113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B1157 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1719  alpha amylase catalytic region  88.46 
 
 		 495 aa  922    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2526  cytoplasmic alpha-amylase  83.2 
 
 		 495 aa  879    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2027  cytoplasmic alpha-amylase  88.46 
 
 		 495 aa  922    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2162  cytoplasmic alpha-amylase  88.46 
 
 		 495 aa  922    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1387  cytoplasmic alpha-amylase  64.5 
 
 		 496 aa  685    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1712  cytoplasmic alpha-amylase  88.46 
 
 		 495 aa  922    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1254  cytoplasmic alpha-amylase  88.46 
 
 		 495 aa  922    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.345137 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1057  cytoplasmic alpha-amylase  88.26 
 
 		 495 aa  921    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0627984  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2125  cytoplasmic alpha-amylase  99.39 
 
 		 494 aa  1028    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.172028  hitchhiker  0.0000021601 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2178  cytoplasmic alpha-amylase  99.19 
 
 		 494 aa  1026    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170616  normal  0.0297459 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2120  cytoplasmic alpha-amylase  99.19 
 
 		 494 aa  1027    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.070724  normal  0.352748 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1157  cytoplasmic alpha-amylase  100 
 
 		 494 aa  1033    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00381479  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1280  cytoplasmic alpha-amylase  99.19 
 
 		 494 aa  1027    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0337681  normal  0.462612 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2702  cytoplasmic alpha-amylase  88.26 
 
 		 495 aa  920    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.363407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2176  cytoplasmic alpha-amylase  50.72 
 
 		 488 aa  539  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2409  cytoplasmic alpha-amylase  49.9 
 
 		 494 aa  499  1e-140  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1263  alpha amylase catalytic region  49.8 
 
 		 499 aa  481  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.796062 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000056  cytoplasmic alpha-amylase  46.12 
 
 		 507 aa  437  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0351894  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05679  cytoplasmic alpha-amylase  45.62 
 
 		 507 aa  434  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1800  alpha amylase, catalytic region  43.79 
 
 		 627 aa  426  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.847837  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3273  cytoplasmic alpha-amylase  43.99 
 
 		 549 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2808  alpha amylase catalytic region  43.7 
 
 		 481 aa  416  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00730774  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3249  alpha amylase catalytic region  43.09 
 
 		 480 aa  410  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3508  cytoplasmic alpha-amylase  43.41 
 
 		 513 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0708  cytoplasmic alpha-amylase  43.58 
 
 		 488 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0434693  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3291  cytoplasmic alpha-amylase  43.2 
 
 		 513 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000922062  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3551  cytoplasmic alpha-amylase  43.2 
 
 		 513 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1500  cytoplasmic alpha-amylase  44.42 
 
 		 483 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3200  cytoplasmic alpha-amylase  43.61 
 
 		 513 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.570134  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1812  cytoplasmic alpha-amylase  41.97 
 
 		 492 aa  408  1.0000000000000001e-112  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0328907  normal  0.0314505 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3487  cytoplasmic alpha-amylase  43.41 
 
 		 513 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3261  cytoplasmic alpha-amylase  43 
 
 		 513 aa  404  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0208363  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1758  cytoplasmic alpha-amylase  43.2 
 
 		 513 aa  405  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591182  normal  0.938186 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2394  cytoplasmic alpha-amylase  40.98 
 
 		 472 aa  375  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04200  alpha-amylase, putative  41.33 
 
 		 486 aa  367  1e-100  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917737  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1537  cytoplasmic alpha-amylase  38.49 
 
 		 483 aa  348  1e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0143259  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03309  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15150)  37.4 
 
 		 576 aa  324  2e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.979768  normal  0.838039 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18240  cytoplasmic alpha-amylase  35.7 
 
 		 623 aa  265  2e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1139  cytoplasmic alpha-amylase  35.94 
 
 		 516 aa  260  5.0000000000000005e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18730  cytoplasmic alpha-amylase  28.04 
 
 		 442 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0631  cytoplasmic alpha-amylase  26.02 
 
