238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1948 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1948  cytoplasmic alpha-amylase  100 
 
 		 479 aa  985    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581984  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00080  alpha-amylase  69.59 
 
 		 456 aa  580  1e-164  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.52316  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0631  cytoplasmic alpha-amylase  46.72 
 
 		 469 aa  411  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18730  cytoplasmic alpha-amylase  43.26 
 
 		 442 aa  330  4e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02410  alpha amylase  33.97 
 
 		 364 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1800  alpha amylase, catalytic region  27.85 
 
 		 627 aa  157  6e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.847837  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2526  cytoplasmic alpha-amylase  27.05 
 
 		 495 aa  156  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2125  cytoplasmic alpha-amylase  25.46 
 
 		 494 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.172028  hitchhiker  0.0000021601 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1280  cytoplasmic alpha-amylase  25.67 
 
 		 494 aa  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0337681  normal  0.462612 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2178  cytoplasmic alpha-amylase  25.46 
 
 		 494 aa  153  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170616  normal  0.0297459 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2120  cytoplasmic alpha-amylase  26.28 
 
 		 494 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.070724  normal  0.352748 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1157  cytoplasmic alpha-amylase  26.28 
 
 		 494 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00381479  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18240  cytoplasmic alpha-amylase  30.27 
 
 		 623 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1712  cytoplasmic alpha-amylase  27.05 
 
 		 495 aa  150  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1719  alpha amylase catalytic region  27.05 
 
 		 495 aa  150  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2027  cytoplasmic alpha-amylase  27.05 
 
 		 495 aa  150  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1254  cytoplasmic alpha-amylase  27.05 
 
 		 495 aa  150  6e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.345137 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2702  cytoplasmic alpha-amylase  26.64 
 
 		 495 aa  150  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.363407 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2162  cytoplasmic alpha-amylase  27.05 
 
 		 495 aa  150  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1139  cytoplasmic alpha-amylase  29.79 
 
 		 516 aa  148  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1057  cytoplasmic alpha-amylase  26.84 
 
 		 495 aa  147  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0627984  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3261  cytoplasmic alpha-amylase  29.18 
 
 		 513 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0208363  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000056  cytoplasmic alpha-amylase  27.54 
 
 		 507 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0351894  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3508  cytoplasmic alpha-amylase  29.18 
 
 		 513 aa  147  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3273  cytoplasmic alpha-amylase  28.95 
 
 		 549 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2176  cytoplasmic alpha-amylase  26.64 
 
 		 488 aa  146  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3291  cytoplasmic alpha-amylase  28.97 
 
 		 513 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000922062  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3551  cytoplasmic alpha-amylase  28.97 
 
 		 513 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3487  cytoplasmic alpha-amylase  28.83 
 
 		 513 aa  143  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3200  cytoplasmic alpha-amylase  28.78 
 
 		 513 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.570134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1758  cytoplasmic alpha-amylase  28.43 
 
 		 513 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591182  normal  0.938186 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1387  cytoplasmic alpha-amylase  28.12 
 
 		 496 aa  137  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  25.24 
 
 		 439 aa  137  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05679  cytoplasmic alpha-amylase  27.27 
 
 		 507 aa  136  9e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04200  alpha-amylase, putative  26.99 
 
 		 486 aa  129  9.000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917737  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2409  cytoplasmic alpha-amylase  26.98 
 
 		 494 aa  125  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2394  cytoplasmic alpha-amylase  24.41 
 
 		 472 aa  124  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3249  alpha amylase catalytic region  25.64 
 
 		 480 aa  117  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0708  cytoplasmic alpha-amylase  24.9 
 
 		 488 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0434693  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1500  cytoplasmic alpha-amylase  25.57 
 
 		 483 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2808  alpha amylase catalytic region  26.1 
 
 		 481 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00730774  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1537  cytoplasmic alpha-amylase  24.51 
 
 		 483 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0143259  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0563  Alpha-amylase  27.82 
 
 		 607 aa  109  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.611678  normal  0.295943 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46693  predicted protein  28.57 
 
