167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNG04200 on replicon NC_006692
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006692  CNG04200  alpha-amylase, putative  100 
 
 		 486 aa  1015    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917737  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2808  alpha amylase catalytic region  47.48 
 
 		 481 aa  436  1e-121  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00730774  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1812  cytoplasmic alpha-amylase  46.58 
 
 		 492 aa  437  1e-121  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0328907  normal  0.0314505 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3249  alpha amylase catalytic region  45.95 
 
 		 480 aa  432  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0708  cytoplasmic alpha-amylase  46.15 
 
 		 488 aa  427  1e-118  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0434693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3261  cytoplasmic alpha-amylase  44.72 
 
 		 513 aa  419  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0208363  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3508  cytoplasmic alpha-amylase  44.93 
 
 		 513 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3291  cytoplasmic alpha-amylase  44.72 
 
 		 513 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000922062  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1537  cytoplasmic alpha-amylase  45.3 
 
 		 483 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0143259  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3551  cytoplasmic alpha-amylase  44.72 
 
 		 513 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3487  cytoplasmic alpha-amylase  45.13 
 
 		 513 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3200  cytoplasmic alpha-amylase  44.44 
 
 		 513 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.570134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1758  cytoplasmic alpha-amylase  45.13 
 
 		 513 aa  413  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591182  normal  0.938186 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2409  cytoplasmic alpha-amylase  44.62 
 
 		 494 aa  414  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1500  cytoplasmic alpha-amylase  44.1 
 
 		 483 aa  404  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3273  cytoplasmic alpha-amylase  42.2 
 
 		 549 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2176  cytoplasmic alpha-amylase  43.24 
 
 		 488 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000056  cytoplasmic alpha-amylase  43.53 
 
 		 507 aa  389  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0351894  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05679  cytoplasmic alpha-amylase  43.92 
 
 		 507 aa  389  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1800  alpha amylase, catalytic region  41.43 
 
 		 627 aa  376  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.847837  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1280  cytoplasmic alpha-amylase  41.01 
 
 		 494 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0337681  normal  0.462612 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1157  cytoplasmic alpha-amylase  41.33 
 
 		 494 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00381479  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2125  cytoplasmic alpha-amylase  41.33 
 
 		 494 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.172028  hitchhiker  0.0000021601 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2178  cytoplasmic alpha-amylase  41.33 
 
 		 494 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170616  normal  0.0297459 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2120  cytoplasmic alpha-amylase  41.13 
 
 		 494 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.070724  normal  0.352748 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2702  cytoplasmic alpha-amylase  42.64 
 
 		 495 aa  362  1e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.363407 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2526  cytoplasmic alpha-amylase  41.75 
 
 		 495 aa  361  2e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2027  cytoplasmic alpha-amylase  42.42 
 
 		 495 aa  360  2e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2162  cytoplasmic alpha-amylase  42.42 
 
 		 495 aa  360  2e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1254  cytoplasmic alpha-amylase  42.42 
 
 		 495 aa  360  2e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.345137 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1712  cytoplasmic alpha-amylase  42.42 
 
 		 495 aa  360  3e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1057  cytoplasmic alpha-amylase  42.42 
 
 		 495 aa  360  4e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0627984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1719  alpha amylase catalytic region  42.42 
 
 		 495 aa  359  5e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1263  alpha amylase catalytic region  41.78 
 
 		 499 aa  358  9.999999999999999e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.796062 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1387  cytoplasmic alpha-amylase  39.75 
 
 		 496 aa  342  9e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03309  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15150)  40.17 
 
 		 576 aa  341  2e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.979768  normal  0.838039 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2394  cytoplasmic alpha-amylase  38.75 
 
 		 472 aa  332  1e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1139  cytoplasmic alpha-amylase  33.27 
 
 		 516 aa  221  3e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18240  cytoplasmic alpha-amylase  34.83 
 
