More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1139 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1139  cytoplasmic alpha-amylase  100 
 
 		 516 aa  1054    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18240  cytoplasmic alpha-amylase  66.12 
 
 		 623 aa  664    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3273  cytoplasmic alpha-amylase  40.9 
 
 		 549 aa  330  4e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05679  cytoplasmic alpha-amylase  40.16 
 
 		 507 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3291  cytoplasmic alpha-amylase  38.21 
 
 		 513 aa  307  3e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000922062  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3551  cytoplasmic alpha-amylase  38.21 
 
 		 513 aa  307  3e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3261  cytoplasmic alpha-amylase  38.02 
 
 		 513 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0208363  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3508  cytoplasmic alpha-amylase  38.21 
 
 		 513 aa  306  6e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3487  cytoplasmic alpha-amylase  37.64 
 
 		 513 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1758  cytoplasmic alpha-amylase  37.83 
 
 		 513 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591182  normal  0.938186 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3200  cytoplasmic alpha-amylase  39.55 
 
 		 513 aa  301  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.570134  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000056  cytoplasmic alpha-amylase  38.52 
 
 		 507 aa  300  3e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0351894  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1800  alpha amylase, catalytic region  37.52 
 
 		 627 aa  293  4e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.847837  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2808  alpha amylase catalytic region  38.25 
 
 		 481 aa  280  4e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00730774  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3249  alpha amylase catalytic region  37.65 
 
 		 480 aa  278  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2409  cytoplasmic alpha-amylase  37.47 
 
 		 494 aa  266  8.999999999999999e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1263  alpha amylase catalytic region  34.38 
 
 		 499 aa  265  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.796062 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1812  cytoplasmic alpha-amylase  34.94 
 
 		 492 aa  261  2e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0328907  normal  0.0314505 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2702  cytoplasmic alpha-amylase  35.94 
 
 		 495 aa  260  4e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.363407 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2162  cytoplasmic alpha-amylase  35.94 
 
 		 495 aa  260  4e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1254  cytoplasmic alpha-amylase  35.94 
 
 		 495 aa  260  4e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.345137 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2027  cytoplasmic alpha-amylase  35.94 
 
 		 495 aa  260  4e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1500  cytoplasmic alpha-amylase  36.27 
 
 		 483 aa  260  5.0000000000000005e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1157  cytoplasmic alpha-amylase  35.94 
 
 		 494 aa  260  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00381479  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1719  alpha amylase catalytic region  35.94 
 
 		 495 aa  259  6e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1280  cytoplasmic alpha-amylase  35.94 
 
 		 494 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0337681  normal  0.462612 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2178  cytoplasmic alpha-amylase  35.94 
 
 		 494 aa  259  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170616  normal  0.0297459 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1712  cytoplasmic alpha-amylase  35.94 
 
 		 495 aa  259  9e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2120  cytoplasmic alpha-amylase  35.74 
 
 		 494 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.070724  normal  0.352748 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2125  cytoplasmic alpha-amylase  35.74 
 
 		 494 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.172028  hitchhiker  0.0000021601 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1057  cytoplasmic alpha-amylase  35.74 
 
 		 495 aa  258  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0627984  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2176  cytoplasmic alpha-amylase  33.79 
 
 		 488 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0708  cytoplasmic alpha-amylase  34.18 
 
 		 488 aa  251  2e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0434693  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1387  cytoplasmic alpha-amylase  33.66 
 
 		 496 aa  249  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1537  cytoplasmic alpha-amylase  36.64 
 
 		 483 aa  248  2e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0143259  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2526  cytoplasmic alpha-amylase  33.8 
 
 		 495 aa  247  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2394  cytoplasmic alpha-amylase  34.22 
 
 		 472 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04200  alpha-amylase, putative  33.27 
 
 		 486 aa  221  3e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917737  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18730  cytoplasmic alpha-amylase  32.73 
 
 		 442 aa  214  3.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03309  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15150)  31.84 
 
