More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_46693 on replicon NC_009364
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009364  OSTLU_46693  predicted protein  100 
 
 
979 aa  2027    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.649333  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18258  predicted protein  46 
 
 
517 aa  411  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35756  predicted protein  48 
 
 
410 aa  400  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.558305 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36075  predicted protein  41.61 
 
 
447 aa  332  2e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00709127  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0563  Alpha-amylase  37.69 
 
 
607 aa  269  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.611678  normal  0.295943 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0201  alpha amylase catalytic region  30.44 
 
 
513 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213687  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18730  cytoplasmic alpha-amylase  28.15 
 
 
442 aa  131  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3136  glucan 1,4-alpha-maltotetraohydrolase  31.2 
 
 
555 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.815174  hitchhiker  0.00720592 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00080  alpha-amylase  28.65 
 
 
456 aa  115  5e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.52316  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02410  alpha amylase  25.95 
 
 
364 aa  111  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1948  cytoplasmic alpha-amylase  28.57 
 
 
479 aa  108  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581984  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0631  cytoplasmic alpha-amylase  26.8 
 
 
469 aa  105  6e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18240  cytoplasmic alpha-amylase  28.53 
 
 
623 aa  104  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1139  cytoplasmic alpha-amylase  25.71 
 
 
516 aa  102  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04200  alpha-amylase, putative  27.07 
 
 
486 aa  93.2  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917737  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2409  cytoplasmic alpha-amylase  24.68 
 
 
494 aa  92  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05679  cytoplasmic alpha-amylase  26.88 
 
 
507 aa  88.6  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000056  cytoplasmic alpha-amylase  27.96 
 
 
507 aa  88.6  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0351894  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2394  cytoplasmic alpha-amylase  26.72 
 
 
472 aa  82  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3273  cytoplasmic alpha-amylase  26.63 
 
 
549 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1812  cytoplasmic alpha-amylase  24.88 
 
 
492 aa  80.5  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0328907  normal  0.0314505 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1800  alpha amylase, catalytic region  23.88 
 
 
627 aa  80.5  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.847837  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1537  cytoplasmic alpha-amylase  26.15 
 
 
483 aa  80.5  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0143259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3291  cytoplasmic alpha-amylase  26.08 
 
 
513 aa  79.7  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000922062  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3551  cytoplasmic alpha-amylase  26.08 
 
 
513 aa  79.7  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3508  cytoplasmic alpha-amylase  25.19 
 
 
513 aa  79.3  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1758  cytoplasmic alpha-amylase  25.89 
 
 
513 aa  78.6  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591182  normal  0.938186 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3487  cytoplasmic alpha-amylase  26.65 
 
 
513 aa  78.6  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3200  cytoplasmic alpha-amylase  26.33 
 
 
513 aa  77.8  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.570134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3261  cytoplasmic alpha-amylase  24.62 
 
 
513 aa  77  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0208363  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2526  cytoplasmic alpha-amylase  23.44 
 
 
495 aa  74.7  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1387  cytoplasmic alpha-amylase  23.92 
 
 
496 aa  72.4  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2176  cytoplasmic alpha-amylase  24.09 
 
 
488 aa  72  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1263  alpha amylase catalytic region  23.54 
 
 
499 aa  70.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.796062 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3249  alpha amylase catalytic region  25.25 
 
 
480 aa  69.7  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2808  alpha amylase catalytic region  23.38 
 
 
481 aa  69.7  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00730774  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  25.29 
 
 
439 aa  69.7  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0708  cytoplasmic alpha-amylase  26.41 
 
 
488 aa  69.3  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0434693  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1712  cytoplasmic alpha-amylase  24.1 
 
 
495 aa  68.9  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  27.95 
 
 
815 aa  68.9  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  23.62 
 
 
510 aa  68.2  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2162  cytoplasmic alpha-amylase  23.39 
 
 
495 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1719  alpha amylase catalytic region  23.85 
 
 
495 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2178  cytoplasmic alpha-amylase  24.16 
 
