 
 
 		 675 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.342221  hitchhiker  0.00752546 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2860  periplasmic copper-binding  30.82 
 
 		 451 aa  44.3  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  21.38 
 
 		 1418 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1718  hypothetical protein  31.3 
 
 		 508 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.586514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.9 
 
 		 1212 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1378  hypothetical protein  28.05 
 
 		 400 aa  43.5  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.895761  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>