More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1800 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3273  cytoplasmic alpha-amylase  60.45 
 
 		 549 aa  652    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05679  cytoplasmic alpha-amylase  63.6 
 
 		 507 aa  656    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000056  cytoplasmic alpha-amylase  63.58 
 
 		 507 aa  655    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0351894  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1800  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 627 aa  1303    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.847837  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3200  cytoplasmic alpha-amylase  54.6 
 
 		 513 aa  592  1e-168  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.570134  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3508  cytoplasmic alpha-amylase  54.11 
 
 		 513 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3291  cytoplasmic alpha-amylase  53.92 
 
 		 513 aa  580  1e-164  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000922062  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3261  cytoplasmic alpha-amylase  53.45 
 
 		 513 aa  580  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0208363  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3551  cytoplasmic alpha-amylase  53.92 
 
 		 513 aa  580  1e-164  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3487  cytoplasmic alpha-amylase  53.07 
 
 		 513 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1758  cytoplasmic alpha-amylase  52.87 
 
 		 513 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591182  normal  0.938186 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2394  cytoplasmic alpha-amylase  51.13 
 
 		 472 aa  490  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2176  cytoplasmic alpha-amylase  48.77 
 
 		 488 aa  486  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1812  cytoplasmic alpha-amylase  46.14 
 
 		 492 aa  459  9.999999999999999e-129  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0328907  normal  0.0314505 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2409  cytoplasmic alpha-amylase  46.04 
 
 		 494 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0708  cytoplasmic alpha-amylase  43.27 
 
 		 488 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0434693  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1263  alpha amylase catalytic region  45.84 
 
 		 499 aa  439  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.796062 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3249  alpha amylase catalytic region  43.81 
 
 		 480 aa  428  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1157  cytoplasmic alpha-amylase  43.79 
 
 		 494 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00381479  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2808  alpha amylase catalytic region  42.68 
 
 		 481 aa  426  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00730774  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2178  cytoplasmic alpha-amylase  43.58 
 
 		 494 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170616  normal  0.0297459 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2120  cytoplasmic alpha-amylase  43.79 
 
 		 494 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.070724  normal  0.352748 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2125  cytoplasmic alpha-amylase  43.58 
 
 		 494 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.172028  hitchhiker  0.0000021601 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2526  cytoplasmic alpha-amylase  43.58 
 
 		 495 aa  425  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2702  cytoplasmic alpha-amylase  43.47 
 
 		 495 aa  423  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.363407 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1500  cytoplasmic alpha-amylase  43.29 
 
 		 483 aa  422  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1280  cytoplasmic alpha-amylase  43.18 
 
 		 494 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0337681  normal  0.462612 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1719  alpha amylase catalytic region  43.27 
 
 		 495 aa  420  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1057  cytoplasmic alpha-amylase  43.27 
 
 		 495 aa  419  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0627984  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1712  cytoplasmic alpha-amylase  43.27 
 
 		 495 aa  421  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1254  cytoplasmic alpha-amylase  43.27 
 
 		 495 aa  422  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.345137 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2162  cytoplasmic alpha-amylase  43.27 
 
 		 495 aa  422  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2027  cytoplasmic alpha-amylase  43.27 
 
 		 495 aa  422  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1537  cytoplasmic alpha-amylase  41.41 
 
 		 483 aa  413  1e-114  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0143259  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1387  cytoplasmic alpha-amylase  43.74 
 
 		 496 aa  411  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04200  alpha-amylase, putative  41.43 
 
 		 486 aa  377  1e-103  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917737  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03309  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15150)  34.47 
 
 		 576 aa  320  6e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.979768  normal  0.838039 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18240  cytoplasmic alpha-amylase  38.24 
 
 		 623 aa  306  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1139  cytoplasmic alpha-amylase  36.45 
 
 		 516 aa  301  3e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18730  cytoplasmic alpha-amylase  28.63 
 
 		 442 aa  183  7e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1948  cytoplasmic alpha-amylase  28.05 
 
 		 479 aa  157  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581984  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00080  alpha-amylase  28.66 
 
 		 456 aa  150  5e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.52316  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0631  cytoplasmic alpha-amylase  26.42 
 
