More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000056 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000056  cytoplasmic alpha-amylase  100 
 
 
507 aa  1044    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0351894  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05679  cytoplasmic alpha-amylase  91.91 
 
 
507 aa  946    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1800  alpha amylase, catalytic region  61.85 
 
 
627 aa  654    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.847837  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3273  cytoplasmic alpha-amylase  63.47 
 
 
549 aa  631  1e-179  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3508  cytoplasmic alpha-amylase  57.14 
 
 
513 aa  585  1e-166  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3200  cytoplasmic alpha-amylase  57.53 
 
 
513 aa  586  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.570134  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3291  cytoplasmic alpha-amylase  56.95 
 
 
513 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000922062  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3261  cytoplasmic alpha-amylase  56.95 
 
 
513 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0208363  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3551  cytoplasmic alpha-amylase  56.95 
 
 
513 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1758  cytoplasmic alpha-amylase  56.16 
 
 
513 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591182  normal  0.938186 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3487  cytoplasmic alpha-amylase  56.36 
 
 
513 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2176  cytoplasmic alpha-amylase  51.12 
 
 
488 aa  491  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2394  cytoplasmic alpha-amylase  51.98 
 
 
472 aa  483  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2409  cytoplasmic alpha-amylase  50.71 
 
 
494 aa  478  1e-133  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1263  alpha amylase catalytic region  49.39 
 
 
499 aa  459  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.796062 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1812  cytoplasmic alpha-amylase  47.41 
 
 
492 aa  456  1e-127  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0328907  normal  0.0314505 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1387  cytoplasmic alpha-amylase  46.23 
 
 
496 aa  436  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1157  cytoplasmic alpha-amylase  46.12 
 
 
494 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00381479  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2178  cytoplasmic alpha-amylase  46.12 
 
 
494 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170616  normal  0.0297459 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2526  cytoplasmic alpha-amylase  47.14 
 
 
495 aa  437  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2120  cytoplasmic alpha-amylase  46.12 
 
 
494 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.070724  normal  0.352748 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1280  cytoplasmic alpha-amylase  45.71 
 
 
494 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0337681  normal  0.462612 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0708  cytoplasmic alpha-amylase  45.04 
 
 
488 aa  432  1e-120  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0434693  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2027  cytoplasmic alpha-amylase  46.65 
 
 
495 aa  433  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1254  cytoplasmic alpha-amylase  46.65 
 
 
495 aa  433  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.345137 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2162  cytoplasmic alpha-amylase  46.65 
 
 
495 aa  433  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2125  cytoplasmic alpha-amylase  45.92 
 
 
494 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.172028  hitchhiker  0.0000021601 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2702  cytoplasmic alpha-amylase  46.65 
 
 
495 aa  434  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.363407 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1712  cytoplasmic alpha-amylase  46.65 
 
 
495 aa  432  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.118098 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1719  alpha amylase catalytic region  46.65 
 
 
495 aa  432  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1057  cytoplasmic alpha-amylase  46.45 
 
 
495 aa  431  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0627984  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1537  cytoplasmic alpha-amylase  46 
 
 
483 aa  422  1e-117  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0143259  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3249  alpha amylase catalytic region  44.95 
 
 
480 aa  421  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2808  alpha amylase catalytic region  44.12 
 
 
481 aa  419  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00730774  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1500  cytoplasmic alpha-amylase  44.56 
 
 
483 aa  409  1e-113  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04200  alpha-amylase, putative  43.53 
 
 
486 aa  388  1e-106  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917737  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03309  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15150)  37.37 
 
 
576 aa  325  1e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.979768  normal  0.838039 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18240  cytoplasmic alpha-amylase  39.36 
 
 
623 aa  317  4e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1139  cytoplasmic alpha-amylase  37.74 
 
 
516 aa  301  2e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18730  cytoplasmic alpha-amylase  30.37 
 
 
442 aa  189  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00080  alpha-amylase  29.96 
 
 
456 aa  149  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.52316  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1948  cytoplasmic alpha-amylase  27.54 
 
