46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0201 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0201  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 513 aa  1056    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213687  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0563  Alpha-amylase  31.09 
 
 		 607 aa  177  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.611678  normal  0.295943 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35756  predicted protein  29.69 
 
 		 410 aa  169  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.558305 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18258  predicted protein  27.15 
 
 		 517 aa  152  1e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36075  predicted protein  30.23 
 
 		 447 aa  145  1e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00709127  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46693  predicted protein  30.29 
 
 		 979 aa  139  7.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.649333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3136  glucan 1,4-alpha-maltotetraohydrolase  26.48 
 
 		 555 aa  99  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.815174  hitchhiker  0.00720592 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00080  alpha-amylase  28.61 
 
 		 456 aa  97.8  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.52316  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18730  cytoplasmic alpha-amylase  26.3 
 
 		 442 aa  97.8  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18240  cytoplasmic alpha-amylase  25.44 
 
 		 623 aa  91.7  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0631  cytoplasmic alpha-amylase  26.62 
 
 		 469 aa  91.3  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1948  cytoplasmic alpha-amylase  27.01 
 
 		 479 aa  90.1  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581984  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1139  cytoplasmic alpha-amylase  21.92 
 
 		 516 aa  76.3  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02410  alpha amylase  23.71 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05679  cytoplasmic alpha-amylase  25.06 
 
 		 507 aa  56.6  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2526  cytoplasmic alpha-amylase  22.79 
 
 		 495 aa  55.5  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000056  cytoplasmic alpha-amylase  24.01 
 
 		 507 aa  51.6  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0351894  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0770  alpha amylase, catalytic region  22.36 
 
 		 455 aa  49.7  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0930  alpha amylase catalytic region  26.16 
 
 		 614 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2978  alpha amylase, catalytic region  25.89 
 
 		 548 aa  47.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.533119  normal  0.0820165 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1712  cytoplasmic alpha-amylase  22.78 
 
 		 495 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1719  alpha amylase catalytic region  22.78 
 
 		 495 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8808  alpha amylase, catalytic region  20.98 
 
 		 552 aa  47.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2162  cytoplasmic alpha-amylase  22.78 
 
 		 495 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2027  cytoplasmic alpha-amylase  22.78 
 
 		 495 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1254  cytoplasmic alpha-amylase  22.78 
 
 		 495 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.345137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3708  alpha amylase catalytic region  22.1 
 
 		 521 aa  47.4  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1263  alpha amylase catalytic region  21.55 
 
 		 499 aa  47.4  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.796062 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1537  cytoplasmic alpha-amylase  19.52 
 
 		 483 aa  47  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0143259  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3225  alpha amylase catalytic region  22.19 
 
 		 564 aa  46.2  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.262228  hitchhiker  0.0000603449 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1057  cytoplasmic alpha-amylase  22.83 
 
 		 495 aa  46.2  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0627984  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2702  cytoplasmic alpha-amylase  22.83 
 
 		 495 aa  46.2  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.363407 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2452  glycogen operon protein  26.99 
 
 		 689 aa  46.6  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1800  alpha amylase, catalytic region  23.15 
 
 		 627 aa  46.6  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.847837  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0708  cytoplasmic alpha-amylase  26.83 
 
 		 488 aa  45.8  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0434693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2596  alpha amylase, catalytic region  26.8 
 
 		 558 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1758  cytoplasmic alpha-amylase  20.79 
 
 		 513 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591182  normal  0.938186 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0937  alpha amylase domain-containing protein  26.8 
 
 		 548 aa  45.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1727  alpha amylase catalytic region  23.82 
 
 		 454 aa  44.7  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000518329  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  21.29 
 
 		 555 aa  44.7  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3487  cytoplasmic alpha-amylase  21.23 
 
 		 513 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1176  alpha amylase catalytic region  22 
 
 		 647 aa  44.3  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1387  cytoplasmic alpha-amylase  31.45 
 
 		 496 aa  44.3  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0545  alpha,alpha-phosphotrehalase  24.65 
 
 		 553 aa  43.5  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4685  alpha amylase catalytic region  26.86 
 
 		 738 aa  43.1  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31510  glycosidase  25.6 
 
 		 596 aa  43.5  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.382371  normal  0.756128 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>