215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2686 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4292  Alpha-amylase A precursor (1,4-alpha-D-glucan glucanohydrolase)  73.18 
 
 		 528 aa  793    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2686  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 722 aa  1466    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2896  Alpha-amylase  85.87 
 
 		 722 aa  1288    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.578872 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4685  alpha amylase catalytic region  49.5 
 
 		 738 aa  594  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3337  Glycosidase-like protein  43.1 
 
 		 679 aa  495  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543706  normal  0.14646 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2001  Alpha-amylase  44.2 
 
 		 589 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357099  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4065  Alpha-amylase  41.25 
 
 		 596 aa  409  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540437  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0985  alpha amylase domain-containing protein  40.1 
 
 		 605 aa  379  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0694969  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5195  Alpha-amylase  44.59 
 
 		 707 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05290  glycosidase  44.85 
 
 		 479 aa  345  1e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1130  alpha amylase catalytic region  37.44 
 
 		 566 aa  345  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2938  ATPase  36.05 
 
 		 563 aa  329  1.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1247  alpha amylase catalytic region  40.16 
 
 		 494 aa  328  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2478  alpha amylase catalytic region  38.47 
 
 		 612 aa  323  8e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0194919  normal  0.119382 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1927  alpha amylase catalytic region  40.7 
 
 		 914 aa  322  9.999999999999999e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06910  glycosidase  40.74 
 
 		 470 aa  319  1e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0553945  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0930  alpha amylase catalytic region  36.41 
 
 		 614 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1926  Alpha-amylase  36.44 
 
 		 688 aa  304  4.0000000000000003e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2859  Alpha-amylase  36.08 
 
 		 661 aa  270  5e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0609  alpha amylase, catalytic domain protein  33.4 
 
 		 551 aa  266  1e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  29.16 
 
 		 1888 aa  265  2e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  32.34 
 
 		 2156 aa  206  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  25.55 
 
 		 742 aa  121  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4716  alpha amylase catalytic region  26.86 
 
 		 458 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2728  alpha amylase catalytic region  28.54 
 
 		 453 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3374  alpha amylase catalytic region  31.83 
 
 		 453 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2654  alpha amylase catalytic region  29.25 
 
 		 461 aa  97.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.181273  normal  0.26185 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  31.1 
 
 		 439 aa  95.9  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  21.98 
 
 		 767 aa  92.4  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0213  glucan 1,4- a-glucosidase  54.22 
 
 		 881 aa  90.5  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05463  conserved hypothetical protein  47.17 
 
 		 385 aa  90.1  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1658  putative amylase  55.13 
 
 		 881 aa  88.6  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0289  glycosy hydrolase family protein  55.13 
 
 		 882 aa  88.6  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0200  putative glucan 1,4-alpha-glucosidase  55.13 
 
 		 882 aa  88.6  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  23.63 
 
 		 623 aa  87.8  7e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07402  glucoamylase (Eurofung)  40.2 
 
 		 661 aa  87  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  22.72 
 
 		 739 aa  87  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0979  alpha-amylase  23.66 
 
 		 466 aa  87  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3095  alpha amylase catalytic region  25.32 
 
 		 441 aa  87  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3370  alpha-amylase  25.83 
 
 		 470 aa  80.5  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1800  alpha amylase, catalytic region  43.88 
 
 		 627 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.847837  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001376  glycosidase  22.49 
 
 		 449 aa  75.5  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000319288  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1319  hypothetical protein  35.43 
 
 		 218 aa  73.6  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0191338  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  26.46 
 
 		 490 aa  71.6  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0210  alpha amylase catalytic region  36.08 
 
 		 741 aa  71.6  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0538024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0314  hypothetical protein  41.77 
 
 		 644 aa  71.2  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0822878 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1289  alkaline-resistant alpha-amylase precursor  21.79 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  36.08 
 
 		 703 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02760  Alpha-amylase A precursor, putative  23.71 
 
