More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3336 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3336  Glycosidase-like protein  100 
 
 		 997 aa  2054    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.310456  normal  0.29304 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2667  alpha amylase catalytic region  36.54 
 
 		 853 aa  318  3e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.749886 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4198  alpha amylase catalytic region  35.52 
 
 		 878 aa  303  7.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4158  alpha amylase catalytic region  35.52 
 
 		 878 aa  303  7.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0148  alpha amylase catalytic region  34.62 
 
 		 878 aa  301  5e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0174055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3337  Glycosidase-like protein  49.17 
 
 		 679 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543706  normal  0.14646 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1926  Alpha-amylase  45.54 
 
 		 688 aa  155  4e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  32.74 
 
 		 1975 aa  129  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  26.52 
 
 		 1017 aa  122  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  25.99 
 
 		 925 aa  119  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  26.34 
 
 		 1005 aa  119  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1927  alpha amylase catalytic region  33.77 
 
 		 914 aa  117  7.999999999999999e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  27.21 
 
 		 723 aa  113  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  29.83 
 
 		 604 aa  110  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  30.66 
 
 		 622 aa  110  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  31.75 
 
 		 885 aa  106  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.78 
 
 		 1855 aa  102  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  24.2 
 
 		 767 aa  100  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  29.7 
 
 		 838 aa  100  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  43.07 
 
 		 1891 aa  98.2  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  40.85 
 
 		 1942 aa  97.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  27.81 
 
 		 609 aa  96.7  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  38.81 
 
 		 593 aa  92  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2883  alpha amylase catalytic region  39.39 
 
 		 630 aa  89.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.917662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  38.64 
 
 		 524 aa  89.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  34.08 
 
 		 599 aa  88.2  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  36.84 
 
 		 619 aa  88.2  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  39.42 
 
 		 2638 aa  87.4  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  35 
 
 		 642 aa  86.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2207  alpha amylase catalytic region  37.93 
 
 		 631 aa  87  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.247913  hitchhiker  0.0000287119 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  37.5 
 
 		 1021 aa  86.7  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05090  putative alpha-amylase  25.44 
 
 		 609 aa  86.7  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001107  periplasmic alpha-amylase  36.03 
 
 		 686 aa  85.9  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0600503  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  36.36 
 
 		 600 aa  85.9  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2083  alpha amylase catalytic region  23.84 
 
 		 778 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04858  periplasmic alpha-amylase precursor  36.03 
 
 		 686 aa  85.9  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  40.98 
 
 		 836 aa  85.9  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  37.31 
 
 		 614 aa  85.1  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  40.94 
 
 		 814 aa  84  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  39.42 
 
 		 752 aa  84.3  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  39.34 
 
 		 511 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  39.02 
 
 		 510 aa  82.8  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2289  alpha amylase, catalytic region  24.41 
 
 		 765 aa  82  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01888  putative alpha-amylase  35.2 
 
 		 644 aa  81.6  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2036  cyclomaltodextrinase  22.92 
 
 		 774 aa  81.6  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.47115  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  32.14 
 
 		 649 aa  81.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4138  periplasmic alpha-amylase precursor  35.38 
 
 		 687 aa  80.9  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0016  periplasmic alpha-amylase precursor  35.38 
 
 		 687 aa  80.5  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.24938  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3790  periplasmic alpha-amylase precursor  35.38 
 
 		 687 aa  80.5  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3133  periplasmic alpha-amylase precursor  36.3 
 
 		 687 aa  80.9  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21513  normal  0.0265446 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2302  alpha amylase catalytic region  24.28 
 
 		 786 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.073428 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0377  periplasmic alpha-amylase precursor  35.82 
 
 		 690 aa  80.1  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  36.84 
 
 		 2068 aa  79  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1022  alpha amylase catalytic region  32.43 
 
 		 571 aa  78.6  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1660  alpha amylase, catalytic region  35.16 
 
 		 683 aa  78.6  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  32.62 
 
 		 610 aa  78.2  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1887  alpha amylase, catalytic region  37.88 
 
 		 654 aa  78.2  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3951  periplasmic alpha-amylase precursor  36.15 
 
 		 676 aa  77.4  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  34.59 
 
 		 528 aa  77.4  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4068  periplasmic alpha-amylase precursor  35 
 
 		 676 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  40.77 
 
 		 620 aa  77.8  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03423  periplasmic alpha-amylase precursor  36.15 
 
 		 676 aa  77  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0139  alpha amylase catalytic region  36.15 
 
 		 676 aa  77  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3774  periplasmic alpha-amylase precursor  36.15 
 
 		 676 aa  77  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  33.83 
 
 		 528 aa  76.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4947  periplasmic alpha-amylase precursor  36.15 
 
 		 676 aa  77  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.876495  normal  0.214816 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4048  periplasmic alpha-amylase precursor  34.59 
 
 		 675 aa  77  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.555384 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0143  periplasmic alpha-amylase precursor  36.15 
 
 		 676 aa  77  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03374  hypothetical protein  36.15 
 
 		 676 aa  77  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3894  periplasmic alpha-amylase precursor  36.15 
 
 		 676 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  37.59 
 
 		 526 aa  75.9  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2031  alpha amylase, catalytic region  25.96 
 
 		 641 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2211  alpha amylase, catalytic region  34.07 
 
 		 665 aa  75.9  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0150  periplasmic alpha-amylase precursor  33.85 
 
 		 676 aa  75.5  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002001  periplasmic alpha-amylase  35.88 
 
 		 694 aa  74.7  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3862  periplasmic alpha-amylase precursor  33.08 
 
 		 675 aa  74.7  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3942  periplasmic alpha-amylase precursor  33.08 
 
 		 675 aa  74.7  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.973795 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3878  periplasmic alpha-amylase precursor  33.08 
 
 		 675 aa  74.7  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3987  periplasmic alpha-amylase precursor  33.08 
 
 		 675 aa  74.7  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  42.02 
 
 		 462 aa  74.3  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2313  alpha amylase, catalytic region  34.59 
 
 		 686 aa  74.3  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.638219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  33.08 
 
 		 533 aa  74.3  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2135  alpha amylase, catalytic region  34.07 
 
 		 665 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.269478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  29.47 
 
 		 574 aa  74.3  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3722  alpha amylase, catalytic region  34.57 
 
 		 646 aa  73.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2636  alpha-amylase family protein  22.39 
 
 		 617 aa  72  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  31.1 
 
 		 583 aa  72  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0054  periplasmic alpha-amylase precursor  33.85 
 
 		 688 aa  71.6  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.308839 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0210  alpha amylase catalytic region  34.04 
 
 		 741 aa  71.6  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0538024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  26.19 
 
 		 540 aa  71.6  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  34 
 
 		 739 aa  71.2  0.00000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04824  glycosidease  31.35 
 
 		 540 aa  71.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0573  alpha-amylase G-6 precursor  36.02 
 
 		 566 aa  70.9  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01890  cyclomaltodextrin glucanotransferase  23.34 
 
 		 564 aa  70.9  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  35.56 
 
 		 623 aa  70.1  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  32.85 
 
 		 742 aa  70.1  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0362  alpha amylase catalytic region  33.33 
 
 		 623 aa  70.1  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000617875  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  33.87 
 
 		 586 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5156  alpha amylase catalytic region  33.33 
 
 		 631 aa  69.3  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.794447 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  42.02 
 
 		 1401 aa  69.7  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>