227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2394 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2394  cytoplasmic alpha-amylase  100 
 
 		 472 aa  987    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1800  alpha amylase, catalytic region  51.13 
 
 		 627 aa  490  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.847837  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000056  cytoplasmic alpha-amylase  51.98 
 
 		 507 aa  482  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0351894  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05679  cytoplasmic alpha-amylase  52.61 
 
 		 507 aa  481  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3273  cytoplasmic alpha-amylase  49.48 
 
 		 549 aa  464  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3487  cytoplasmic alpha-amylase  45.76 
 
 		 513 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3200  cytoplasmic alpha-amylase  45.55 
 
 		 513 aa  436  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.570134  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2176  cytoplasmic alpha-amylase  45.15 
 
 		 488 aa  436  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1758  cytoplasmic alpha-amylase  45.55 
 
 		 513 aa  435  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591182  normal  0.938186 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3261  cytoplasmic alpha-amylase  44.93 
 
 		 513 aa  432  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0208363  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3508  cytoplasmic alpha-amylase  45.13 
 
 		 513 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3291  cytoplasmic alpha-amylase  44.93 
 
 		 513 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000922062  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3551  cytoplasmic alpha-amylase  44.93 
 
 		 513 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2409  cytoplasmic alpha-amylase  45.64 
 
 		 494 aa  423  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1812  cytoplasmic alpha-amylase  45.96 
 
 		 492 aa  414  1e-114  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0328907  normal  0.0314505 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1387  cytoplasmic alpha-amylase  44.17 
 
 		 496 aa  415  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0708  cytoplasmic alpha-amylase  41.49 
 
 		 488 aa  382  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0434693  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2808  alpha amylase catalytic region  41.12 
 
 		 481 aa  380  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00730774  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2702  cytoplasmic alpha-amylase  41.84 
 
 		 495 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.363407 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3249  alpha amylase catalytic region  40.99 
 
 		 480 aa  378  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1254  cytoplasmic alpha-amylase  41.84 
 
 		 495 aa  376  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.345137 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2526  cytoplasmic alpha-amylase  40.57 
 
 		 495 aa  377  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1712  cytoplasmic alpha-amylase  41.84 
 
 		 495 aa  375  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2027  cytoplasmic alpha-amylase  41.84 
 
 		 495 aa  376  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2162  cytoplasmic alpha-amylase  41.84 
 
 		 495 aa  376  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1057  cytoplasmic alpha-amylase  41.84 
 
 		 495 aa  376  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0627984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1719  alpha amylase catalytic region  41.84 
 
 		 495 aa  374  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2178  cytoplasmic alpha-amylase  40.98 
 
 		 494 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170616  normal  0.0297459 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1157  cytoplasmic alpha-amylase  40.98 
 
 		 494 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00381479  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2120  cytoplasmic alpha-amylase  40.78 
 
 		 494 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.070724  normal  0.352748 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2125  cytoplasmic alpha-amylase  40.78 
 
 		 494 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.172028  hitchhiker  0.0000021601 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1280  cytoplasmic alpha-amylase  40.57 
 
 		 494 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0337681  normal  0.462612 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1500  cytoplasmic alpha-amylase  41.25 
 
 		 483 aa  368  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1263  alpha amylase catalytic region  41.31 
 
 		 499 aa  362  9e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.796062 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1537  cytoplasmic alpha-amylase  40.83 
 
 		 483 aa  347  3e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0143259  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04200  alpha-amylase, putative  38.75 
 
 		 486 aa  332  1e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917737  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03309  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15150)  34.57 
 
 		 576 aa  273  3e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.979768  normal  0.838039 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18240  cytoplasmic alpha-amylase  35.32 
 
 		 623 aa  251  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1139  cytoplasmic alpha-amylase  34.22 
 
 		 516 aa  245  9.999999999999999e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18730  cytoplasmic alpha-amylase  26.6 
 
 		 442 aa  150  5e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00080  alpha-amylase  24.42 
 
