175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0563 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0563  Alpha-amylase  100 
 
 		 607 aa  1247    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.611678  normal  0.295943 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35756  predicted protein  42.11 
 
 		 410 aa  330  6e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.558305 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18258  predicted protein  38.73 
 
 		 517 aa  287  5e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2859  Alpha-amylase  65.78 
 
 		 661 aa  272  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46693  predicted protein  37.69 
 
 		 979 aa  269  1e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.649333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36075  predicted protein  37.47 
 
 		 447 aa  263  8e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00709127  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0201  alpha amylase catalytic region  30.71 
 
 		 513 aa  179  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213687  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3136  glucan 1,4-alpha-maltotetraohydrolase  31.01 
 
 		 555 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.815174  hitchhiker  0.00720592 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18730  cytoplasmic alpha-amylase  27.15 
 
 		 442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00080  alpha-amylase  29.41 
 
 		 456 aa  109  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.52316  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1948  cytoplasmic alpha-amylase  27.82 
 
 		 479 aa  109  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581984  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1139  cytoplasmic alpha-amylase  24.19 
 
 		 516 aa  105  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0631  cytoplasmic alpha-amylase  27.17 
 
 		 469 aa  102  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18240  cytoplasmic alpha-amylase  26.55 
 
 		 623 aa  97.1  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02410  alpha amylase  23.77 
 
 		 364 aa  90.1  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0708  cytoplasmic alpha-amylase  22.92 
 
 		 488 aa  67.8  0.0000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0434693  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000056  cytoplasmic alpha-amylase  24.23 
 
 		 507 aa  67.8  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0351894  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2409  cytoplasmic alpha-amylase  23 
 
 		 494 aa  67.4  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05679  cytoplasmic alpha-amylase  23.98 
 
 		 507 aa  67  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1263  alpha amylase catalytic region  24.8 
 
 		 499 aa  66.6  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.796062 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  21.84 
 
 		 620 aa  65.1  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  22.68 
 
 		 511 aa  65.1  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2176  cytoplasmic alpha-amylase  22.57 
 
 		 488 aa  64.7  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2125  cytoplasmic alpha-amylase  22.8 
 
 		 494 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.172028  hitchhiker  0.0000021601 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3291  cytoplasmic alpha-amylase  22.72 
 
 		 513 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000922062  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3551  cytoplasmic alpha-amylase  22.72 
 
 		 513 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1280  cytoplasmic alpha-amylase  22.8 
 
 		 494 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0337681  normal  0.462612 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3273  cytoplasmic alpha-amylase  23.61 
 
 		 549 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1157  cytoplasmic alpha-amylase  22.8 
 
 		 494 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00381479  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2120  cytoplasmic alpha-amylase  22.54 
 
 		 494 aa  61.6  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.070724  normal  0.352748 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2178  cytoplasmic alpha-amylase  22.54 
 
 		 494 aa  61.6  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170616  normal  0.0297459 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3508  cytoplasmic alpha-amylase  22.72 
 
 		 513 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2394  cytoplasmic alpha-amylase  22.4 
 
 		 472 aa  60.8  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1414  alpha amylase catalytic region  27.27 
 
 		 703 aa  60.1  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0623392  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04200  alpha-amylase, putative  22.52 
 
 		 486 aa  59.3  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917737  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  22.11 
 
 		 510 aa  59.3  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2526  cytoplasmic alpha-amylase  22.88 
 
 		 495 aa  59.7  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1176  alpha amylase catalytic region  39.02 
 
 		 647 aa  59.7  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2027  cytoplasmic alpha-amylase  22.77 
 
 		 495 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2162  cytoplasmic alpha-amylase  22.77 
 
 		 495 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1254  cytoplasmic alpha-amylase  22.77 
 
 		 495 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.345137 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1719  alpha amylase catalytic region  22.77 
 
 		 495 aa  58.2  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1387  cytoplasmic alpha-amylase  23.02 
 
 		 496 aa  58.2  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1712  cytoplasmic alpha-amylase  22.77 
 
