247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3200 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS3291  cytoplasmic alpha-amylase  92.2 
 
 
513 aa  988    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000922062  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3261  cytoplasmic alpha-amylase  91.81 
 
 
513 aa  984    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0208363  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1758  cytoplasmic alpha-amylase  91.23 
 
 
513 aa  980    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591182  normal  0.938186 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3551  cytoplasmic alpha-amylase  92.2 
 
 
513 aa  988    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3487  cytoplasmic alpha-amylase  91.81 
 
 
513 aa  983    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3273  cytoplasmic alpha-amylase  63.58 
 
 
549 aa  686    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3200  cytoplasmic alpha-amylase  100 
 
 
513 aa  1059    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.570134  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3508  cytoplasmic alpha-amylase  92.4 
 
 
513 aa  991    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1800  alpha amylase, catalytic region  54.6 
 
 
627 aa  587  1e-166  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.847837  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000056  cytoplasmic alpha-amylase  59.83 
 
 
507 aa  582  1.0000000000000001e-165  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0351894  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1812  cytoplasmic alpha-amylase  54.75 
 
 
492 aa  565  1e-160  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0328907  normal  0.0314505 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05679  cytoplasmic alpha-amylase  57.82 
 
 
507 aa  565  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3249  alpha amylase catalytic region  51.65 
 
 
480 aa  519  1e-146  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2808  alpha amylase catalytic region  51.86 
 
 
481 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00730774  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1500  cytoplasmic alpha-amylase  47.33 
 
 
483 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0708  cytoplasmic alpha-amylase  44.83 
 
 
488 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0434693  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1537  cytoplasmic alpha-amylase  47.07 
 
 
483 aa  443  1e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0143259  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2394  cytoplasmic alpha-amylase  45.55 
 
 
472 aa  436  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2176  cytoplasmic alpha-amylase  43.74 
 
 
488 aa  430  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2409  cytoplasmic alpha-amylase  44.51 
 
 
494 aa  430  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1263  alpha amylase catalytic region  45.84 
 
 
499 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.796062 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04200  alpha-amylase, putative  44.44 
 
 
486 aa  416  9.999999999999999e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917737  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2120  cytoplasmic alpha-amylase  43.61 
 
 
494 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.070724  normal  0.352748 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1157  cytoplasmic alpha-amylase  43.61 
 
 
494 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00381479  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2178  cytoplasmic alpha-amylase  43.81 
 
 
494 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170616  normal  0.0297459 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2125  cytoplasmic alpha-amylase  43.61 
 
 
494 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.172028  hitchhiker  0.0000021601 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1280  cytoplasmic alpha-amylase  43.2 
 
 
494 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0337681  normal  0.462612 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03309  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15150)  44.47 
 
 
576 aa  393  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.979768  normal  0.838039 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1719  alpha amylase catalytic region  41.78 
 
 
495 aa  389  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2702  cytoplasmic alpha-amylase  41.78 
 
 
495 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.363407 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1712  cytoplasmic alpha-amylase  41.78 
 
 
495 aa  389  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1254  cytoplasmic alpha-amylase  41.78 
 
 
495 aa  390  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.345137 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2027  cytoplasmic alpha-amylase  41.78 
 
 
495 aa  390  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2162  cytoplasmic alpha-amylase  41.78 
 
 
495 aa  390  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2526  cytoplasmic alpha-amylase  42.22 
 
 
495 aa  391  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1057  cytoplasmic alpha-amylase  41.58 
 
 
495 aa  387  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0627984  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1387  cytoplasmic alpha-amylase  42.13 
 
 
496 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18240  cytoplasmic alpha-amylase  43.03 
 
 
623 aa  330  3e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1139  cytoplasmic alpha-amylase  39.55 
 
 
516 aa  301  2e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18730  cytoplasmic alpha-amylase  29.63 
 
 
442 aa  176  8e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1948  cytoplasmic alpha-amylase  28.78 
 
 
479 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581984  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0631  cytoplasmic alpha-amylase  27.4 
 
 
469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02410  alpha amylase  27 
 
 
364 aa  120  7.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00080  alpha-amylase  36 
 
 
456 aa  90.9  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.52316  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18258  predicted protein  24.74 
 
 
517 aa  80.5  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46693  predicted protein  26.33 
 
 
979 aa  78.2  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.649333  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  25.73 
 
 
1017 aa  77.8  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36075  predicted protein  23.15 
 
 
447 aa  66.6  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00709127  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  22.34 
 
 
510 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.42 
 
 
1891 aa  65.9  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0959  a-glucosidase  23.85 
 
 
527 aa  65.5  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.766487  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  25.59 
 
 
524 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  34.82 
 
 
1363 aa  64.7  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  24.93 
 
 
439 aa  63.9  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  23.53 
 
 
599 aa  63.5  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  22.91 
 
 
838 aa  62.8  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.39 
 
 
1975 aa  62.4  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  23.28 
 
 
586 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  24.75 
 
 
1855 aa  62.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0568  alpha amylase catalytic region  23.34 
 
 
441 aa  61.6  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.489897  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  22.3 
 
 
511 aa  61.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  23.93 
 
 
1005 aa  61.2  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0554  alpha amylase, catalytic region  23.95 
 
 
441 aa  60.5  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0002426  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  23.73 
 
 
1942 aa  60.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  22.87 
 
 
1527 aa  59.7  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1887  alpha amylase catalytic region  24.69 
 
 
659 aa  58.9  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114905  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  27.72 
 
 
610 aa  58.9  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  21.19 
 
 
588 aa  59.3  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  22.41 
 
 
586 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3915  alpha amylase catalytic region  23.71 
 
 
662 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0962846 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  23.21 
 
 
586 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  23.21 
 
 
586 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  22.65 
 
 
532 aa  57.8  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0104  alpha amylase catalytic region  26.59 
 
 
653 aa  57.8  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  22.86 
 
 
586 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  27.42 
 
 
582 aa  56.2  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  27.17 
 
 
610 aa  56.6  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1728  trehalose synthase  20.85 
 
 
585 aa  56.6  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  25.08 
 
 
462 aa  55.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  23.67 
 
 
1114 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  23.36 
 
 
586 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  23.83 
 
 
595 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  23.36 
 
 
586 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  21.07 
 
 
561 aa  55.8  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  23.36 
 
 
586 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  23.36 
 
 
586 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  21.39 
 
 
1139 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10330  trehalose synthase  22.34 
 
 
588 aa  55.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163589  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  22.29 
 
 
586 aa  55.1  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  23.18 
 
 
614 aa  55.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3263  trehalose synthase  20.36 
 
 
1121 aa  55.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  22.8 
 
 
620 aa  55.1  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  23.25 
 
 
490 aa  54.3  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0563  Alpha-amylase  27.08 
 
 
607 aa  54.3  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.611678  normal  0.295943 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  23.26 
 
 
723 aa  54.3  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3722  alpha amylase, catalytic region  21.95 
 
 
646 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  22.17 
 
 
572 aa  54.3  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  23.08 
 
 
586 aa  53.9  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  19.89 
 
 
589 aa  53.5  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4292  Alpha-amylase A precursor (1,4-alpha-D-glucan glucanohydrolase)  24.21 
 
 
528 aa  53.5  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>