 
494 aa  67.4  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170616  normal  0.0297459 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2120  cytoplasmic alpha-amylase  24.42 
 
 
494 aa  67.8  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.070724  normal  0.352748 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3374  alpha amylase catalytic region  22.49 
 
 
453 aa  67.4  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2125  cytoplasmic alpha-amylase  24.16 
 
 
494 aa  67.4  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.172028  hitchhiker  0.0000021601 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2027  cytoplasmic alpha-amylase  23.39 
 
 
495 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1254  cytoplasmic alpha-amylase  23.39 
 
 
495 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.345137 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  26.26 
 
 
490 aa  66.6  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1157  cytoplasmic alpha-amylase  24.55 
 
 
494 aa  67  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00381479  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1280  cytoplasmic alpha-amylase  24.16 
 
 
494 aa  67  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0337681  normal  0.462612 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2702  cytoplasmic alpha-amylase  23.39 
 
 
495 aa  67  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.363407 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1057  cytoplasmic alpha-amylase  23.39 
 
 
495 aa  67  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0627984  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2728  alpha amylase catalytic region  21.88 
 
 
453 aa  66.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  23.53 
 
 
575 aa  65.9  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  26.07 
 
 
487 aa  65.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  21.61 
 
 
462 aa  65.5  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  27.01 
 
 
555 aa  64.7  0.000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  22.84 
 
 
493 aa  64.3  0.000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  26.54 
 
 
524 aa  64.3  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  26.44 
 
 
555 aa  63.9  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  25.32 
 
 
493 aa  63.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  24.19 
 
 
511 aa  62.8  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  25.72 
 
 
486 aa  62.8  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  27.68 
 
 
588 aa  61.2  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  23.47 
 
 
515 aa  61.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  27.47 
 
 
575 aa  60.8  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0544  alpha amylase catalytic region  31.46 
 
 
758 aa  60.1  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0554  alpha amylase, catalytic region  34.25 
 
 
441 aa  60.5  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0002426  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  25.27 
 
 
481 aa  59.7  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  27.07 
 
 
586 aa  59.3  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0827  alpha amylase catalytic region  24.7 
 
 
687 aa  58.9  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  40.58 
 
 
654 aa  58.9  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  21.63 
 
 
836 aa  58.5  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  21.91 
 
 
583 aa  57.8  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  24.3 
 
 
595 aa  57.8  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1167  alpha amylase catalytic region  26.11 
 
 
576 aa  57.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.823071  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  23.15 
 
 
586 aa  57.4  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0568  alpha amylase catalytic region  32.88 
 
 
441 aa  57.8  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.489897  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03308  conserved hypothetical protein. (Eurofung)  22.61 
 
 
552 aa  57  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77903  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2593  alpha amylase catalytic region  26.09 
 
 
258 aa  56.6  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191559  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  25.88 
 
 
488 aa  57  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  23.53 
 
 
589 aa  57  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1378  alpha amylase catalytic region  38.96 
 
 
553 aa  56.6  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000100533  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05253  alpha-amylase  32.08 
 
 
449 aa  57  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2341  alpha amylase catalytic region  26.92 
 
 
554 aa  57  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  23.4 
 
 
623 aa  56.2  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  28.64 
 
 
481 aa  56.2  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  26.4 
 
 
574 aa  55.5  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3095  alpha amylase catalytic region  37.23 
 
 
441 aa  55.5  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0770  alpha amylase, catalytic region  25.41 
 
 
455 aa  55.5  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  21.66 
 
 
499 aa  55.1  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  24.7 
 
 
561 aa  55.1  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  29.88 
 
 
635 aa  54.7  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  24.17 
 
 
593 aa  54.7  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1176  alpha amylase catalytic region  36.99 
 
 
647 aa  54.7  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  28.43 
 
 
576 aa  54.7  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3096  alpha amylase catalytic region  27.01 
 
 
479 aa  54.7  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  27.81 
 
 
467 aa  54.7  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0134925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>