254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_18240 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_18240  cytoplasmic alpha-amylase  100 
 
 		 623 aa  1276    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1139  cytoplasmic alpha-amylase  66.46 
 
 		 516 aa  664    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3291  cytoplasmic alpha-amylase  42.83 
 
 		 513 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000922062  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3551  cytoplasmic alpha-amylase  42.83 
 
 		 513 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3508  cytoplasmic alpha-amylase  42.83 
 
 		 513 aa  332  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3487  cytoplasmic alpha-amylase  42.74 
 
 		 513 aa  332  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3200  cytoplasmic alpha-amylase  43.03 
 
 		 513 aa  331  2e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.570134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3261  cytoplasmic alpha-amylase  42.62 
 
 		 513 aa  331  3e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0208363  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1758  cytoplasmic alpha-amylase  42.54 
 
 		 513 aa  327  3e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591182  normal  0.938186 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3273  cytoplasmic alpha-amylase  40.47 
 
 		 549 aa  325  2e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000056  cytoplasmic alpha-amylase  38.97 
 
 		 507 aa  317  6e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0351894  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05679  cytoplasmic alpha-amylase  38.29 
 
 		 507 aa  306  8.000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1800  alpha amylase, catalytic region  38.24 
 
 		 627 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.847837  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2808  alpha amylase catalytic region  39.67 
 
 		 481 aa  289  1e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00730774  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3249  alpha amylase catalytic region  38.25 
 
 		 480 aa  287  4e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1812  cytoplasmic alpha-amylase  37.3 
 
 		 492 aa  280  6e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0328907  normal  0.0314505 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2176  cytoplasmic alpha-amylase  34.52 
 
 		 488 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2178  cytoplasmic alpha-amylase  35.9 
 
 		 494 aa  266  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170616  normal  0.0297459 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1157  cytoplasmic alpha-amylase  35.7 
 
 		 494 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00381479  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1280  cytoplasmic alpha-amylase  35.5 
 
 		 494 aa  264  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0337681  normal  0.462612 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2125  cytoplasmic alpha-amylase  35.5 
 
 		 494 aa  264  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.172028  hitchhiker  0.0000021601 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2409  cytoplasmic alpha-amylase  35.35 
 
 		 494 aa  264  4e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2120  cytoplasmic alpha-amylase  35.5 
 
 		 494 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.070724  normal  0.352748 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1719  alpha amylase catalytic region  35.69 
 
 		 495 aa  261  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1712  cytoplasmic alpha-amylase  35.5 
 
 		 495 aa  260  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1254  cytoplasmic alpha-amylase  35.5 
 
 		 495 aa  260  6e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.345137 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2027  cytoplasmic alpha-amylase  35.5 
 
 		 495 aa  260  6e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2162  cytoplasmic alpha-amylase  35.5 
 
 		 495 aa  260  6e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1057  cytoplasmic alpha-amylase  35.5 
 
 		 495 aa  259  1e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0627984  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2702  cytoplasmic alpha-amylase  35.5 
 
 		 495 aa  259  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.363407 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1263  alpha amylase catalytic region  34.71 
 
 		 499 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.796062 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1387  cytoplasmic alpha-amylase  35.6 
 
 		 496 aa  254  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2526  cytoplasmic alpha-amylase  34.71 
 
 		 495 aa  252  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2394  cytoplasmic alpha-amylase  35.32 
 
 		 472 aa  251  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1500  cytoplasmic alpha-amylase  36.14 
 
 		 483 aa  249  1e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1537  cytoplasmic alpha-amylase  34.97 
 
 		 483 aa  240  5.999999999999999e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0143259  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0708  cytoplasmic alpha-amylase  32.87 
 
 		 488 aa  231  2e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0434693  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04200  alpha-amylase, putative  33.54 
 
 		 486 aa  217  4e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917737  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03309  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15150)  32.48 
 
 		 576 aa  212  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.979768  normal  0.838039 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18730  cytoplasmic alpha-amylase  34.31 
 
 		 442 aa  209  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1948  cytoplasmic alpha-amylase  30.27 
 