 		 572 aa  67.8  0.0000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  27.22 
 
 		 559 aa  66.6  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  25.54 
 
 		 521 aa  65.9  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05253  alpha-amylase  22.77 
 
 		 449 aa  65.1  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  21.56 
 
 		 526 aa  64.7  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  22.37 
 
 		 1005 aa  63.5  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03308  conserved hypothetical protein. (Eurofung)  24.73 
 
 		 552 aa  62  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  23.8 
 
 		 1017 aa  60.8  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11143  glucoamylase (Eurofung)  35.23 
 
 		 619 aa  60.5  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0352  alpha amylase catalytic region  26.32 
 
 		 554 aa  60.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00857994  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0481  glycosyl hydrolase family protein  26.34 
 
 		 554 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000250656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0357  glycosyl hydrolase family protein  26.34 
 
 		 554 aa  59.7  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000071861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0347  alpha-glucosidase  26.34 
 
 		 554 aa  59.7  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225343  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0343  alpha-glucosidase  26.34 
 
 		 554 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0413  glycosyl hydrolase family protein  26.34 
 
 		 554 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000830485 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0371  glycosyl hydrolase family protein  26.34 
 
 		 554 aa  59.7  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000236448  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0470  glycosyl hydrolase family protein  26.34 
 
 		 554 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  24.91 
 
 		 555 aa  59.7  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2341  alpha amylase catalytic region  23.66 
 
 		 554 aa  59.7  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  24.91 
 
 		 555 aa  58.9  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  27.19 
 
 		 532 aa  58.5  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  24.12 
 
 		 1891 aa  58.2  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0421  putative oligo-1,6-glucosidase  24.87 
 
 		 554 aa  57.8  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.591118  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00080  alpha-amylase  26.86 
 
 		 456 aa  57.8  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.52316  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  24.1 
 
 		 814 aa  57.4  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18730  cytoplasmic alpha-amylase  26.41 
 
 		 442 aa  56.6  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  20.81 
 
 		 649 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1948  cytoplasmic alpha-amylase  24.56 
 
 		 479 aa  56.6  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581984  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1564  alpha-D-1,4-glucosidase  25.13 
 
 		 549 aa  56.6  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1595  alpha-D-1,4-glucosidase  25.13 
 
 		 549 aa  56.6  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  26.67 
 
 		 561 aa  55.8  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0417  oligo-1,6-glucosidase  23.35 
 
 		 554 aa  55.5  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02410  alpha amylase  23.97 
 
 		 364 aa  55.1  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  33.57 
 
 		 528 aa  55.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4891  glycosyl hydrolase family protein  24.73 
 
 		 554 aa  54.7  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000186881  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0427  glycosyl hydrolase family protein  24.73 
 
 		 554 aa  54.7  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3136  glucan 1,4-alpha-maltotetraohydrolase  34.94 
 
 		 555 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.815174  hitchhiker  0.00720592 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2137  glycoside hydrolase starch-binding  34.34 
 
 		 752 aa  54.3  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  26.9 
 
 		 499 aa  54.3  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26014  predicted protein  29.67 
 
 		 249 aa  53.9  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  23.78 
 
 		 815 aa  53.9  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  25.24 
 
 		 462 aa  53.5  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  24.5 
 
 		 609 aa  53.5  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000056  cytoplasmic alpha-amylase  23.57 
 
 		 507 aa  53.9  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0351894  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  25.13 
 
 		 554 aa  53.5  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  24.19 
 
 		 554 aa  53.9  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1139  cytoplasmic alpha-amylase  23 
 
 		 516 aa  53.1  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  31.41 
 
 		 533 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3323  alpha amylase catalytic region  25.4 
 
 		 570 aa  53.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  27.51 
 
 		 484 aa  53.1  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2394  cytoplasmic alpha-amylase  25.26 
 
 		 472 aa  53.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1176  alpha amylase catalytic region  23.65 
 
 		 647 aa  53.1  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>