106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2027 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_1719  alpha amylase catalytic region  99.6 
 
 
495 aa  1027    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2526  cytoplasmic alpha-amylase  88.08 
 
 
495 aa  928    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2027  cytoplasmic alpha-amylase  100 
 
 
495 aa  1030    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2162  cytoplasmic alpha-amylase  100 
 
 
495 aa  1030    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1387  cytoplasmic alpha-amylase  65.18 
 
 
496 aa  691    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1712  cytoplasmic alpha-amylase  99.6 
 
 
495 aa  1027    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1254  cytoplasmic alpha-amylase  100 
 
 
495 aa  1030    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.345137 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1057  cytoplasmic alpha-amylase  99.39 
 
 
495 aa  1025    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0627984  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2125  cytoplasmic alpha-amylase  89.07 
 
 
494 aa  925    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.172028  hitchhiker  0.0000021601 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2178  cytoplasmic alpha-amylase  88.66 
 
 
494 aa  923    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170616  normal  0.0297459 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2120  cytoplasmic alpha-amylase  88.87 
 
 
494 aa  926    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.070724  normal  0.352748 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1157  cytoplasmic alpha-amylase  88.46 
 
 
494 aa  922    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00381479  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1280  cytoplasmic alpha-amylase  88.66 
 
 
494 aa  922    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0337681  normal  0.462612 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2702  cytoplasmic alpha-amylase  99.19 
 
 
495 aa  1025    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.363407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2176  cytoplasmic alpha-amylase  52.56 
 
 
488 aa  548  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2409  cytoplasmic alpha-amylase  50.3 
 
 
494 aa  495  1e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1263  alpha amylase catalytic region  50.2 
 
 
499 aa  482  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.796062 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000056  cytoplasmic alpha-amylase  46.65 
 
 
507 aa  433  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0351894  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05679  cytoplasmic alpha-amylase  46.03 
 
 
507 aa  431  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1800  alpha amylase, catalytic region  43.27 
 
 
627 aa  422  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.847837  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3273  cytoplasmic alpha-amylase  42.86 
 
 
549 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1812  cytoplasmic alpha-amylase  41.85 
 
 
492 aa  406  1.0000000000000001e-112  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0328907  normal  0.0314505 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3249  alpha amylase catalytic region  42.48 
 
 
480 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1500  cytoplasmic alpha-amylase  44.42 
 
 
483 aa  404  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0708  cytoplasmic alpha-amylase  43.46 
 
 
488 aa  402  9.999999999999999e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0434693  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2808  alpha amylase catalytic region  42.02 
 
 
481 aa  401  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00730774  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3487  cytoplasmic alpha-amylase  42.28 
 
 
513 aa  396  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3291  cytoplasmic alpha-amylase  41.46 
 
 
513 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000922062  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3551  cytoplasmic alpha-amylase  41.46 
 
 
513 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1758  cytoplasmic alpha-amylase  42.07 
 
 
513 aa  392  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591182  normal  0.938186 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3508  cytoplasmic alpha-amylase  41.67 
 
 
513 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3261  cytoplasmic alpha-amylase  41.26 
 
 
513 aa  390  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0208363  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3200  cytoplasmic alpha-amylase  41.78 
 
 
513 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.570134  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2394  cytoplasmic alpha-amylase  41.84 
 
 
472 aa  376  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04200  alpha-amylase, putative  42.42 
 
 
486 aa  360  2e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917737  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1537  cytoplasmic alpha-amylase  37.3 
 
 
483 aa  334  3e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0143259  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03309  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15150)  36.49 
 
 
576 aa  316  6e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.979768  normal  0.838039 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1139  cytoplasmic alpha-amylase  35.94 
 
 
516 aa  260  4e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18240  cytoplasmic alpha-amylase  35.5 
 
 
623 aa  260  5.0000000000000005e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0631  cytoplasmic alpha-amylase  26.98 
 
 
469 aa  159  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18730  cytoplasmic alpha-amylase  27.25 
 
