243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1926 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1927  alpha amylase catalytic region  52.56 
 
 		 914 aa  747    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1926  Alpha-amylase  100 
 
 		 688 aa  1415    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06910  glycosidase  54.47 
 
 		 470 aa  514  1e-144  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0553945  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3337  Glycosidase-like protein  49.37 
 
 		 679 aa  471  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543706  normal  0.14646 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1130  alpha amylase catalytic region  53.56 
 
 		 566 aa  449  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2001  Alpha-amylase  47.1 
 
 		 589 aa  449  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357099  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  38.69 
 
 		 1888 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0609  alpha amylase, catalytic domain protein  45.23 
 
 		 551 aa  434  1e-120  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4065  Alpha-amylase  45.6 
 
 		 596 aa  404  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540437  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05290  glycosidase  46.72 
 
 		 479 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0985  alpha amylase domain-containing protein  44.81 
 
 		 605 aa  380  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0694969  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2478  alpha amylase catalytic region  46.26 
 
 		 612 aa  349  8e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0194919  normal  0.119382 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0930  alpha amylase catalytic region  41.45 
 
 		 614 aa  340  4e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2938  ATPase  41.89 
 
 		 563 aa  339  8e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2896  Alpha-amylase  37.76 
 
 		 722 aa  339  9.999999999999999e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.578872 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5195  Alpha-amylase  42.65 
 
 		 707 aa  336  7.999999999999999e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1247  alpha amylase catalytic region  40.62 
 
 		 494 aa  335  1e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2859  Alpha-amylase  40.68 
 
 		 661 aa  332  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4685  alpha amylase catalytic region  40.44 
 
 		 738 aa  322  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4292  Alpha-amylase A precursor (1,4-alpha-D-glucan glucanohydrolase)  38.32 
 
 		 528 aa  320  5e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2686  alpha amylase, catalytic region  38.22 
 
 		 722 aa  318  3e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288393 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  37.94 
 
 		 2156 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3336  Glycosidase-like protein  45.54 
 
 		 997 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.310456  normal  0.29304 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4716  alpha amylase catalytic region  29.98 
 
 		 458 aa  130  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2728  alpha amylase catalytic region  29.1 
 
 		 453 aa  127  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2654  alpha amylase catalytic region  29.81 
 
 		 461 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.181273  normal  0.26185 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3374  alpha amylase catalytic region  28.87 
 
 		 453 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3095  alpha amylase catalytic region  28.3 
 
 		 441 aa  117  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05253  alpha-amylase  27.15 
 
 		 449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001376  glycosidase  27.7 
 
 		 449 aa  114  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000319288  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1289  alkaline-resistant alpha-amylase precursor  26.54 
 
 		 458 aa  107  7e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3370  alpha-amylase  28.54 
 
 		 470 aa  106  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0979  alpha-amylase  24.33 
 
 		 466 aa  98.6  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1319  hypothetical protein  44.34 
 
 		 218 aa  93.2  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0191338  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  24.79 
 
 		 439 aa  82  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  24.75 
 
 		 1021 aa  77.4  0.0000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  25.78 
 
 		 739 aa  74.3  0.000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  25.11 
 
 		 742 aa  68.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  25.32 
 
 		 623 aa  67.4  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3937  glycogen branching enzyme  30.16 
 
 		 725 aa  63.9  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4136  glycogen branching enzyme  30.16 
 
 		 725 aa  63.2  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  26.4 
 
 		 524 aa  62.4  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  30.94 
 
 		 555 aa  62.4  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  30.94 
 
 		 555 aa  61.6  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  35.38 
 
 		 722 aa  59.7  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2293  glycogen branching enzyme  31.36 
 
 		 712 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.467117  hitchhiker  0.000028583 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  23.98 
 
 		 642 aa  58.9  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  24.68 
 
 		 620 aa  58.2  0.0000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0415  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.95 
 
 		 723 aa  58.2  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0889  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.81 
 
 		 807 aa  57.8  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2793  alpha amylase family protein  20.19 
 
 		 750 aa  57.8  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00275664  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  31.67 
 
 		 736 aa  57.4  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  31.67 
 
 		 736 aa  57.4  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  24.94 
 
 		 561 aa  57  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  31.67 
 
 		 736 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27990  glycogen branching enzyme  30.25 
 
 		 733 aa  57  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6277  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0223  glycogen branching enzyme  27.84 
 
 		 727 aa  57  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  24.83 
 
 		 484 aa  57  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0147  glycogen branching enzyme  28.95 
 
 		 727 aa  56.2  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1817  glycogen branching enzyme  28.09 
 
 		 736 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.297047 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  30.08 
 
 		 732 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4118  glycogen branching enzyme  28.95 
 
 		 727 aa  56.2  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3708  alpha amylase catalytic region  27.39 
 
 		 521 aa  56.2  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0277  glycogen branching enzyme  26.74 
 
 		 727 aa  55.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4006  glycogen branching enzyme  28.95 
 
 		 727 aa  56.2  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2536  glycogen branching enzyme  25.4 
 
 		 743 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1463  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.8 
 
 		 731 aa  55.1  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.433405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3153  glycogen branching enzyme  29.32 
 
 		 732 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252202  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5237  alpha amylase catalytic region  26.1 
 
 		 554 aa  54.7  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0387802 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1464  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.35 
 
 		 742 aa  54.3  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  22.82 
 
 		 703 aa  54.3  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1948  cytoplasmic alpha-amylase  23.53 
 
 		 479 aa  53.9  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581984  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4647  glycogen branching enzyme  31.58 
 
 		 728 aa  53.9  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.616835 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  22.02 
 
 		 490 aa  53.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03660  alpha-amylase AmyA, putative  23.16 
 
 		 606 aa  53.9  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03660  alpha-amylase AmyA, putative  23.16 
 
 		 606 aa  53.9  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1729  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30 
 
 		 741 aa  53.9  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.844267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11358  glycogen branching enzyme  36.25 
 
 		 731 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000136152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1955  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.38 
 
 		 668 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10284 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.6 
 
 		 841 aa  52.8  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  29.41 
 
 		 575 aa  52.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0770  alpha amylase, catalytic region  22.99 
 
 		 455 aa  53.1  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1176  alpha amylase catalytic region  26.92 
 
 		 647 aa  52.4  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  26.36 
 
 		 559 aa  52.4  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18240  cytoplasmic alpha-amylase  23.02 
 
 		 623 aa  52  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  23.34 
 
 		 511 aa  52  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  26.25 
 
 		 738 aa  52  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  23.42 
 
 		 836 aa  52  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  22.25 
 
 		 649 aa  52  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.21 
 
 		 741 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  24.21 
 
 		 532 aa  51.6  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  24.64 
 
 		 521 aa  51.2  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4229  glycogen branching enzyme  31.36 
 
 		 750 aa  51.2  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3451  glycogen branching enzyme  26.42 
 
 		 642 aa  50.8  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000151331 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  25 
 
 		 583 aa  50.8  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  28.01 
 
 		 595 aa  50.8  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4165  glycogen branching enzyme  32.97 
 
 		 716 aa  50.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01252  glycogen branching enzyme  27.68 
 
 		 730 aa  50.4  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.369495  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1806  glycogen branching enzyme  27.13 
 
 		 749 aa  50.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3840  glycogen branching enzyme  27.05 
 
 		 728 aa  50.4  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.933712 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>