26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2793 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A2793  alpha amylase family protein  100 
 
 		 750 aa  1561    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00275664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2937  alpha amylase domain-containing protein  98.04 
 
 		 613 aa  1254    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2778  alpha amylase family protein  97.73 
 
 		 750 aa  1527    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.859165  normal  0.73378 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1048  alpha amylase catalytic region  99.35 
 
 		 613 aa  1270    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3223  hypothetical protein  98.89 
 
 		 90 aa  182  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2938  hypothetical protein  98.89 
 
 		 90 aa  182  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001376  glycosidase  24.84 
 
 		 449 aa  119  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000319288  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05253  alpha-amylase  26.05 
 
 		 449 aa  118  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1289  alkaline-resistant alpha-amylase precursor  25.58 
 
 		 458 aa  111  6e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0979  alpha-amylase  26.48 
 
 		 466 aa  110  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3370  alpha-amylase  23.89 
 
 		 470 aa  104  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3095  alpha amylase catalytic region  22.13 
 
 		 441 aa  84  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2654  alpha amylase catalytic region  23.27 
 
 		 461 aa  71.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.181273  normal  0.26185 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5195  Alpha-amylase  20.65 
 
 		 707 aa  69.3  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2728  alpha amylase catalytic region  23.84 
 
 		 453 aa  68.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4716  alpha amylase catalytic region  22.08 
 
 		 458 aa  67.4  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3374  alpha amylase catalytic region  23.24 
 
 		 453 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3337  Glycosidase-like protein  21.09 
 
 		 679 aa  61.6  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543706  normal  0.14646 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06910  glycosidase  21.05 
 
 		 470 aa  60.1  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0553945  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0930  alpha amylase catalytic region  20.99 
 
 		 614 aa  58.9  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  21.89 
 
 		 1888 aa  56.2  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0985  alpha amylase domain-containing protein  21.77 
 
 		 605 aa  54.3  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0694969  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1926  Alpha-amylase  19.89 
 
 		 688 aa  49.7  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0573  alpha-amylase G-6 precursor  25.52 
 
 		 566 aa  48.9  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4065  Alpha-amylase  22.31 
 
 		 596 aa  48.1  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540437  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  21.05 
 
 		 739 aa  45.8  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>