 
442 aa  152  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1948  cytoplasmic alpha-amylase  27.05 
 
 
479 aa  150  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581984  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00080  alpha-amylase  23.27 
 
 
456 aa  104  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.52316  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02410  alpha amylase  25.88 
 
 
364 aa  77.8  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18258  predicted protein  23.55 
 
 
517 aa  76.3  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46693  predicted protein  23.39 
 
 
979 aa  67.8  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.649333  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  24.56 
 
 
510 aa  60.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  21.74 
 
 
1527 aa  58.9  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35756  predicted protein  24.68 
 
 
410 aa  58.9  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.558305 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  36.46 
 
 
1363 aa  58.9  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0563  Alpha-amylase  22.77 
 
 
607 aa  58.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.611678  normal  0.295943 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36075  predicted protein  23.16 
 
 
447 aa  58.5  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00709127  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01890  cyclomaltodextrin glucanotransferase  21.73 
 
 
564 aa  57.8  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  26.26 
 
 
541 aa  57.4  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  23.46 
 
 
499 aa  57.4  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  26.17 
 
 
545 aa  57  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  26.26 
 
 
541 aa  57  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  21.19 
 
 
739 aa  55.1  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  23.25 
 
 
614 aa  54.7  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  24.24 
 
 
511 aa  54.3  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  25.63 
 
 
642 aa  53.9  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  24.05 
 
 
1942 aa  53.9  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  33.79 
 
 
439 aa  52.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  25.42 
 
 
649 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1603  alpha amylase catalytic region  34.04 
 
 
554 aa  52  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000968128  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  22.46 
 
 
600 aa  51.2  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  23.02 
 
 
1005 aa  50.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  20.94 
 
 
767 aa  50.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  21.56 
 
 
610 aa  49.7  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  23.71 
 
 
509 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  26.06 
 
 
524 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  22.7 
 
 
2068 aa  49.3  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04858  periplasmic alpha-amylase precursor  20.7 
 
 
686 aa  48.5  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  28.28 
 
 
703 aa  47.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0201  alpha amylase catalytic region  22.78 
 
 
513 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213687  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04843  Putative alpha-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B3N7]  23.66 
 
 
591 aa  47  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145231  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  18.49 
 
 
561 aa  47  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1752  glycosyl hydrolase  32.38 
 
 
1514 aa  46.2  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0221  alpha amylase catalytic region  27.97 
 
 
474 aa  46.2  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0052  alpha amylase catalytic region  24.55 
 
 
577 aa  46.6  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.316768 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  22.48 
 
 
462 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1785  alpha amylase, catalytic region  22.32 
 
 
639 aa  45.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48062  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  20.22 
 
 
815 aa  45.8  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  24.27 
 
 
555 aa  45.8  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2381  alpha-D-1,4-glucosidase  24.43 
 
 
568 aa  45.1  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  24.46 
 
 
555 aa  45.1  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3790  periplasmic alpha-amylase precursor  22 
 
 
687 aa  44.7  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0545  alpha,alpha-phosphotrehalase  27.55 
 
 
553 aa  44.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0770  alpha amylase, catalytic region  20.2 
 
 
455 aa  44.3  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1727  alpha amylase catalytic region  20.98 
 
 
454 aa  44.3  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000518329  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  20.64 
 
 
493 aa  44.3  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0586  alpha amylase catalytic region  30.85 
 
 
479 aa  43.9  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.532649  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0427  glycosyl hydrolase family protein  24.66 
 
 
554 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4891  glycosyl hydrolase family protein  24.66 
 
 
554 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000186881  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001107  periplasmic alpha-amylase  20.8 
 
 
686 aa  43.9  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0600503  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  25 
 
 
595 aa  43.9  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4138  periplasmic alpha-amylase precursor  22 
 
 
687 aa  43.9  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  23.46 
 
 
723 aa  43.9  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0210  alpha amylase catalytic region  20 
 
 
741 aa  43.9  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0538024  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  23.32 
 
 
556 aa  43.5  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>