More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00080 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_00080  alpha-amylase  100 
 
 		 456 aa  936    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.52316  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1948  cytoplasmic alpha-amylase  63.25 
 
 		 479 aa  588  1e-167  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581984  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0631  cytoplasmic alpha-amylase  50.11 
 
 		 469 aa  420  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18730  cytoplasmic alpha-amylase  45.94 
 
 		 442 aa  357  2.9999999999999997e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02410  alpha amylase  33.43 
 
 		 364 aa  177  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  27.03 
 
 		 439 aa  153  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1139  cytoplasmic alpha-amylase  28.32 
 
 		 516 aa  153  7e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1800  alpha amylase, catalytic region  28.66 
 
 		 627 aa  151  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.847837  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18240  cytoplasmic alpha-amylase  28.6 
 
 		 623 aa  151  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000056  cytoplasmic alpha-amylase  29.96 
 
 		 507 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0351894  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2176  cytoplasmic alpha-amylase  27.98 
 
 		 488 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05679  cytoplasmic alpha-amylase  29.25 
 
 		 507 aa  138  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2526  cytoplasmic alpha-amylase  26.41 
 
 		 495 aa  135  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1157  cytoplasmic alpha-amylase  25.61 
 
 		 494 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00381479  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2125  cytoplasmic alpha-amylase  25.61 
 
 		 494 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.172028  hitchhiker  0.0000021601 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1280  cytoplasmic alpha-amylase  25.82 
 
 		 494 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0337681  normal  0.462612 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2178  cytoplasmic alpha-amylase  25.61 
 
 		 494 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170616  normal  0.0297459 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2120  cytoplasmic alpha-amylase  25.61 
 
 		 494 aa  133  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.070724  normal  0.352748 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1387  cytoplasmic alpha-amylase  26.54 
 
 		 496 aa  133  6.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2409  cytoplasmic alpha-amylase  26.53 
 
 		 494 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1758  cytoplasmic alpha-amylase  27.78 
 
 		 513 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591182  normal  0.938186 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04200  alpha-amylase, putative  25.98 
 
 		 486 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917737  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1719  alpha amylase catalytic region  24.29 
 
 		 495 aa  127  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1712  cytoplasmic alpha-amylase  24.29 
 
 		 495 aa  127  6e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2394  cytoplasmic alpha-amylase  24.42 
 
 		 472 aa  126  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3249  alpha amylase catalytic region  26.29 
 
 		 480 aa  122  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0708  cytoplasmic alpha-amylase  25.42 
 
 		 488 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0434693  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2808  alpha amylase catalytic region  26.76 
 
 		 481 aa  119  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00730774  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46693  predicted protein  28.57 
 
 		 979 aa  116  8.999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.649333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1812  cytoplasmic alpha-amylase  27.48 
 
 		 492 aa  116  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0328907  normal  0.0314505 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0563  Alpha-amylase  29.41 
 
 		 607 aa  110  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.611678  normal  0.295943 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18258  predicted protein  25.88 
 
 		 517 aa  107  5e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2702  cytoplasmic alpha-amylase  23.47 
 
 		 495 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.363407 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1537  cytoplasmic alpha-amylase  24.63 
 
 		 483 aa  104  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0143259  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1254  cytoplasmic alpha-amylase  23.27 
 
 		 495 aa  104  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.345137 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2162  cytoplasmic alpha-amylase  23.27 
 
 		 495 aa  104  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2027  cytoplasmic alpha-amylase  23.27 
 
 		 495 aa  104  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1057  cytoplasmic alpha-amylase  23.06 
 
 		 495 aa  103  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0627984  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0201  alpha amylase catalytic region  28.61 
 
 		 513 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213687  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03309  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15150)  34.48 
 
 		 576 aa  95.1  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.979768  normal  0.838039 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1263  alpha amylase catalytic region  38.39 
 
 		 499 aa  95.5  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.796062 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36075  predicted protein  26.93 
 