 		 576 aa  208  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.979768  normal  0.838039 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0631  cytoplasmic alpha-amylase  29.3 
 
 		 469 aa  162  1e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00080  alpha-amylase  29.29 
 
 		 456 aa  152  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.52316  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1948  cytoplasmic alpha-amylase  29.79 
 
 		 479 aa  148  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581984  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02410  alpha amylase  28.65 
 
 		 364 aa  131  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18258  predicted protein  25.18 
 
 		 517 aa  124  3e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35756  predicted protein  24.09 
 
 		 410 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.558305 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0563  Alpha-amylase  24.19 
 
 		 607 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.611678  normal  0.295943 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46693  predicted protein  25.71 
 
 		 979 aa  102  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.649333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36075  predicted protein  23.93 
 
 		 447 aa  87.4  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00709127  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  27.11 
 
 		 510 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  27.25 
 
 		 511 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3136  glucan 1,4-alpha-maltotetraohydrolase  27.27 
 
 		 555 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.815174  hitchhiker  0.00720592 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  27.22 
 
 		 545 aa  78.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  25 
 
 		 593 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  27.52 
 
 		 541 aa  77.4  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  26.7 
 
 		 541 aa  77.4  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0201  alpha amylase catalytic region  21.92 
 
 		 513 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213687  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  25.07 
 
 		 599 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  23.6 
 
 		 532 aa  73.2  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0833  Alpha amylase, catalytic region  24.95 
 
 		 617 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72167 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  23.14 
 
 		 439 aa  73.2  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  22.68 
 
 		 462 aa  72.4  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4716  alpha amylase catalytic region  23.41 
 
 		 458 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2636  alpha-amylase family protein  27.19 
 
 		 617 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  24.29 
 
 		 555 aa  68.2  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  24.29 
 
 		 555 aa  68.2  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  26.04 
 
 		 1942 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  24.48 
 
 		 614 aa  65.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  23.68 
 
 		 499 aa  65.5  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.26 
 
 		 1855 aa  64.7  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  24.37 
 
 		 815 aa  63.9  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  24.21 
 
 		 509 aa  63.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0930  alpha amylase catalytic region  24.47 
 
 		 614 aa  63.5  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  23.4 
 
 		 533 aa  63.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  22.11 
 
 		 622 aa  62.8  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  28.16 
 
 		 562 aa  62.4  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2654  alpha amylase catalytic region  24.08 
 
 		 461 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.181273  normal  0.26185 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0834  alpha amylase catalytic region  23.26 
 
 		 650 aa  61.6  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4292  Alpha-amylase A precursor (1,4-alpha-D-glucan glucanohydrolase)  22.19 
 
 		 528 aa  61.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2418  trehalose synthase  27.62 
 
 		 591 aa  61.2  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.482185  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  25.07 
 
 		 619 aa  60.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  28.71 
 
 		 1114 aa  60.5  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0191  glycosy hydrolase family protein  23.36 
 
 		 534 aa  60.1  0.00000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  24.35 
 
 		 836 aa  59.7  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  25.88 
 
 		 596 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  24.72 
 
 		 654 aa  60.1  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  25.88 
 
 		 596 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  25.88 
 
 		 596 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3915  alpha amylase catalytic region  23.12 
 
 		 662 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0962846 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.2 
 
 		 1891 aa  58.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1887  alpha amylase catalytic region  22.6 
 
 		 659 aa  58.5  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114905  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  21.95 
 
 		 623 aa  58.5  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  23.6 
 
 		 544 aa  58.2  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  22.16 
 
 		 566 aa  58.2  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  22.96 
 
 		 555 aa  57.8  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  22.67 
 
 		 561 aa  57.4  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  25.08 
 
 		 925 aa  57.4  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  24.18 
 
 		 600 aa  57  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  26.15 
 
 		 567 aa  57  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  25.35 
 
 		 526 aa  56.6  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>