 		 469 aa  142  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02410  alpha amylase  25.67 
 
 		 364 aa  110  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2938  ATPase  30.61 
 
 		 563 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3136  glucan 1,4-alpha-maltotetraohydrolase  25.08 
 
 		 555 aa  108  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.815174  hitchhiker  0.00720592 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2478  alpha amylase catalytic region  25.92 
 
 		 612 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0194919  normal  0.119382 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4065  Alpha-amylase  56.67 
 
 		 596 aa  94.7  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540437  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0314  hypothetical protein  42.86 
 
 		 644 aa  89.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0822878 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2896  Alpha-amylase  23.12 
 
 		 722 aa  81.6  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.578872 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46693  predicted protein  23.96 
 
 		 979 aa  81.3  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.649333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2686  alpha amylase, catalytic region  43.88 
 
 		 722 aa  79  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288393 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18258  predicted protein  23.88 
 
 		 517 aa  77  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3337  Glycosidase-like protein  44.83 
 
 		 679 aa  76.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543706  normal  0.14646 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0930  alpha amylase catalytic region  22.86 
 
 		 614 aa  74.7  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  23.54 
 
 		 511 aa  74.3  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4685  alpha amylase catalytic region  49.45 
 
 		 738 aa  74.3  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0213  glucan 1,4- a-glucosidase  47.73 
 
 		 881 aa  73.9  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2529  glycoside hydrolase family protein  36.07 
 
 		 1010 aa  72.8  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  21.13 
 
 		 462 aa  72.4  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0985  alpha amylase domain-containing protein  23.4 
 
 		 605 aa  70.5  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0694969  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0289  glycosy hydrolase family protein  45.45 
 
 		 882 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  26.95 
 
 		 1017 aa  69.3  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1658  putative amylase  45.45 
 
 		 881 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3915  alpha amylase catalytic region  26.1 
 
 		 662 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0962846 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0200  putative glucan 1,4-alpha-glucosidase  45.45 
 
 		 882 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1130  alpha amylase catalytic region  41.03 
 
 		 566 aa  67.8  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2001  Alpha-amylase  25.79 
 
 		 589 aa  67.4  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357099  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  35.64 
 
 		 742 aa  67.4  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  24.36 
 
 		 1855 aa  66.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07402  glucoamylase (Eurofung)  43.43 
 
 		 661 aa  65.9  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  25.48 
 
 		 510 aa  64.3  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  23.5 
 
 		 439 aa  63.9  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  23.65 
 
 		 509 aa  63.9  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0104  alpha amylase catalytic region  23.04 
 
 		 653 aa  63.5  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  22.77 
 
 		 593 aa  63.5  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05463  conserved hypothetical protein  36.27 
 
 		 385 aa  63.2  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  23.29 
 
 		 593 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  24.92 
 
 		 622 aa  62  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  23.94 
 
 		 1005 aa  62.4  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  27.4 
 
 		 595 aa  61.2  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  22.22 
 
 		 599 aa  60.8  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  23.45 
 
 		 739 aa  60.8  0.00000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  21.07 
 
 		 838 aa  60.5  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  25.57 
 
 		 557 aa  60.5  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3722  alpha amylase, catalytic region  25.3 
 
 		 646 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2341  alpha amylase catalytic region  22.74 
 
 		 554 aa  60.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  23.1 
 
 		 1891 aa  58.9  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  21.11 
 
 		 586 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  24.37 
 
 		 541 aa  59.7  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  23.65 
 
 		 554 aa  59.7  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0417  oligo-1,6-glucosidase  22.41 
 
 		 554 aa  58.5  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5240  alpha amylase catalytic region  21.87 
 
 		 624 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4891  glycosyl hydrolase family protein  26.17 
 
 		 554 aa  58.5  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000186881  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0427  glycosyl hydrolase family protein  26.17 
 
 		 554 aa  58.5  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35756  predicted protein  21.43 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.558305 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0959  a-glucosidase  22.63 
 
 		 527 aa  58.2  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.766487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  24.37 
 
 		 541 aa  57.8  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  21.09 
 
 		 586 aa  57.4  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36075  predicted protein  22.5 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00709127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>