 		 979 aa  108  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.649333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1263  alpha amylase catalytic region  27.97 
 
 		 499 aa  106  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.796062 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18258  predicted protein  27.27 
 
 		 517 aa  102  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36075  predicted protein  27.01 
 
 		 447 aa  101  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00709127  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0201  alpha amylase catalytic region  27.01 
 
 		 513 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213687  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35756  predicted protein  24.86 
 
 		 410 aa  87.4  6e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.558305 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3136  glucan 1,4-alpha-maltotetraohydrolase  26.65 
 
 		 555 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.815174  hitchhiker  0.00720592 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1812  cytoplasmic alpha-amylase  34.91 
 
 		 492 aa  86.3  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0328907  normal  0.0314505 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03309  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15150)  26.43 
 
 		 576 aa  85.9  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.979768  normal  0.838039 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  25.82 
 
 		 620 aa  80.1  0.00000000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  24.79 
 
 		 599 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2654  alpha amylase catalytic region  25.71 
 
 		 461 aa  67.4  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.181273  normal  0.26185 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03308  conserved hypothetical protein. (Eurofung)  24.15 
 
 		 552 aa  65.9  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  23.61 
 
 		 510 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  24.14 
 
 		 593 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  25.23 
 
 		 815 aa  65.1  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1660  alpha amylase, catalytic region  23.77 
 
 		 683 aa  64.3  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  26.36 
 
 		 1021 aa  63.5  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3370  alpha-amylase  22.9 
 
 		 470 aa  63.5  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02760  Alpha-amylase A precursor, putative  24.44 
 
 		 572 aa  63.2  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  22.12 
 
 		 576 aa  62.8  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  23.51 
 
 		 583 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  24.6 
 
 		 462 aa  62.4  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  22.95 
 
 		 511 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  23.81 
 
 		 521 aa  61.6  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2031  alpha amylase, catalytic region  22.19 
 
 		 641 aa  61.6  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  22.87 
 
 		 509 aa  61.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  24.92 
 
 		 610 aa  60.5  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  24.45 
 
 		 595 aa  60.5  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  25.16 
 
 		 2638 aa  59.7  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1785  alpha amylase, catalytic region  22.7 
 
 		 639 aa  59.7  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48062  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2896  Alpha-amylase  26.41 
 
 		 722 aa  58.9  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.578872 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3095  alpha amylase catalytic region  22.62 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1727  alpha amylase catalytic region  23.9 
 
 		 454 aa  58.9  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000518329  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2728  alpha amylase catalytic region  24.28 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  25.96 
 
 		 752 aa  57.8  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1176  alpha amylase catalytic region  25.74 
 
 		 647 aa  57.4  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  22.34 
 
 		 526 aa  57  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  22.44 
 
 		 484 aa  57  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2686  alpha amylase, catalytic region  24.56 
 
 		 722 aa  57  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288393 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3374  alpha amylase catalytic region  24.56 
 
 		 453 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.25 
 
 		 2068 aa  55.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  23.9 
 
 		 499 aa  55.1  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2207  alpha amylase catalytic region  23.9 
 
 		 631 aa  54.3  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.247913  hitchhiker  0.0000287119 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0985  alpha amylase domain-containing protein  25.51 
 
 		 605 aa  54.3  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0694969  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  22.56 
 
 		 578 aa  54.3  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4716  alpha amylase catalytic region  24.92 
 
 		 458 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4292  Alpha-amylase A precursor (1,4-alpha-D-glucan glucanohydrolase)  24.26 
 
 		 528 aa  53.9  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  22.88 
 
 		 654 aa  53.9  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  22.14 
 
 		 593 aa  52  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0979  alpha-amylase  22.3 
 
 		 466 aa  51.6  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  24.34 
 
 		 586 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4479  glycoside hydrolase family protein  23.08 
 
 		 552 aa  51.2  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  22.7 
 
 		 545 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01888  putative alpha-amylase  23.53 
 
 		 644 aa  51.2  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0554  alpha amylase, catalytic region  23.34 
 
 		 441 aa  51.2  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0002426  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  22.92 
 
 		 493 aa  51.2  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>