 		 623 aa  218  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18730  cytoplasmic alpha-amylase  26.36 
 
 		 442 aa  137  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1948  cytoplasmic alpha-amylase  26.99 
 
 		 479 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581984  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00080  alpha-amylase  25.98 
 
 		 456 aa  128  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.52316  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0631  cytoplasmic alpha-amylase  26.03 
 
 		 469 aa  114  4.0000000000000004e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02410  alpha amylase  26.58 
 
 		 364 aa  93.6  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46693  predicted protein  27.07 
 
 		 979 aa  92.8  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.649333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18258  predicted protein  25.57 
 
 		 517 aa  85.1  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36075  predicted protein  24.1 
 
 		 447 aa  82.4  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00709127  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5240  alpha amylase catalytic region  23.25 
 
 		 624 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35756  predicted protein  23.6 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.558305 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0959  a-glucosidase  24.3 
 
 		 527 aa  73.2  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.766487  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  23.56 
 
 		 462 aa  71.2  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3722  alpha amylase, catalytic region  24.36 
 
 		 646 aa  67  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  22.55 
 
 		 509 aa  65.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  24.03 
 
 		 815 aa  63.9  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  26.85 
 
 		 510 aa  63.9  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  22.91 
 
 		 595 aa  63.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  22.85 
 
 		 515 aa  63.5  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  26.18 
 
 		 511 aa  63.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  23.12 
 
 		 522 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  23.69 
 
 		 583 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  24.58 
 
 		 586 aa  61.6  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  21.28 
 
 		 493 aa  60.8  0.00000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8808  alpha amylase, catalytic region  23.66 
 
 		 552 aa  60.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  23.45 
 
 		 586 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  23.66 
 
 		 586 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0563  Alpha-amylase  22.52 
 
 		 607 aa  59.3  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.611678  normal  0.295943 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2636  alpha-amylase family protein  24.59 
 
 		 617 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  23.66 
 
 		 586 aa  59.3  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  23.66 
 
 		 586 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  23.66 
 
 		 586 aa  59.3  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  23.66 
 
 		 586 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  23.38 
 
 		 586 aa  57.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  23.18 
 
 		 545 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  26.7 
 
 		 593 aa  57  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  22.22 
 
 		 541 aa  56.6  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1727  alpha amylase catalytic region  23.48 
 
 		 454 aa  56.6  0.0000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000518329  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  21.54 
 
 		 620 aa  56.6  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  24.58 
 
 		 576 aa  56.6  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  25.27 
 
 		 593 aa  55.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3915  alpha amylase catalytic region  23.29 
 
 		 662 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0962846 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  21.94 
 
 		 541 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  23.16 
 
 		 586 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  23.16 
 
 		 586 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  23.62 
 
 		 599 aa  53.9  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3095  alpha amylase catalytic region  23.85 
 
 		 441 aa  53.9  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3686  alpha amylase, catalytic region  22.14 
 
 		 540 aa  53.9  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12163  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1743  alpha amylase, catalytic region  24.32 
 
 		 619 aa  53.5  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  30.11 
 
 		 1021 aa  52.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  25.27 
 
 		 610 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0770  alpha amylase, catalytic region  25.07 
 
 		 455 aa  53.1  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  28.64 
 
 		 562 aa  51.6  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.53 
 
 		 1975 aa  51.6  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03308  conserved hypothetical protein. (Eurofung)  23.08 
 
 		 552 aa  51.2  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  26.84 
 
 		 524 aa  51.6  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4604  alpha amylase catalytic region  25.93 
 
 		 554 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0894643  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  25.27 
 
 		 610 aa  50.8  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0833  Alpha amylase, catalytic region  23.81 
 
 		 617 aa  50.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72167 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0729  amylopullulanase  26.64 
 
 		 600 aa  50.4  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00401162  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3708  alpha amylase catalytic region  22.2 
 
 		 521 aa  50.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  25.27 
 
 		 439 aa  49.7  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>