More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3225 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3225  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 564 aa  1144    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.262228  hitchhiker  0.0000603449 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8808  alpha amylase, catalytic region  58.78 
 
 		 552 aa  644    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3723  alpha amylase, catalytic region  60.92 
 
 		 559 aa  692    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0922665 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3079  alpha amylase catalytic region  69.15 
 
 		 556 aa  788    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493465  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4598  alpha amylase, catalytic region  59.75 
 
 		 559 aa  679    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541891  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4981  alpha amylase, catalytic region  60.11 
 
 		 559 aa  686    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4088  alpha amylase, catalytic region  59.72 
 
 		 563 aa  670    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4686  alpha amylase, catalytic region  59.75 
 
 		 559 aa  679    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3708  alpha amylase catalytic region  58.48 
 
 		 521 aa  630  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2596  alpha amylase, catalytic region  54.3 
 
 		 558 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2978  alpha amylase, catalytic region  54.32 
 
 		 548 aa  601  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.533119  normal  0.0820165 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0937  alpha amylase domain-containing protein  54.12 
 
 		 548 aa  598  1e-169  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3928  alpha amylase catalytic region  48.55 
 
 		 544 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0315  alpha amylase catalytic region  49.28 
 
 		 555 aa  537  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.906298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2621  alpha amylase catalytic region  49.36 
 
 		 554 aa  532  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1908  alpha amylase catalytic region  48.1 
 
 		 553 aa  529  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.834785  normal  0.122197 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2115  alpha amylase catalytic region  47.74 
 
 		 553 aa  527  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  0.0296214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4604  alpha amylase catalytic region  49.37 
 
 		 554 aa  528  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0894643  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1579  alpha amylase catalytic region  47.66 
 
 		 543 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125982 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5237  alpha amylase catalytic region  46.84 
 
 		 554 aa  513  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0387802 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2083  alpha amylase catalytic region  48.82 
 
 		 541 aa  510  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.583803 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1968  alpha amylase catalytic region  46.29 
 
 		 554 aa  507  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8020  trehalose synthase  46.18 
 
 		 553 aa  508  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5642  alpha amylase catalytic region  46.27 
 
 		 540 aa  485  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000211534  normal  0.444192 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3114  alpha amylase catalytic region  46.57 
 
 		 579 aa  481  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3686  alpha amylase, catalytic region  44.67 
 
 		 540 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12163  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0624  alpha amylase catalytic region  40.51 
 
 		 570 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00268544  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  41.35 
 
 		 606 aa  426  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  40.97 
 
 		 1100 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  41.37 
 
 		 1113 aa  424  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  41.68 
 
 		 553 aa  425  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  39.93 
 
 		 1112 aa  422  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  40.62 
 
 		 551 aa  424  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  41.52 
 
 		 591 aa  422  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  39.67 
 
 		 548 aa  419  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  42.29 
 
 		 1164 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  41.44 
 
 		 1101 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3106  trehalose synthase  44.24 
 
 		 535 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0151531  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  41.68 
 
 		 1099 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  41.58 
 
 		 1088 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  42.29 
 
 		 1164 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  41.24 
 
 		 1114 aa  416  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4038  alpha amylase catalytic region  43.22 
 
 		 544 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0583407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  40.36 
 
 		 1092 aa  413  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1172  alpha amylase domain-containing protein  40.32 
 
 		 1095 aa  414  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1208  alpha amylase  41.19 
 
 		 1094 aa  412  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  40.36 
 
 		 553 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  39.75 
 
 		 1109 aa  413  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  40.36 
 
 		 572 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  40.61 
 
 		 1101 aa  412  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  41.29 
 
 		 1061 aa  412  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  40.36 
 
 		 572 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05183  hypothetical protein  41.85 
 
 		 1160 aa  409  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0584538  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  39.45 
 
 		 1104 aa  410  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  41.26 
 
 		 551 aa  410  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  40.51 
 
 		 1099 aa  409  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  40.07 
 
 		 1100 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  41.91 
 
 		 1100 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  39.78 
 
 		 577 aa  412  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  40.65 
 
 		 1108 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  43 
 
 		 682 aa  412  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  40.33 
 
 		 1093 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  40.04 
 
 		 1108 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  40.83 
 
 		 601 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2310  trehalose synthase  43.16 
 
 		 1098 aa  409  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.178439  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  44.95 
 
 		 1106 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  40.04 
 
 		 1108 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  39.6 
 
 		 1121 aa  409  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  40.07 
 
 		 1102 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  40.07 
 
 		 1102 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  40.51 
 
 		 1100 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2782  trehalose synthase  40.18 
 
 		 1098 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0240  trehalose synthase  40.32 
 
 		 1105 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  40.5 
 
 		 1110 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  39.96 
 
 		 1154 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  40.07 
 
 		 1102 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  39.64 
 
 		 556 aa  407  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  39.61 
 
 		 1154 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  39.27 
 
 		 1085 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  40.29 
 
 		 1088 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  38.46 
 
 		 1113 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  40.33 
 
 		 1093 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  40.47 
 
 		 1106 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  40.4 
 
 		 1110 aa  402  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1404  Alpha amylase, catalytic region  41.83 
 
 		 1100 aa  403  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  39.23 
 
 		 1094 aa  402  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  39.2 
 
 		 1121 aa  403  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  40.47 
 
 		 1106 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  39.15 
 
 		 1098 aa  403  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  40.18 
 
 		 1137 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  39.09 
 
 		 1142 aa  402  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3154  putative trehalose synthase  41.05 
 
 		 1100 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  41.08 
 
 		 1138 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  39.89 
 
 		 1088 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  43.35 
 
 		 1152 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  45.37 
 
 		 1105 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36730  putative trehalose synthase  41.05 
 
 		 1100 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.631838 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  39.89 
 
 		 1088 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  40.9 
 
 		 1137 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3263  trehalose synthase  40.68 
 
 		 1121 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>