123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2526 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_1719  alpha amylase catalytic region  88.08 
 
 
495 aa  926    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2526  cytoplasmic alpha-amylase  100 
 
 
495 aa  1032    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2027  cytoplasmic alpha-amylase  88.08 
 
 
495 aa  928    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2162  cytoplasmic alpha-amylase  88.08 
 
 
495 aa  928    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1387  cytoplasmic alpha-amylase  63.36 
 
 
496 aa  681    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1712  cytoplasmic alpha-amylase  87.88 
 
 
495 aa  926    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1254  cytoplasmic alpha-amylase  88.08 
 
 
495 aa  928    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.345137 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1057  cytoplasmic alpha-amylase  87.88 
 
 
495 aa  925    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0627984  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2125  cytoplasmic alpha-amylase  83.81 
 
 
494 aa  882    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.172028  hitchhiker  0.0000021601 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2178  cytoplasmic alpha-amylase  83.4 
 
 
494 aa  880    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170616  normal  0.0297459 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2120  cytoplasmic alpha-amylase  83.6 
 
 
494 aa  883    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.070724  normal  0.352748 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1157  cytoplasmic alpha-amylase  83.2 
 
 
494 aa  879    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00381479  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1280  cytoplasmic alpha-amylase  83.4 
 
 
494 aa  880    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0337681  normal  0.462612 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2702  cytoplasmic alpha-amylase  88.08 
 
 
495 aa  927    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.363407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2176  cytoplasmic alpha-amylase  52.16 
 
 
488 aa  539  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2409  cytoplasmic alpha-amylase  49.7 
 
 
494 aa  493  9.999999999999999e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1263  alpha amylase catalytic region  48.79 
 
 
499 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.796062 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000056  cytoplasmic alpha-amylase  47.14 
 
 
507 aa  437  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0351894  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05679  cytoplasmic alpha-amylase  46.44 
 
 
507 aa  436  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1800  alpha amylase, catalytic region  43.58 
 
 
627 aa  425  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.847837  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1812  cytoplasmic alpha-amylase  42.86 
 
 
492 aa  424  1e-117  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0328907  normal  0.0314505 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3273  cytoplasmic alpha-amylase  44.08 
 
 
549 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0708  cytoplasmic alpha-amylase  43.58 
 
 
488 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0434693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3261  cytoplasmic alpha-amylase  42.22 
 
 
513 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0208363  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3487  cytoplasmic alpha-amylase  43.23 
 
 
513 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3508  cytoplasmic alpha-amylase  42.42 
 
 
513 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3291  cytoplasmic alpha-amylase  42.22 
 
 
513 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000922062  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3551  cytoplasmic alpha-amylase  42.22 
 
 
513 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1500  cytoplasmic alpha-amylase  43 
 
 
483 aa  395  1e-109  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1758  cytoplasmic alpha-amylase  42.83 
 
 
513 aa  396  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591182  normal  0.938186 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3200  cytoplasmic alpha-amylase  42.22 
 
 
513 aa  391  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.570134  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2808  alpha amylase catalytic region  40.85 
 
 
481 aa  386  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00730774  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3249  alpha amylase catalytic region  40.24 
 
 
480 aa  383  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2394  cytoplasmic alpha-amylase  40.57 
 
 
472 aa  377  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04200  alpha-amylase, putative  41.75 
 
 
486 aa  361  2e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917737  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1537  cytoplasmic alpha-amylase  37.3 
 
 
483 aa  339  5.9999999999999996e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0143259  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03309  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15150)  36.25 
 
 
576 aa  311  2e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.979768  normal  0.838039 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18240  cytoplasmic alpha-amylase  34.71 
 
 
623 aa  253  7e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1139  cytoplasmic alpha-amylase  33.8 
 
 
516 aa  247  3e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0631  cytoplasmic alpha-amylase  26.17 
 
 
469 aa  159  8e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1948  cytoplasmic alpha-amylase  27.05 
 
 
479 aa  156  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581984  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18730  cytoplasmic alpha-amylase  29 
 
 
442 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00080  alpha-amylase  26.41 
 
 
456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.52316  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02410  alpha amylase  25.41 
 
 
364 aa  83.2  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18258  predicted protein  23.33 
 
 
517 aa  77  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46693  predicted protein  23.44 
 
 
979 aa  74.7  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.649333  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  24.82 
 
 
510 aa  63.9  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01890  cyclomaltodextrin glucanotransferase  21.41 
 
 
564 aa  61.6  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35756  predicted protein  22.05 
 
 
410 aa  60.1  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.558305 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0563  Alpha-amylase  22.88 
 
 
607 aa  59.7  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.611678  normal  0.295943 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  24.08 
 
 
511 aa  57.4  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36075  predicted protein  22.39 
 
 
447 aa  57.4  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00709127  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  21.54 
 
 
739 aa  57  0.0000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  22.25 
 
 
2068 aa  56.2  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  25.21 
 
 
541 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  25.21 
 
 
541 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  25.63 
 
 
545 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0201  alpha amylase catalytic region  22.79 
 
 
513 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213687  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  23.23 
 
 
499 aa  54.7  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05100  alpha-amylase  22.73 
 
 
762 aa  54.3  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.443393  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  22.2 
 
 
1527 aa  53.9  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1458  alpha amylase, catalytic region  23.02 
 
 
651 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  27.6 
 
 
642 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  21.58 
 
 
493 aa  52.8  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  27.27 
 
 
568 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  29.82 
 
 
1363 aa  52.4  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  32.43 
 
 
439 aa  52.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  20.37 
 
 
610 aa  51.2  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.855853 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  23.65 
 
 
462 aa  50.8  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3915  alpha amylase catalytic region  22.8 
 
 
662 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0962846 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  21.47 
 
 
815 aa  50.1  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  28.28 
 
 
703 aa  50.1  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  22.99 
 
 
509 aa  50.1  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1785  alpha amylase, catalytic region  22.37 
 
 
639 aa  48.9  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48062  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  22.31 
 
 
1942 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  27.54 
 
 
524 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2593  alpha amylase catalytic region  23.38 
 
 
258 aa  48.5  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191559  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  22.57 
 
 
723 aa  48.9  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  21.17 
 
 
838 aa  48.5  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  22.28 
 
 
600 aa  48.1  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  26.7 
 
 
575 aa  47.8  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04843  Putative alpha-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B3N7]  23.08 
 
 
591 aa  47.4  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145231  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  24.69 
 
 
649 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0052  alpha amylase catalytic region  24.88 
 
 
577 aa  47  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  22.12 
 
 
1005 aa  47  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0051  alpha amylase catalytic region  26.34 
 
 
590 aa  47  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.237414 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  23.35 
 
 
586 aa  46.2  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1414  alpha amylase catalytic region  24.46 
 
 
703 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0623392  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0545  alpha,alpha-phosphotrehalase  30.61 
 
 
553 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0210  alpha amylase catalytic region  21.05 
 
 
741 aa  46.2  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0538024  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  23.68 
 
 
555 aa  46.6  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03308  conserved hypothetical protein. (Eurofung)  21.11 
 
 
552 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77903  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0107  alpha-amylase family protein  24.55 
 
 
541 aa  45.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0384017  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  18.99 
 
 
2821 aa  45.8  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  23.85 
 
 
555 aa  45.8  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3722  alpha amylase, catalytic region  22 
 
 
646 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0770  alpha amylase, catalytic region  21.56 
 
 
455 aa  45.8  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  23.29 
 
 
522 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4463  alpha amylase catalytic region  21.91 
 
 
442 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.469495 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  22.03 
 
 
583 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>