More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3686 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3686  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 540 aa  1116    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12163  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4038  alpha amylase catalytic region  47.09 
 
 		 544 aa  508  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0583407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3928  alpha amylase catalytic region  45.19 
 
 		 544 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1579  alpha amylase catalytic region  43.58 
 
 		 543 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125982 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8020  trehalose synthase  44.1 
 
 		 553 aa  483  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3225  alpha amylase catalytic region  44.67 
 
 		 564 aa  473  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.262228  hitchhiker  0.0000603449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1908  alpha amylase catalytic region  43.57 
 
 		 553 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.834785  normal  0.122197 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3079  alpha amylase catalytic region  45.84 
 
 		 556 aa  465  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493465  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5642  alpha amylase catalytic region  43.81 
 
 		 540 aa  464  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000211534  normal  0.444192 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2115  alpha amylase catalytic region  42.65 
 
 		 553 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  0.0296214 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2978  alpha amylase, catalytic region  45.16 
 
 		 548 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.533119  normal  0.0820165 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2621  alpha amylase catalytic region  43.75 
 
 		 554 aa  455  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1968  alpha amylase catalytic region  42.31 
 
 		 554 aa  457  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4604  alpha amylase catalytic region  44.24 
 
 		 554 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0894643  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3114  alpha amylase catalytic region  43.51 
 
 		 579 aa  451  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3708  alpha amylase catalytic region  42.78 
 
 		 521 aa  446  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5237  alpha amylase catalytic region  41.77 
 
 		 554 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0387802 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2596  alpha amylase, catalytic region  43.85 
 
 		 558 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0937  alpha amylase domain-containing protein  43.67 
 
 		 548 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2083  alpha amylase catalytic region  42.25 
 
 		 541 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.583803 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0624  alpha amylase catalytic region  41.67 
 
 		 570 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00268544  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0315  alpha amylase catalytic region  41.8 
 
 		 555 aa  443  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.906298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8808  alpha amylase, catalytic region  42.99 
 
 		 552 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3723  alpha amylase, catalytic region  42.23 
 
 		 559 aa  432  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0922665 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4088  alpha amylase, catalytic region  43.3 
 
 		 563 aa  429  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4981  alpha amylase, catalytic region  39.86 
 
 		 559 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4598  alpha amylase, catalytic region  39.68 
 
 		 559 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541891  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4686  alpha amylase, catalytic region  39.68 
 
 		 559 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3106  trehalose synthase  42.44 
 
 		 535 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0151531  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  39.71 
 
 		 548 aa  405  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3469  trehalose synthase/ maltokinase-like  39.59 
 
 		 1112 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  39.59 
 
 		 1111 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  40.96 
 
 		 1164 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  40.96 
 
 		 1164 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_003296  RS05183  hypothetical protein  40.59 
 
 		 1160 aa  395  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0584538  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  40.3 
 
 		 1119 aa  394  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  40.11 
 
 		 1108 aa  394  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0587  alpha amylase catalytic region  42.07 
 
 		 552 aa  390  1e-107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.504326 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  38.82 
 
 		 1104 aa  391  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  39.56 
 
 		 1139 aa  391  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1404  Alpha amylase, catalytic region  41.24 
 
 		 1100 aa  390  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  38.48 
 
 		 1092 aa  391  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  39.48 
 
 		 1130 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  38.26 
 
 		 1102 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  38.48 
 
 		 1088 aa  385  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  38.66 
 
 		 1088 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  37.75 
 
 		 606 aa  387  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1172  alpha amylase domain-containing protein  39.55 
 
 		 1095 aa  386  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  39.06 
 
 		 1113 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  38.56 
 
 		 1109 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  38.66 
 
 		 1088 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  39.37 
 
 		 1093 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  37.5 
 
 		 1114 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  38.48 
 
 		 1088 aa  385  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  38.48 
 
 		 1088 aa  385  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  38.66 
 
 		 1108 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  38.84 
 
 		 1108 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  38.57 
 
 		 1121 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  38.26 
 
 		 1102 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  38.32 
 
 		 1110 aa  383  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  39.37 
 
 		 1093 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1485  trehalose synthase-like  38.45 
 
 		 1108 aa  383  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  38.01 
 
 		 1085 aa  383  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  38.26 
 
 		 1102 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  37.15 
 
 		 562 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  39.38 
 
 		 1110 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  39.18 
 
 		 1116 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  38 
 
 		 556 aa  381  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  36.9 
 
 		 551 aa  381  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  38.64 
 
 		 1100 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0211  trehalose synthase  37.22 
 
 		 1105 aa  376  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  37.94 
 
 		 1123 aa  375  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  38.01 
 
 		 1152 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  38.45 
 
 		 1100 aa  378  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  38.82 
 
 		 1098 aa  379  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  38.62 
 
 		 1116 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  38.38 
 
 		 1154 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  38.12 
 
 		 1088 aa  376  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  38.19 
 
 		 1154 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  38.56 
 
 		 1121 aa  379  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  37.52 
 
 		 1115 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  38.93 
 
 		 1136 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  37.89 
 
 		 591 aa  378  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  39.3 
 
 		 1061 aa  378  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3263  trehalose synthase  36.9 
 
 		 1121 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  38.45 
 
 		 1098 aa  378  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  38.82 
 
 		 1094 aa  377  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  37.98 
 
 		 1106 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  38.75 
 
 		 1137 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  38.93 
 
 		 1137 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  38.38 
 
 		 1131 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  38.56 
 
 		 1131 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  38.75 
 
 		 1137 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36730  putative trehalose synthase  39.49 
 
 		 1100 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.631838 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  38.12 
 
 		 1099 aa  374  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  38.75 
 
 		 1137 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  37.82 
 
 		 1142 aa  375  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  38.56 
 
 		 1131 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  38.56 
 
 		 1131 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  38.56 
 
 		 1131 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>