 		 447 aa  92.4  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00709127  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3261  cytoplasmic alpha-amylase  37.1 
 
 		 513 aa  92.4  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0208363  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3508  cytoplasmic alpha-amylase  37.1 
 
 		 513 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35756  predicted protein  26.16 
 
 		 410 aa  91.3  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.558305 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3200  cytoplasmic alpha-amylase  36 
 
 		 513 aa  90.9  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.570134  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3291  cytoplasmic alpha-amylase  36.29 
 
 		 513 aa  89.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000922062  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3487  cytoplasmic alpha-amylase  36.29 
 
 		 513 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3551  cytoplasmic alpha-amylase  36.29 
 
 		 513 aa  89.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3273  cytoplasmic alpha-amylase  39.62 
 
 		 549 aa  87.4  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  25.62 
 
 		 620 aa  86.3  0.000000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1500  cytoplasmic alpha-amylase  36.89 
 
 		 483 aa  82.8  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  30.15 
 
 		 1021 aa  80.9  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03308  conserved hypothetical protein. (Eurofung)  26.09 
 
 		 552 aa  80.1  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77903  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  27 
 
 		 462 aa  80.1  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3136  glucan 1,4-alpha-maltotetraohydrolase  24.75 
 
 		 555 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.815174  hitchhiker  0.00720592 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  24.49 
 
 		 493 aa  73.9  0.000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  24.58 
 
 		 599 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  24.02 
 
 		 522 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  24.92 
 
 		 2638 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  24.32 
 
 		 576 aa  71.6  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  23.9 
 
 		 526 aa  70.5  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2654  alpha amylase catalytic region  26.65 
 
 		 461 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.181273  normal  0.26185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  25.15 
 
 		 509 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  25.95 
 
 		 521 aa  67.4  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  27.06 
 
 		 815 aa  67  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  25.07 
 
 		 555 aa  65.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  25.62 
 
 		 583 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  25.07 
 
 		 555 aa  65.9  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  27.36 
 
 		 532 aa  65.5  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  24 
 
 		 752 aa  65.1  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  25.89 
 
 		 742 aa  63.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  24.77 
 
 		 703 aa  63.2  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5858  alpha amylase catalytic region  28.11 
 
 		 569 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.364305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  30.89 
 
 		 511 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  23.85 
 
 		 499 aa  62  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.9 
 
 		 1855 aa  61.6  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  24.46 
 
 		 593 aa  61.6  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3374  alpha amylase catalytic region  23.53 
 
 		 453 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2728  alpha amylase catalytic region  23.72 
 
 		 453 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1660  alpha amylase, catalytic region  23.22 
 
 		 683 aa  60.8  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  24.67 
 
 		 511 aa  60.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  29.83 
 
 		 557 aa  60.5  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  24.69 
 
 		 561 aa  60.5  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  30.94 
 
 		 562 aa  60.5  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0979  alpha-amylase  21.75 
 
 		 466 aa  60.5  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02760  Alpha-amylase A precursor, putative  24.68 
 
 		 572 aa  60.1  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1727  alpha amylase catalytic region  23.08 
 
 		 454 aa  60.1  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000518329  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  22.82 
 
 		 578 aa  59.7  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  29.9 
 
 		 544 aa  59.3  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  31.75 
 
 		 522 aa  59.3  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0770  alpha amylase, catalytic region  22.44 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  23.68 
 
 		 510 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1785  alpha amylase, catalytic region  23.73 
 
 		 639 aa  58.9  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48062  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2207  alpha amylase catalytic region  23.84 
 
 		 631 aa  58.9  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.247913  hitchhiker  0.0000287119 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1743  alpha amylase, catalytic region  36.79 
 
 		 619 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1332  alpha amylase, catalytic domain protein  28.5 
 
 		 639 aa  58.2  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.86601 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0554  alpha amylase, catalytic region  24.76 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0002426  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  20.74 
 
 		 588 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  24.39 
 
 		 593 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>