More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2978 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0937  alpha amylase domain-containing protein  84.46 
 
 		 548 aa  968    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2596  alpha amylase, catalytic region  84.83 
 
 		 558 aa  973    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2978  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 548 aa  1125    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.533119  normal  0.0820165 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3079  alpha amylase catalytic region  56.28 
 
 		 556 aa  611  1e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493465  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8808  alpha amylase, catalytic region  54.83 
 
 		 552 aa  607  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3225  alpha amylase catalytic region  54.32 
 
 		 564 aa  601  1e-170  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.262228  hitchhiker  0.0000603449 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3708  alpha amylase catalytic region  54.63 
 
 		 521 aa  596  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4981  alpha amylase, catalytic region  53.47 
 
 		 559 aa  581  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4598  alpha amylase, catalytic region  53.1 
 
 		 559 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541891  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4686  alpha amylase, catalytic region  53.1 
 
 		 559 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4088  alpha amylase, catalytic region  52.96 
 
 		 563 aa  568  1e-161  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3723  alpha amylase, catalytic region  52.09 
 
 		 559 aa  568  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0922665 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3928  alpha amylase catalytic region  47.6 
 
 		 544 aa  548  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1908  alpha amylase catalytic region  47.79 
 
 		 553 aa  522  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.834785  normal  0.122197 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2115  alpha amylase catalytic region  47.13 
 
 		 553 aa  519  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  0.0296214 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1579  alpha amylase catalytic region  45.31 
 
 		 543 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125982 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2621  alpha amylase catalytic region  46.77 
 
 		 554 aa  509  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4604  alpha amylase catalytic region  47.99 
 
 		 554 aa  510  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0894643  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8020  trehalose synthase  46.58 
 
 		 553 aa  506  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0315  alpha amylase catalytic region  45.12 
 
 		 555 aa  503  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.906298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1968  alpha amylase catalytic region  45.94 
 
 		 554 aa  498  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2083  alpha amylase catalytic region  44.79 
 
 		 541 aa  498  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.583803 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5237  alpha amylase catalytic region  46.06 
 
 		 554 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0387802 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5642  alpha amylase catalytic region  45.29 
 
 		 540 aa  491  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000211534  normal  0.444192 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3114  alpha amylase catalytic region  44.61 
 
 		 579 aa  485  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0624  alpha amylase catalytic region  41.93 
 
 		 570 aa  472  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00268544  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3686  alpha amylase, catalytic region  45.16 
 
 		 540 aa  460  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12163  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  43.2 
 
 		 551 aa  443  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  41.93 
 
 		 548 aa  441  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3106  trehalose synthase  44.88 
 
 		 535 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0151531  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4038  alpha amylase catalytic region  42.75 
 
 		 544 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0583407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  42.61 
 
 		 556 aa  424  1e-117  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  39.89 
 
 		 591 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  40.83 
 
 		 1123 aa  416  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  40.82 
 
 		 572 aa  419  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1172  alpha amylase domain-containing protein  40.45 
 
 		 1095 aa  414  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  39.85 
 
 		 562 aa  413  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  39.82 
 
 		 1099 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  39.48 
 
 		 577 aa  410  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  39.59 
 
 		 1061 aa  410  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  39.07 
 
 		 1104 aa  410  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  38.53 
 
 		 1100 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  40.08 
 
 		 1100 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  39.82 
 
 		 1093 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  39.48 
 
 		 601 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  39.93 
 
 		 1093 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  39.63 
 
 		 606 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  41.39 
 
 		 551 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  38.07 
 
 		 1100 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  38.6 
 
 		 1088 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  38.49 
 
 		 1092 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  39.08 
 
 		 1100 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  39.56 
 
 		 1102 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  38.14 
 
 		 1088 aa  402  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  39.85 
 
 		 553 aa  405  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  38.14 
 
 		 1088 aa  402  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  39.01 
 
 		 1152 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  39.37 
 
 		 1121 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1208  alpha amylase  38.42 
 
 		 1094 aa  402  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  42.38 
 
 		 1138 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  39.27 
 
 		 682 aa  402  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3679  trehalose synthase-like  39.41 
 
 		 574 aa  404  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  41.62 
 
 		 1139 aa  404  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  38.15 
 
 		 1101 aa  405  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  39.56 
 
 		 1121 aa  402  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  41.75 
 
 		 1130 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  38.52 
 
 		 1109 aa  402  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  39.78 
 
 		 1137 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  39.12 
 
 		 1114 aa  402  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  39.44 
 
 		 1099 aa  404  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10330  trehalose synthase  40.4 
 
 		 588 aa  399  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  40.04 
 
 		 1110 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  38.75 
 
 		 1106 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  38.75 
 
 		 1106 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  38.72 
 
 		 1108 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  40.67 
 
 		 1101 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  38.9 
 
 		 1108 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  38.57 
 
 		 1113 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  39.84 
 
 		 1102 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1404  Alpha amylase, catalytic region  40.67 
 
 		 1100 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  38.7 
 
 		 1100 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  39.76 
 
 		 1102 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  37.96 
 
 		 1088 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  41.78 
 
 		 1137 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  41.78 
 
 		 1137 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  38.75 
 
 		 1106 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  39.78 
 
 		 1137 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  38.93 
 
 		 1105 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  41.78 
 
 		 1137 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  38.56 
 
 		 556 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  38.93 
 
 		 1142 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  40.94 
 
 		 1111 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  38.89 
 
 		 1100 aa  398  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  38.63 
 
 		 1098 aa  397  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  41.22 
 
 		 1131 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  39.92 
 
 		 1112 aa  395  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  38.73 
 
 		 572 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  41.22 
 
 		 1131 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  39.27 
 
 		 571 aa  396  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  38.1 
 
 		 1088 aa  398  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>