 		 495 aa  58.2  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3261  cytoplasmic alpha-amylase  22.19 
 
 		 513 aa  57.8  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0208363  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1057  cytoplasmic alpha-amylase  22.77 
 
 		 495 aa  57.8  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0627984  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2702  cytoplasmic alpha-amylase  22.72 
 
 		 495 aa  57  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.363407 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  23 
 
 		 583 aa  56.6  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  23.45 
 
 		 462 aa  55.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  29 
 
 		 555 aa  55.8  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  29 
 
 		 555 aa  55.8  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03308  conserved hypothetical protein. (Eurofung)  24.26 
 
 		 552 aa  54.3  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  25.18 
 
 		 715 aa  54.3  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  22.29 
 
 		 499 aa  54.3  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0554  alpha amylase, catalytic region  20.45 
 
 		 441 aa  53.9  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0002426  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3200  cytoplasmic alpha-amylase  31.43 
 
 		 513 aa  54.3  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.570134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1758  cytoplasmic alpha-amylase  31.58 
 
 		 513 aa  53.9  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591182  normal  0.938186 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  25.27 
 
 		 623 aa  53.5  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  20.27 
 
 		 584 aa  53.5  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3487  cytoplasmic alpha-amylase  22.92 
 
 		 513 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  36.23 
 
 		 595 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  25.99 
 
 		 1121 aa  52.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  25.42 
 
 		 1061 aa  52.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  23.2 
 
 		 524 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1537  cytoplasmic alpha-amylase  27.01 
 
 		 483 aa  52.8  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0143259  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0568  alpha amylase catalytic region  20.77 
 
 		 441 aa  52.4  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.489897  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  24.16 
 
 		 526 aa  52  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1812  cytoplasmic alpha-amylase  21.76 
 
 		 492 aa  52  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0328907  normal  0.0314505 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  23.61 
 
 		 559 aa  51.6  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  36.76 
 
 		 593 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  24.23 
 
 		 439 aa  50.4  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0104  alpha amylase catalytic region  32.43 
 
 		 653 aa  50.4  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1500  cytoplasmic alpha-amylase  21.49 
 
 		 483 aa  50.1  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  23.67 
 
 		 589 aa  49.7  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1154  alpha amylase catalytic region  31.36 
 
 		 577 aa  49.7  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144841  decreased coverage  0.0000326761 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  27.95 
 
 		 459 aa  50.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  25.27 
 
 		 490 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  22.1 
 
 		 484 aa  49.7  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  25.76 
 
 		 1021 aa  48.9  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2808  alpha amylase catalytic region  28.07 
 
 		 481 aa  49.3  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00730774  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0834  alpha amylase catalytic region  33.78 
 
 		 650 aa  49.7  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  24.88 
 
 		 561 aa  48.5  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  23.27 
 
 		 532 aa  48.5  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  28.57 
 
 		 654 aa  48.9  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0544  alpha amylase catalytic region  31.51 
 
 		 758 aa  48.9  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2207  alpha amylase catalytic region  27.18 
 
 		 631 aa  48.5  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.247913  hitchhiker  0.0000287119 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  23.51 
 
 		 515 aa  48.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  28.89 
 
 		 614 aa  48.5  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  23.9 
 
 		 545 aa  48.1  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2135  alpha amylase, catalytic region  21.43 
 
 		 665 aa  48.1  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.269478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0770  alpha amylase, catalytic region  22.66 
 
 		 455 aa  48.1  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  24.74 
 
 		 588 aa  47.8  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06910  glycosidase  24.27 
 
 		 470 aa  47.8  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0553945  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3114  alpha amylase catalytic region  25.29 
 
 		 579 aa  47.8  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  23 
 
 		 610 aa  47.8  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2906  Alpha amylase, catalytic region  31.08 
 
 		 524 aa  47.4  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0951  alpha amylase, catalytic region  31.08 
 
 		 655 aa  47.4  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  25.73 
 
 		 1137 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  24.61 
 
 		 596 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3096  alpha amylase catalytic region  29.73 
 
 		 479 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>