 		 479 aa  153  8.999999999999999e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581984  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00080  alpha-amylase  28.6 
 
 		 456 aa  151  4e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.52316  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0631  cytoplasmic alpha-amylase  28.24 
 
 		 469 aa  147  7.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02410  alpha amylase  29.52 
 
 		 364 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46693  predicted protein  28.53 
 
 		 979 aa  104  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.649333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18258  predicted protein  25.25 
 
 		 517 aa  99.8  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35756  predicted protein  24.62 
 
 		 410 aa  99  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.558305 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0563  Alpha-amylase  26.55 
 
 		 607 aa  97.1  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.611678  normal  0.295943 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0201  alpha amylase catalytic region  25.44 
 
 		 513 aa  92  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213687  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36075  predicted protein  24.62 
 
 		 447 aa  84.7  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00709127  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3136  glucan 1,4-alpha-maltotetraohydrolase  28.82 
 
 		 555 aa  84.3  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.815174  hitchhiker  0.00720592 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  27.89 
 
 		 511 aa  80.9  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  24.13 
 
 		 532 aa  75.9  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  26.19 
 
 		 510 aa  75.5  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  26.34 
 
 		 604 aa  71.2  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3095  alpha amylase catalytic region  24.63 
 
 		 441 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1927  alpha amylase catalytic region  23.76 
 
 		 914 aa  67.4  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0959  a-glucosidase  24.34 
 
 		 527 aa  67.4  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.766487  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  23.28 
 
 		 559 aa  66.6  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  24.85 
 
 		 462 aa  65.9  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  26.58 
 
 		 614 aa  65.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  23.45 
 
 		 499 aa  65.5  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  26.11 
 
 		 600 aa  65.5  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.89 
 
 		 1891 aa  65.1  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  26.29 
 
 		 526 aa  65.1  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4292  Alpha-amylase A precursor (1,4-alpha-D-glucan glucanohydrolase)  23.18 
 
 		 528 aa  64.3  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  24.86 
 
 		 490 aa  63.9  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3337  Glycosidase-like protein  25 
 
 		 679 aa  63.9  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543706  normal  0.14646 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2654  alpha amylase catalytic region  25.07 
 
 		 461 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.181273  normal  0.26185 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.9 
 
 		 2068 aa  62.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  25.37 
 
 		 620 aa  62.4  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4716  alpha amylase catalytic region  25.3 
 
 		 458 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  22.55 
 
 		 623 aa  61.2  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  23.31 
 
 		 599 aa  61.2  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  26.36 
 
 		 703 aa  60.8  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  23.75 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  24.79 
 
 		 739 aa  60.1  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  23.17 
 
 		 561 aa  59.7  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2896  Alpha-amylase  24.18 
 
 		 722 aa  58.2  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.578872 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  24.03 
 
 		 545 aa  57.8  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  23.48 
 
 		 509 aa  57.4  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  24.91 
 
 		 521 aa  57.4  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  24.28 
 
 		 541 aa  57.4  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.24 
 
 		 1975 aa  57  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  24.86 
 
 		 767 aa  56.6  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  24.28 
 
 		 541 aa  57  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  24.32 
 
 		 587 aa  55.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  24.4 
 
 		 622 aa  55.5  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03308  conserved hypothetical protein. (Eurofung)  22.97 
 
 		 552 aa  55.1  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  21.94 
 
 		 574 aa  54.7  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  23.56 
 
 		 596 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  25.71 
 
 		 1363 aa  54.3  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  23.56 
 
 		 596 aa  54.3  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  23.56 
 
 		 596 aa  54.3  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2341  alpha amylase catalytic region  25.12 
 
 		 554 aa  53.9  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4065  Alpha-amylase  25.19 
 
 		 596 aa  53.9  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540437  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  25.22 
 
 		 654 aa  53.5  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0985  alpha amylase domain-containing protein  23.63 
 
 		 605 aa  53.5  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0694969  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  22.07 
 
 		 595 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  23.45 
 
 		 815 aa  53.1  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>