More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4604 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0315  alpha amylase catalytic region  71.2 
 
 		 555 aa  828    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.906298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2083  alpha amylase catalytic region  57.56 
 
 		 541 aa  657    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.583803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4604  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 554 aa  1135    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0894643  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1908  alpha amylase catalytic region  73.29 
 
 		 553 aa  856    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.834785  normal  0.122197 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1968  alpha amylase catalytic region  69.91 
 
 		 554 aa  815    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2115  alpha amylase catalytic region  72.74 
 
 		 553 aa  852    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  0.0296214 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5237  alpha amylase catalytic region  72.61 
 
 		 554 aa  842    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0387802 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2621  alpha amylase catalytic region  88.09 
 
 		 554 aa  1014    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5642  alpha amylase catalytic region  57.06 
 
 		 540 aa  653    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000211534  normal  0.444192 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8020  trehalose synthase  70.4 
 
 		 553 aa  825    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3928  alpha amylase catalytic region  52.93 
 
 		 544 aa  596  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3114  alpha amylase catalytic region  52.49 
 
 		 579 aa  594  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0624  alpha amylase catalytic region  50.83 
 
 		 570 aa  570  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00268544  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1579  alpha amylase catalytic region  51.2 
 
 		 543 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125982 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3225  alpha amylase catalytic region  49.37 
 
 		 564 aa  528  1e-148  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.262228  hitchhiker  0.0000603449 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3079  alpha amylase catalytic region  48.99 
 
 		 556 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493465  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2596  alpha amylase, catalytic region  48.44 
 
 		 558 aa  512  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0937  alpha amylase domain-containing protein  48.26 
 
 		 548 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2978  alpha amylase, catalytic region  47.99 
 
 		 548 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.533119  normal  0.0820165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3708  alpha amylase catalytic region  48.71 
 
 		 521 aa  506  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8808  alpha amylase, catalytic region  48.28 
 
 		 552 aa  501  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4088  alpha amylase, catalytic region  48.56 
 
 		 563 aa  499  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3723  alpha amylase, catalytic region  47.17 
 
 		 559 aa  495  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0922665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4981  alpha amylase, catalytic region  47.07 
 
 		 559 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4598  alpha amylase, catalytic region  46.7 
 
 		 559 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541891  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4686  alpha amylase, catalytic region  46.7 
 
 		 559 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  43.43 
 
 		 548 aa  459  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3686  alpha amylase, catalytic region  44.24 
 
 		 540 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12163  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  42.86 
 
 		 551 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  41.18 
 
 		 1104 aa  444  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  42.73 
 
 		 1093 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  42.93 
 
 		 556 aa  444  1e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  42.7 
 
 		 1093 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  41.07 
 
 		 1085 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1172  alpha amylase domain-containing protein  42.83 
 
 		 1095 aa  439  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  42.2 
 
 		 1100 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  42.73 
 
 		 553 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  41.33 
 
 		 1092 aa  437  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  41.58 
 
 		 553 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  41.99 
 
 		 1121 aa  438  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  41.59 
 
 		 1088 aa  436  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  42.38 
 
 		 1102 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  42.57 
 
 		 551 aa  438  1e-121  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  43.49 
 
 		 1061 aa  437  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  41.08 
 
 		 1094 aa  432  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  41.58 
 
 		 572 aa  435  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  41.76 
 
 		 572 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  41.64 
 
 		 1088 aa  434  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  42.67 
 
 		 601 aa  435  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  41.64 
 
 		 1088 aa  434  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  41.11 
 
 		 1123 aa  430  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4038  alpha amylase catalytic region  44.61 
 
 		 544 aa  429  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0583407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  40.99 
 
 		 1121 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  42.01 
 
 		 1102 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2310  trehalose synthase  43.49 
 
 		 1098 aa  430  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.178439  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  42.22 
 
 		 1102 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  41.47 
 
 		 591 aa  427  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  41.13 
 
 		 1130 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  41.13 
 
 		 606 aa  427  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  41.44 
 
 		 1101 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  39.63 
 
 		 1112 aa  426  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  41.61 
 
 		 1099 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  41.28 
 
 		 1088 aa  427  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  40.67 
 
 		 1088 aa  427  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  42.91 
 
 		 1114 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  40.55 
 
 		 1100 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  42.29 
 
 		 1110 aa  426  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  41.25 
 
 		 556 aa  427  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  40.73 
 
 		 562 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  44.6 
 
 		 1108 aa  423  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  40.67 
 
 		 1088 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  42.97 
 
 		 1113 aa  422  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1404  Alpha amylase, catalytic region  44.89 
 
 		 1100 aa  424  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  40.74 
 
 		 1154 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  41.79 
 
 		 572 aa  423  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  40.33 
 
 		 1115 aa  423  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  41.7 
 
 		 1136 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3263  trehalose synthase  43.99 
 
 		 1121 aa  423  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  39.78 
 
 		 1109 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  40.37 
 
 		 1152 aa  421  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  40.37 
 
 		 1154 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4101  trehalose synthase  41.1 
 
 		 610 aa  420  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  43.85 
 
 		 1119 aa  420  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  40.88 
 
 		 577 aa  419  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10330  trehalose synthase  42.16 
 
 		 588 aa  421  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  39.71 
 
 		 1100 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  42.86 
 
 		 1111 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05183  hypothetical protein  42.33 
 
 		 1160 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0584538  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  41.47 
 
 		 1139 aa  416  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1208  alpha amylase  40.66 
 
 		 1094 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  40.96 
 
 		 1138 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  40.55 
 
 		 1098 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  42.33 
 
 		 1164 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3679  trehalose synthase-like  41.28 
 
 		 574 aa  417  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  40.77 
 
 		 1137 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0240  trehalose synthase  40.37 
 
 		 1105 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  41.49 
 
 		 571 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  41.08 
 
 		 1101 aa  417  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  41.7 
 
 		 1131 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  41.7 
 
 		 1131 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>