More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_02410 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_02410  alpha amylase  100 
 
 		 364 aa  757    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18730  cytoplasmic alpha-amylase  43.87 
 
 		 442 aa  291  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0631  cytoplasmic alpha-amylase  34.04 
 
 		 469 aa  191  1e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1948  cytoplasmic alpha-amylase  33.97 
 
 		 479 aa  185  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581984  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00080  alpha-amylase  33.43 
 
 		 456 aa  176  4e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.52316  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18240  cytoplasmic alpha-amylase  29.52 
 
 		 623 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1139  cytoplasmic alpha-amylase  28.65 
 
 		 516 aa  131  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3273  cytoplasmic alpha-amylase  28.89 
 
 		 549 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3508  cytoplasmic alpha-amylase  27.7 
 
 		 513 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3291  cytoplasmic alpha-amylase  27.93 
 
 		 513 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000922062  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3551  cytoplasmic alpha-amylase  27.93 
 
 		 513 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3261  cytoplasmic alpha-amylase  27.46 
 
 		 513 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0208363  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3487  cytoplasmic alpha-amylase  27.23 
 
 		 513 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1758  cytoplasmic alpha-amylase  27.23 
 
 		 513 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591182  normal  0.938186 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3200  cytoplasmic alpha-amylase  27 
 
 		 513 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.570134  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1537  cytoplasmic alpha-amylase  26.49 
 
 		 483 aa  116  6e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0143259  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1812  cytoplasmic alpha-amylase  26.49 
 
 		 492 aa  115  8.999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0328907  normal  0.0314505 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3249  alpha amylase catalytic region  27.27 
 
 		 480 aa  113  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2808  alpha amylase catalytic region  26.72 
 
 		 481 aa  113  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00730774  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35756  predicted protein  25.9 
 
 		 410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.558305 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46693  predicted protein  25.95 
 
 		 979 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.649333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1800  alpha amylase, catalytic region  25.67 
 
 		 627 aa  110  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.847837  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2409  cytoplasmic alpha-amylase  28.22 
 
 		 494 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0708  cytoplasmic alpha-amylase  27.79 
 
 		 488 aa  109  6e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0434693  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2394  cytoplasmic alpha-amylase  27.37 
 
 		 472 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1387  cytoplasmic alpha-amylase  26.59 
 
 		 496 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2176  cytoplasmic alpha-amylase  26.3 
 
 		 488 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05679  cytoplasmic alpha-amylase  26.92 
 
 		 507 aa  107  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36075  predicted protein  24.69 
 
 		 447 aa  106  6e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00709127  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000056  cytoplasmic alpha-amylase  26.1 
 
 		 507 aa  105  9e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0351894  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18258  predicted protein  25.46 
 
 		 517 aa  101  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  27.06 
 
 		 524 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1263  alpha amylase catalytic region  27.32 
 
 		 499 aa  99.8  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.796062 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04200  alpha-amylase, putative  26.58 
 
 		 486 aa  93.6  5e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917737  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  26.88 
 
 		 462 aa  90.1  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0563  Alpha-amylase  23.77 
 
 		 607 aa  90.1  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.611678  normal  0.295943 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1280  cytoplasmic alpha-amylase  26.76 
 
 		 494 aa  89.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0337681  normal  0.462612 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2125  cytoplasmic alpha-amylase  26.76 
 
 		 494 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.172028  hitchhiker  0.0000021601 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2120  cytoplasmic alpha-amylase  26.76 
 
 		 494 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.070724  normal  0.352748 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1157  cytoplasmic alpha-amylase  26.49 
 
 		 494 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00381479  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2178  cytoplasmic alpha-amylase  26.02 
 
 		 494 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170616  normal  0.0297459 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1500  cytoplasmic alpha-amylase  24.81 
 
 		 483 aa  85.5  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  25.17 
 
 		 532 aa  84  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2526  cytoplasmic alpha-amylase  25.41 
 
 		 495 aa  83.2  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  27.55 
 
 		 490 aa  81.3  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03308  conserved hypothetical protein. (Eurofung)  24.33 
 
 		 552 aa  78.6  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77903  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1719  alpha amylase catalytic region  25.88 
 
 		 495 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02760  Alpha-amylase A precursor, putative  23.31 
 
 		 572 aa  78.2  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1254  cytoplasmic alpha-amylase  25.88 
 
 		 495 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.345137 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2162  cytoplasmic alpha-amylase  25.88 
 
 		 495 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2027  cytoplasmic alpha-amylase  25.88 
 
 		 495 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2702  cytoplasmic alpha-amylase  25.88 
 
 		 495 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.363407 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  23.44 
 
 		 559 aa  77.4  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1057  cytoplasmic alpha-amylase  25.88 
 
 		 495 aa  77.4  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0627984  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1712  cytoplasmic alpha-amylase  25.88 
 
 		 495 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  27.04 
 
 		 555 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  24.55 
 
 		 610 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  27.02 
 
 		 1021 aa  74.7  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  27.04 
 
 		 555 aa  74.3  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  23.02 
 
 		 623 aa  73.9  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  25.28 
 
 		 511 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3374  alpha amylase catalytic region  26.1 
 
 		 453 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2728  alpha amylase catalytic region  25.3 
 
 		 453 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  24 
 
 		 439 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03309  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15150)  35.64 
 
 		 576 aa  72  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.979768  normal  0.838039 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0827  alpha amylase catalytic region  27.07 
 
 		 687 aa  70.5  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3136  glucan 1,4-alpha-maltotetraohydrolase  23.12 
 
 		 555 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.815174  hitchhiker  0.00720592 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  26.64 
 
 		 620 aa  70.1  0.00000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  23.56 
 
 		 521 aa  69.3  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1785  alpha amylase, catalytic region  22.67 
 
 		 639 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48062  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4716  alpha amylase catalytic region  25.38 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  23.53 
 
 		 815 aa  66.2  0.0000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  25.17 
 
 		 588 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1660  alpha amylase, catalytic region  22.55 
 
 		 683 aa  65.5  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  24.91 
 
 		 510 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0201  alpha amylase catalytic region  23.71 
 
 		 513 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213687  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  27.75 
 
 		 575 aa  64.3  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  23.33 
 
 		 586 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  21.55 
 
 		 586 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  23 
 
 		 586 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  23.33 
 
 		 586 aa  62.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3337  Glycosidase-like protein  24.15 
 
 		 679 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543706  normal  0.14646 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1727  alpha amylase catalytic region  23.69 
 
 		 454 aa  62.4  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000518329  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1176  alpha amylase catalytic region  22.8 
 
 		 647 aa  62.4  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  26.91 
 
 		 715 aa  62  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  21.84 
 
 		 586 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0834  alpha amylase catalytic region  40 
 
 		 650 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  26.46 
 
 		 499 aa  60.5  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  21.55 
 
 		 586 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  21.55 
 
 		 586 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  21.55 
 
 		 586 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  21.55 
 
 		 586 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0951  alpha amylase, catalytic region  41.33 
 
 		 655 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3112  alpha amylase protein  26.11 
 
 		 535 aa  60.1  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.364914  normal  0.605124 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  27.89 
 
 		 1114 aa  60.1  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  23.1 
 
 		 477 aa  60.1  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0990  alpha amylase all-beta  25.97 
 
 		 654 aa  59.7  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0847  alpha amylase all-beta  29.01 
 
 		 684 aa  59.7  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  24.58 
 
 		 703 aa  59.3  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3708  alpha amylase catalytic region  42.67 
 
 		 521 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>