 
479 aa  148  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581984  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0631  cytoplasmic alpha-amylase  26.44 
 
 
469 aa  139  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02410  alpha amylase  26.1 
 
 
364 aa  106  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46693  predicted protein  26.98 
 
 
979 aa  92  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.649333  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18258  predicted protein  24.34 
 
 
517 aa  89.7  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  25.26 
 
 
439 aa  74.7  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  24.52 
 
 
510 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.1 
 
 
1855 aa  70.1  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0563  Alpha-amylase  24.1 
 
 
607 aa  67.8  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.611678  normal  0.295943 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0417  oligo-1,6-glucosidase  22.84 
 
 
554 aa  67.4  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36075  predicted protein  23.99 
 
 
447 aa  67  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00709127  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  23.53 
 
 
511 aa  66.6  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  22.3 
 
 
838 aa  65.9  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0104  alpha amylase catalytic region  26.56 
 
 
653 aa  64.7  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2341  alpha amylase catalytic region  21.76 
 
 
554 aa  63.5  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3915  alpha amylase catalytic region  24.37 
 
 
662 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0962846 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  25.43 
 
 
499 aa  62.8  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  22.89 
 
 
614 aa  62.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0421  putative oligo-1,6-glucosidase  22.59 
 
 
554 aa  62.8  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.591118  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35756  predicted protein  22.73 
 
 
410 aa  62.8  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.558305 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1296  trehalose synthase  23.15 
 
 
583 aa  61.6  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13842  normal  0.98704 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0959  a-glucosidase  23.29 
 
 
527 aa  61.6  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.766487  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0951  alpha amylase, catalytic region  24.05 
 
 
655 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3374  alpha amylase catalytic region  23.66 
 
 
453 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0148  alpha amylase catalytic region  27.61 
 
 
878 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0174055 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2654  alpha amylase catalytic region  23.8 
 
 
461 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.181273  normal  0.26185 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  27.23 
 
 
557 aa  60.5  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  22.87 
 
 
1891 aa  60.5  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  22.88 
 
 
1942 aa  60.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2728  alpha amylase catalytic region  22.9 
 
 
453 aa  60.1  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.89 
 
 
1975 aa  59.3  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  23.6 
 
 
1005 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0930  alpha amylase catalytic region  23.32 
 
 
614 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0985  alpha amylase domain-containing protein  23.08 
 
 
605 aa  58.9  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0694969  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  27.54 
 
 
551 aa  59.3  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1164  trehalose-6-phosphate hydrolase  26.09 
 
 
555 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.679252 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  22.26 
 
 
596 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0430  trehalose-6-phosphate hydrolase  26.09 
 
 
555 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  22.64 
 
 
586 aa  58.9  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  22.26 
 
 
596 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4716  alpha amylase catalytic region  31.21 
 
 
458 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  23.21 
 
 
555 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  23.42 
 
 
815 aa  58.5  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  22.26 
 
 
596 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  26.57 
 
 
595 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  22.49 
 
 
723 aa  58.2  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5240  alpha amylase catalytic region  22.51 
 
 
624 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  23.53 
 
 
600 aa  57.8  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  25 
 
 
622 aa  58.2  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  25.6 
 
 
1114 aa  57.8  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01890  cyclomaltodextrin glucanotransferase  23.65 
 
 
564 aa  57.4  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1506  trehalose-6-phosphate hydrolase  27.7 
 
 
561 aa  57.4  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  26.07 
 
 
1093 aa  57.4  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1485  trehalose synthase-like  22.5 
 
 
1108 aa  57  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0528  trehalose-6-phosphate hydrolase  27.1 
 
 
554 aa  57  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.664084  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  23.58 
 
 
1017 aa  57  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  22.98 
 
 
836 aa  56.2  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  21.79 
 
 
599 aa  56.2  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4292  Alpha-amylase A precursor (1,4-alpha-D-glucan glucanohydrolase)  24.7 
 
 
528 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>