102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0979 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0979  alpha-amylase  100 
 
 		 466 aa  979    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3370  alpha-amylase  58.7 
 
 		 470 aa  577  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05253  alpha-amylase  47.06 
 
 		 449 aa  413  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001376  glycosidase  46.15 
 
 		 449 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000319288  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1289  alkaline-resistant alpha-amylase precursor  46.21 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3095  alpha amylase catalytic region  41.94 
 
 		 441 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3374  alpha amylase catalytic region  31.64 
 
 		 453 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4716  alpha amylase catalytic region  31.11 
 
 		 458 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2728  alpha amylase catalytic region  31.8 
 
 		 453 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2654  alpha amylase catalytic region  30.63 
 
 		 461 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.181273  normal  0.26185 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0930  alpha amylase catalytic region  27.05 
 
 		 614 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2937  alpha amylase domain-containing protein  26.48 
 
 		 613 aa  120  7e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2793  alpha amylase family protein  26.48 
 
 		 750 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00275664  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1048  alpha amylase catalytic region  26.48 
 
 		 613 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2778  alpha amylase family protein  26.48 
 
 		 750 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.859165  normal  0.73378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3337  Glycosidase-like protein  26.62 
 
 		 679 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543706  normal  0.14646 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2938  ATPase  25.87 
 
 		 563 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0985  alpha amylase domain-containing protein  26.05 
 
 		 605 aa  110  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0694969  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2859  Alpha-amylase  27.35 
 
 		 661 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1927  alpha amylase catalytic region  27.74 
 
 		 914 aa  110  7.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2478  alpha amylase catalytic region  26.79 
 
 		 612 aa  107  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0194919  normal  0.119382 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.96 
 
 		 2156 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06910  glycosidase  26.42 
 
 		 470 aa  99  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0553945  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1926  Alpha-amylase  24.33 
 
 		 688 aa  99.8  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5195  Alpha-amylase  24.73 
 
 		 707 aa  99  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2896  Alpha-amylase  23.55 
 
 		 722 aa  88.6  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.578872 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  25.12 
 
 		 439 aa  89  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2686  alpha amylase, catalytic region  24.31 
 
 		 722 aa  87.4  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288393 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4685  alpha amylase catalytic region  24.66 
 
 		 738 aa  87.4  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1130  alpha amylase catalytic region  26.18 
 
 		 566 aa  87  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05290  glycosidase  25.96 
 
 		 479 aa  87  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4065  Alpha-amylase  25.22 
 
 		 596 aa  86.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540437  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0609  alpha amylase, catalytic domain protein  24.85 
 
 		 551 aa  83.2  0.000000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4292  Alpha-amylase A precursor (1,4-alpha-D-glucan glucanohydrolase)  24.27 
 
 		 528 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  24.67 
 
 		 1888 aa  80.9  0.00000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1247  alpha amylase catalytic region  24.36 
 
 		 494 aa  79  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2001  Alpha-amylase  25.38 
 
 		 589 aa  77.8  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357099  normal  0.053891 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 521 aa  67.4  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  23.98 
 
 		 526 aa  66.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18730  cytoplasmic alpha-amylase  22.89 
 
 		 442 aa  66.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  23.4 
 
 		 532 aa  63.9  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  21.26 
 
 		 511 aa  63.9  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00080  alpha-amylase  21.13 
 
 		 456 aa  63.9  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.52316  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  22.65 
 
 		 510 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  24.92 
 
 		 559 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0631  cytoplasmic alpha-amylase  22.29 
 
 		 469 aa  58.9  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1537  cytoplasmic alpha-amylase  20.25 
 
 		 483 aa  57.4  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0143259  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  28.26 
 
 		 620 aa  56.6  0.0000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03308  conserved hypothetical protein. (Eurofung)  22.91 
 
 		 552 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  30.89 
 
 		 599 aa  55.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18258  predicted protein  23.24 
 
 		 517 aa  55.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1139  cytoplasmic alpha-amylase  22.66 
 
 		 516 aa  55.5  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0148  alpha amylase catalytic region  21.57 
 
 		 878 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0174055 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  25.24 
 
 		 642 aa  53.9  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  22.55 
 
 		 739 aa  54.3  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1948  cytoplasmic alpha-amylase  21.94 
 
 		 479 aa  53.5  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581984  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0573  alpha-amylase G-6 precursor  25.82 
 
 		 566 aa  53.5  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46693  predicted protein  25.21 
 
 		 979 aa  52.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.649333  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03660  alpha-amylase AmyA, putative  26.76 
 
 		 606 aa  52.4  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03660  alpha-amylase AmyA, putative  26.76 
 
 		 606 aa  52.4  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  24.28 
 
 		 561 aa  51.6  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  25.76 
 
 		 649 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1758  cytoplasmic alpha-amylase  22.11 
 
 		 513 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591182  normal  0.938186 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  27.37 
 
 		 593 aa  50.4  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  21.9 
 
 		 836 aa  50.4  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1800  alpha amylase, catalytic region  23.64 
 
 		 627 aa  49.3  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.847837  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  25.42 
 
 		 2638 aa  49.7  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  26.67 
 
 		 640 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6825  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.3 
 
 		 640 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2394  cytoplasmic alpha-amylase  22.68 
 
 		 472 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3487  cytoplasmic alpha-amylase  21.84 
 
 		 513 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1387  cytoplasmic alpha-amylase  22.78 
 
 		 496 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3200  cytoplasmic alpha-amylase  23.4 
 
 		 513 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.570134  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1263  alpha amylase catalytic region  29.81 
 
 		 499 aa  49.3  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.796062 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3291  cytoplasmic alpha-amylase  22.49 
 
 		 513 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000922062  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3551  cytoplasmic alpha-amylase  22.49 
 
 		 513 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  19.75 
 
 		 575 aa  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  24.91 
 
 		 1005 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  19.91 
 
 		 814 aa  48.1  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3508  cytoplasmic alpha-amylase  22.49 
 
 		 513 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  21.46 
 
 		 623 aa  47.4  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000056  cytoplasmic alpha-amylase  23.88 
 
 		 507 aa  47  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0351894  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3323  alpha amylase catalytic region  22.5 
 
 		 570 aa  47  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2409  cytoplasmic alpha-amylase  24.41 
 
 		 494 aa  46.6  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  30.77 
 
 		 1307 aa  46.6  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  23.73 
 
 		 462 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  27.32 
 
 		 571 aa  46.2  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  25.08 
 
 		 752 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4158  alpha amylase catalytic region  24.17 
 
 		 878 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4198  alpha amylase catalytic region  24.17 
 
 		 878 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  22.77 
 
 		 490 aa  45.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2865  putative trehalose trehalohydrolase  24.17 
 
 		 640 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.944811 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  24.15 
 
 		 583 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18240  cytoplasmic alpha-amylase  24.29 
 
 		 623 aa  45.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2808  alpha amylase catalytic region  25.42 
 
 		 481 aa  44.7  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00730774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  22.96 
 
 		 528 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001107  periplasmic alpha-amylase  21.28 
 
 		 686 aa  44.3  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0600503  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1727  alpha amylase catalytic region  22.78 
 
 		 454 aa  43.9  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000518329  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  23.35 
 
 		 528 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04200  alpha-amylase, putative  23.87 
 
 		 486 aa  43.5  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>