28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2778 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A2793  alpha amylase family protein  97.73 
 
 		 750 aa  1527    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00275664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2937  alpha amylase domain-containing protein  96.57 
 
 		 613 aa  1237    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1048  alpha amylase catalytic region  97.55 
 
 		 613 aa  1248    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2778  alpha amylase family protein  100 
 
 		 750 aa  1561    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.859165  normal  0.73378 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2938  hypothetical protein  96.67 
 
 		 90 aa  179  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3223  hypothetical protein  96.67 
 
 		 90 aa  179  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001376  glycosidase  25.34 
 
 		 449 aa  126  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000319288  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05253  alpha-amylase  26.46 
 
 		 449 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1289  alkaline-resistant alpha-amylase precursor  25.96 
 
 		 458 aa  112  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0979  alpha-amylase  26.48 
 
 		 466 aa  111  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3370  alpha-amylase  23.89 
 
 		 470 aa  103  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3095  alpha amylase catalytic region  21.72 
 
 		 441 aa  88.6  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2728  alpha amylase catalytic region  24.09 
 
 		 453 aa  75.1  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4716  alpha amylase catalytic region  22.31 
 
 		 458 aa  72.4  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2654  alpha amylase catalytic region  22.82 
 
 		 461 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.181273  normal  0.26185 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3374  alpha amylase catalytic region  23.49 
 
 		 453 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5195  Alpha-amylase  21.32 
 
 		 707 aa  64.7  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06910  glycosidase  21.2 
 
 		 470 aa  63.5  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0553945  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3337  Glycosidase-like protein  20.94 
 
 		 679 aa  63.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543706  normal  0.14646 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0930  alpha amylase catalytic region  21.31 
 
 		 614 aa  61.6  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0985  alpha amylase domain-containing protein  21.4 
 
 		 605 aa  55.1  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0694969  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4065  Alpha-amylase  22.55 
 
 		 596 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540437  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2001  Alpha-amylase  22.26 
 
 		 589 aa  53.9  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357099  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  21.71 
 
 		 1888 aa  53.5  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0573  alpha-amylase G-6 precursor  24.64 
 
 		 566 aa  50.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1130  alpha amylase catalytic region  19.92 
 
 		 566 aa  48.9  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  22.16 
 
 		 739 aa  45.1  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4292  Alpha-amylase A precursor (1,4-alpha-D-glucan glucanohydrolase)  21.51 
 
 		 528 aa  45.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>