More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2667 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2667  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 853 aa  1746    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.749886 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0148  alpha amylase catalytic region  71.83 
 
 		 878 aa  890    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0174055 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4158  alpha amylase catalytic region  72.55 
 
 		 878 aa  909    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4198  alpha amylase catalytic region  72.55 
 
 		 878 aa  910    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3336  Glycosidase-like protein  36.25 
 
 		 997 aa  323  7e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.310456  normal  0.29304 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  30.39 
 
 		 600 aa  161  6e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  30.8 
 
 		 609 aa  154  5e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.57 
 
 		 1975 aa  151  4e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  29.01 
 
 		 614 aa  135  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  28.04 
 
 		 599 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  27.68 
 
 		 1017 aa  130  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  27.42 
 
 		 1005 aa  127  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  26.77 
 
 		 723 aa  126  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  25.89 
 
 		 610 aa  125  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  27.97 
 
 		 1942 aa  124  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  26.22 
 
 		 767 aa  121  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  26.46 
 
 		 622 aa  119  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.95 
 
 		 1855 aa  117  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  25.72 
 
 		 593 aa  115  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  25.27 
 
 		 604 aa  111  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01890  cyclomaltodextrin glucanotransferase  27.49 
 
 		 564 aa  108  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  27.88 
 
 		 642 aa  105  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  28.42 
 
 		 649 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1022  alpha amylase catalytic region  30.52 
 
 		 571 aa  104  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0104  alpha amylase catalytic region  26.59 
 
 		 653 aa  103  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  24.92 
 
 		 885 aa  103  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  25.7 
 
 		 2638 aa  102  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0951  alpha amylase, catalytic region  25.61 
 
 		 655 aa  100  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0210  alpha amylase catalytic region  25.17 
 
 		 741 aa  100  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0538024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  36.26 
 
 		 838 aa  99.8  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5240  alpha amylase catalytic region  24.43 
 
 		 624 aa  98.2  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  26.24 
 
 		 925 aa  98.2  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0834  alpha amylase catalytic region  24.07 
 
 		 650 aa  97.8  8e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4068  periplasmic alpha-amylase precursor  39.04 
 
 		 676 aa  97.1  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  25.39 
 
 		 752 aa  96.3  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4947  periplasmic alpha-amylase precursor  34.66 
 
 		 676 aa  95.5  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.876495  normal  0.214816 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0150  periplasmic alpha-amylase precursor  39.85 
 
 		 676 aa  95.5  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3951  periplasmic alpha-amylase precursor  34.66 
 
 		 676 aa  95.5  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0139  alpha amylase catalytic region  39.55 
 
 		 676 aa  95.1  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0143  periplasmic alpha-amylase precursor  39.55 
 
 		 676 aa  95.1  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3774  periplasmic alpha-amylase precursor  39.55 
 
 		 676 aa  95.1  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03423  periplasmic alpha-amylase precursor  39.55 
 
 		 676 aa  94.7  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3894  periplasmic alpha-amylase precursor  34.66 
 
 		 676 aa  94.7  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03374  hypothetical protein  39.55 
 
 		 676 aa  94.7  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3878  periplasmic alpha-amylase precursor  39.55 
 
 		 675 aa  94.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3942  periplasmic alpha-amylase precursor  39.55 
 
 		 675 aa  94.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.973795 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2135  alpha amylase, catalytic region  25.56 
 
 		 665 aa  94.4  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.269478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3987  periplasmic alpha-amylase precursor  39.55 
 
 		 675 aa  94.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002001  periplasmic alpha-amylase  40.31 
 
 		 694 aa  94.4  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3862  periplasmic alpha-amylase precursor  39.55 
 
 		 675 aa  94.4  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4048  periplasmic alpha-amylase precursor  38.81 
 
 		 675 aa  94  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.555384 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2302  alpha amylase catalytic region  24.34 
 
 		 786 aa  93.2  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.073428 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04858  periplasmic alpha-amylase precursor  28.66 
 
 		 686 aa  93.2  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  26.5 
 
 		 836 aa  92.4  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001107  periplasmic alpha-amylase  28.31 
 
 		 686 aa  92.4  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0600503  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.47 
 
 		 1891 aa  92.8  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1887  alpha amylase, catalytic region  41.45 
 
 		 654 aa  91.7  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  39.5 
 
 		 510 aa  90.1  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1887  alpha amylase catalytic region  23.72 
 
 		 659 aa  90.1  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114905  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2883  alpha amylase catalytic region  40.62 
 
 		 630 aa  90.9  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.917662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0054  periplasmic alpha-amylase precursor  38.35 
 
 		 688 aa  90.5  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.308839 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3133  periplasmic alpha-amylase precursor  28.12 
 
 		 687 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21513  normal  0.0265446 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  41.53 
 
 		 524 aa  88.6  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2083  alpha amylase catalytic region  24.53 
 
 		 778 aa  89  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4138  periplasmic alpha-amylase precursor  37.12 
 
 		 687 aa  88.6  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0016  periplasmic alpha-amylase precursor  37.12 
 
 		 687 aa  88.6  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.24938  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3790  periplasmic alpha-amylase precursor  37.12 
 
 		 687 aa  88.6  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2036  cyclomaltodextrinase  24.57 
 
 		 774 aa  87.8  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.47115  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2186  alpha amylase, catalytic region  26.32 
 
 		 576 aa  87  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  38.98 
 
 		 511 aa  86.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  25.93 
 
 		 526 aa  86.7  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  26.8 
 
 		 703 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0377  periplasmic alpha-amylase precursor  39.1 
 
 		 690 aa  85.5  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2031  alpha amylase, catalytic region  35.56 
 
 		 641 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2636  alpha-amylase family protein  24.13 
 
 		 617 aa  84.3  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  36.64 
 
 		 814 aa  84  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  37.41 
 
 		 1021 aa  83.6  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  37.99 
 
 		 2068 aa  84  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2207  alpha amylase catalytic region  39.5 
 
 		 631 aa  84  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.247913  hitchhiker  0.0000287119 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  39.63 
 
 		 620 aa  83.2  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3722  alpha amylase, catalytic region  36.55 
 
 		 646 aa  83.2  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2211  alpha amylase, catalytic region  38.66 
 
 		 665 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  38.13 
 
 		 619 aa  82.4  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  41.27 
 
 		 528 aa  82  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  31.72 
 
 		 742 aa  82.4  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1785  alpha amylase, catalytic region  36.76 
 
 		 639 aa  81.6  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48062  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2313  alpha amylase, catalytic region  39.17 
 
 		 686 aa  81.3  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.638219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  40.48 
 
 		 528 aa  81.3  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  40.48 
 
 		 533 aa  80.9  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0362  alpha amylase catalytic region  38.13 
 
 		 623 aa  80.9  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000617875  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1660  alpha amylase, catalytic region  39.67 
 
 		 683 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3915  alpha amylase catalytic region  35.81 
 
 		 662 aa  79.7  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0962846 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01888  putative alpha-amylase  40 
 
 		 644 aa  79.3  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04824  glycosidease  34.16 
 
 		 540 aa  79  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5156  alpha amylase catalytic region  27.96 
 
 		 631 aa  78.6  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.794447 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0833  Alpha amylase, catalytic region  23.87 
 
 		 617 aa  78.2  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72167 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001087  glycosidase  35.48 
 
 		 537 aa  77.8  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  38.84 
 
 		 490 aa  77.4  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1398  alpha amylase, catalytic region  37.78 
 
 		 553 aa  77  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05090  putative alpha-amylase  39.32 
 
 		 609 aa  75.1  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>