 		 456 aa  127  6e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.52316  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0631  cytoplasmic alpha-amylase  28.04 
 
 		 469 aa  125  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1948  cytoplasmic alpha-amylase  24.41 
 
 		 479 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581984  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02410  alpha amylase  27.37 
 
 		 364 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2397  hypothetical protein  89.36 
 
 		 66 aa  90.9  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46693  predicted protein  26.72 
 
 		 979 aa  82.8  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.649333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18258  predicted protein  22.67 
 
 		 517 aa  80.1  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4716  alpha amylase catalytic region  26.38 
 
 		 458 aa  73.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  24.62 
 
 		 462 aa  66.6  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36075  predicted protein  22.54 
 
 		 447 aa  65.5  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00709127  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35756  predicted protein  22.63 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.558305 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  25 
 
 		 614 aa  62.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  25.57 
 
 		 622 aa  62.4  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0554  alpha amylase, catalytic region  23.59 
 
 		 441 aa  62  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0002426  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0568  alpha amylase catalytic region  24.18 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.489897  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  21.56 
 
 		 524 aa  61.6  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  25.07 
 
 		 723 aa  61.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  20.98 
 
 		 623 aa  61.2  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.61 
 
 		 1975 aa  61.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0563  Alpha-amylase  22.4 
 
 		 607 aa  60.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.611678  normal  0.295943 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  23.22 
 
 		 510 aa  60.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  24.91 
 
 		 593 aa  60.5  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.92 
 
 		 1891 aa  60.1  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  24.9 
 
 		 600 aa  59.3  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4685  alpha amylase catalytic region  25.71 
 
 		 738 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  21.45 
 
 		 559 aa  59.3  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2341  alpha amylase catalytic region  22.19 
 
 		 554 aa  58.9  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  26.01 
 
 		 1942 aa  58.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  20.56 
 
 		 532 aa  57.4  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0951  alpha amylase, catalytic region  31.91 
 
 		 655 aa  57  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  23.51 
 
 		 1855 aa  56.6  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0191  glycosy hydrolase family protein  22.01 
 
 		 534 aa  56.2  0.000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  23.44 
 
 		 609 aa  56.2  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2667  alpha amylase catalytic region  23.11 
 
 		 853 aa  56.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.749886 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0827  alpha amylase catalytic region  20.33 
 
 		 687 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  21.83 
 
 		 511 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2654  alpha amylase catalytic region  25.63 
 
 		 461 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.181273  normal  0.26185 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  25 
 
 		 604 aa  55.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  22.36 
 
 		 583 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  24.49 
 
 		 499 aa  55.1  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  26.32 
 
 		 1005 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  25.45 
 
 		 557 aa  54.3  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1848  alpha-glucosidase  25 
 
 		 541 aa  53.9  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  23.08 
 
 		 439 aa  53.5  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  21.55 
 
 		 490 aa  53.5  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0104  alpha amylase catalytic region  29.79 
 
 		 653 aa  53.5  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  23.15 
 
 		 544 aa  53.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2686  alpha amylase, catalytic region  25.77 
 
 		 722 aa  52.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288393 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1728  trehalose synthase  23.32 
 
 		 585 aa  53.1  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  21.39 
 
 		 649 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1727  alpha amylase catalytic region  22.29 
 
 		 454 aa  53.1  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000518329  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3370  alpha-amylase  21.07 
 
 		 470 aa  52.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  26.55 
 
 		 1017 aa  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0148  alpha amylase catalytic region  22.19 
 
 		 878 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0174055 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2896  Alpha-amylase  25.13 
 
 		 722 aa  52.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.578872 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5195  Alpha-amylase  23.55 
 
 		 707 aa  51.6  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  23.62 
 
 		 596 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  23.46 
 
 		 528 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  23.62 
 
 		 596 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4292  Alpha-amylase A precursor (1,4-alpha-D-glucan glucanohydrolase)  25.77 
 
 		 528 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>