 		 469 aa  156  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1948  cytoplasmic alpha-amylase  26.28 
 
 		 479 aa  152  8.999999999999999e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581984  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00080  alpha-amylase  25.61 
 
 		 456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.52316  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02410  alpha amylase  26.49 
 
 		 364 aa  87.8  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18258  predicted protein  23.83 
 
 		 517 aa  75.5  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46693  predicted protein  24.55 
 
 		 979 aa  67.4  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.649333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0563  Alpha-amylase  22.8 
 
 		 607 aa  63.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.611678  normal  0.295943 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  23.94 
 
 		 510 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36075  predicted protein  23.6 
 
 		 447 aa  61.6  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00709127  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  21.49 
 
 		 462 aa  59.7  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  24.32 
 
 		 511 aa  59.7  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  23.19 
 
 		 642 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  25.59 
 
 		 541 aa  57.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  26.39 
 
 		 545 aa  57  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  25.59 
 
 		 541 aa  57  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35756  predicted protein  22.84 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.558305 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  24.46 
 
 		 499 aa  55.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  21.48 
 
 		 649 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  23.33 
 
 		 600 aa  55.1  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  22.24 
 
 		 739 aa  55.1  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01890  cyclomaltodextrin glucanotransferase  22.36 
 
 		 564 aa  54.7  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4138  periplasmic alpha-amylase precursor  23.64 
 
 		 687 aa  52.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  23.11 
 
 		 614 aa  52.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0016  periplasmic alpha-amylase precursor  23.64 
 
 		 687 aa  53.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.24938  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  20.7 
 
 		 767 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002001  periplasmic alpha-amylase  21.81 
 
 		 694 aa  51.6  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  32.29 
 
 		 1363 aa  51.2  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3790  periplasmic alpha-amylase precursor  23.64 
 
 		 687 aa  51.2  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  25.1 
 
 		 555 aa  51.2  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  24.33 
 
 		 583 aa  51.6  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  25.21 
 
 		 555 aa  50.4  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  20.79 
 
 		 1527 aa  48.9  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1603  alpha amylase catalytic region  32.93 
 
 		 554 aa  49.3  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000968128  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  26.42 
 
 		 524 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2135  alpha amylase, catalytic region  21.93 
 
 		 665 aa  48.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.269478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  26.29 
 
 		 703 aa  47.8  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  22.39 
 
 		 1942 aa  47.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1785  alpha amylase, catalytic region  22.99 
 
 		 639 aa  47.4  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48062  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  24 
 
 		 488 aa  47  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  22 
 
 		 2068 aa  47  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  21.05 
 
 		 509 aa  47  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  21.01 
 
 		 815 aa  46.6  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0586  alpha amylase catalytic region  32.98 
 
 		 479 aa  46.6  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.532649  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3951  periplasmic alpha-amylase precursor  22.74 
 
 		 676 aa  46.2  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3095  alpha amylase catalytic region  22.25 
 
 		 441 aa  46.6  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  20.92 
 
 		 610 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1887  alpha amylase, catalytic region  24.8 
 
 		 654 aa  45.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3915  alpha amylase catalytic region  22.87 
 
 		 662 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0962846 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4068  periplasmic alpha-amylase precursor  22.44 
 
 		 676 aa  45.8  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4947  periplasmic alpha-amylase precursor  22.01 
 
 		 676 aa  45.8  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.876495  normal  0.214816 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04843  Putative alpha-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B3N7]  21.62 
 
 		 591 aa  45.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145231  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  18.71 
 
 		 561 aa  45.1  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04858  periplasmic alpha-amylase precursor  20.17 
 
 		 686 aa  44.3  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  25.29 
 
 		 723 aa  44.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  25.7 
 
 		 439 aa  44.3  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0139  alpha amylase catalytic region  22.01 
 
 		 676 aa  44.3  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  29.7 
 
 		 596 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  29.7 
 
 		 596 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3774  periplasmic alpha-amylase precursor  22.01 
 
 		 676 aa  44.3  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0143  periplasmic alpha-amylase precursor  22.01 
 
 		 676 aa  44.3  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>