17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3444 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3444  hypothetical protein  100 
 
 		 622 aa  1217    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.623137 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0432  hypothetical protein  35.81 
 
 		 495 aa  68.2  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.435778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3618  hypothetical protein  31.55 
 
 		 547 aa  53.9  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.216975 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1485  parallel beta-helix repeat-containing protein  47.83 
 
 		 485 aa  52  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.9177  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1017  parallel beta-helix repeat-containing protein  41.18 
 
 		 584 aa  51.2  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2384  hypothetical protein  34.34 
 
 		 415 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.458902  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5633  hypothetical protein  42.47 
 
 		 866 aa  48.5  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.175065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6273  hypothetical protein  50 
 
 		 503 aa  48.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3991  hypothetical protein  47.54 
 
 		 635 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000697572 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4755  hypothetical protein  51.16 
 
 		 496 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0667593 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04825  conserved hypothetical protein  52.08 
 
 		 900 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1183  hypothetical protein  35.85 
 
 		 632 aa  46.2  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0795  hypothetical protein  32.98 
 
 		 456 aa  45.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.19124 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7522  hypothetical protein  53.49 
 
 		 807 aa  45.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.856232  normal  0.934418 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2692  hypothetical protein  27.85 
 
 		 503 aa  45.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.996294  decreased coverage  0.00255233 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2071  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  40.54 
 
 		 1003 aa  44.7  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00779  exo-beta-1,3-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11980)  34.45 
 
 		 781 aa  44.3  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.913287  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>