98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1346 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  100 
 
 		 1363 aa  2776    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  38.8 
 
 		 1527 aa  596  1e-168  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  31.92 
 
 		 2821 aa  537  1e-151  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1752  glycosyl hydrolase  38.21 
 
 		 1514 aa  526  1e-148  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0544  YG repeat-containing glycosyl hydrolase  37.61 
 
 		 1475 aa  515  1e-144  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1355  hypothetical protein  58.57 
 
 		 532 aa  425  1e-117  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0180624  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1365  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  73.84 
 
 		 514 aa  268  4e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0022042  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1367  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  65.8 
 
 		 474 aa  261  6e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000955772  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  47.48 
 
 		 420 aa  246  3e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1336  cell wall binding repeat-containing protein  67.07 
 
 		 184 aa  226  3e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0859  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  42.11 
 
 		 399 aa  150  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000303579  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1094  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  42.11 
 
 		 399 aa  145  5e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000219862  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1410  hypothetical protein  29.11 
 
 		 1025 aa  97.8  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1409  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1009 aa  97.8  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1411  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1002 aa  97.4  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  33.52 
 
 		 2495 aa  80.9  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0490  cell wall binding repeat-containing protein  25.05 
 
 		 1557 aa  77.8  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05950  glucan-binding domain-containing protein  26.06 
 
 		 753 aa  77  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000330124  hitchhiker  0.0000000000107499 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07880  glucan-binding domain-containing protein  24.18 
 
 		 651 aa  70.9  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352799 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11330  putative cell wall binding protein  29.9 
 
 		 502 aa  69.7  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.307599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06260  glucan-binding domain-containing protein  28.8 
 
 		 324 aa  69.3  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  24.72 
 
 		 550 aa  68.9  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0593  cell wall binding repeat-containing protein  27.38 
 
 		 552 aa  67.4  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000201841  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14440  subtilase family protease  28.26 
 
 		 817 aa  64.7  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3200  cytoplasmic alpha-amylase  34.82 
 
 		 513 aa  64.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.570134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3551  cytoplasmic alpha-amylase  34.82 
 
 		 513 aa  64.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3261  cytoplasmic alpha-amylase  34.82 
 
 		 513 aa  64.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0208363  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3291  cytoplasmic alpha-amylase  34.82 
 
 		 513 aa  64.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000922062  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3508  cytoplasmic alpha-amylase  34.82 
 
 		 513 aa  64.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2176  cytoplasmic alpha-amylase  31.09 
 
 		 488 aa  63.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1387  cytoplasmic alpha-amylase  34.4 
 
 		 496 aa  63.2  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25520  conserved repeat protein  26.95 
 
 		 613 aa  63.2  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  31.91 
 
 		 592 aa  62.4  0.00000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0597  surface protein pspA precursor  26.64 
 
 		 434 aa  61.6  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16990  glucan-binding domain-containing protein  30.29 
 
 		 342 aa  60.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1758  cytoplasmic alpha-amylase  33.93 
 
 		 513 aa  60.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591182  normal  0.938186 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00880  putative cell wall binding protein  27.59 
 
 		 478 aa  60.1  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  0.955176 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0591  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  25.57 
 
 		 573 aa  60.1  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000159659  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1712  cytoplasmic alpha-amylase  33.06 
 
 		 495 aa  59.7  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1254  cytoplasmic alpha-amylase  33.06 
 
 		 495 aa  59.7  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.345137 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2162  cytoplasmic alpha-amylase  33.06 
 
 		 495 aa  59.7  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2027  cytoplasmic alpha-amylase  33.06 
 
 		 495 aa  59.7  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1719  alpha amylase catalytic region  33.06 
 
 		 495 aa  59.7  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2702  cytoplasmic alpha-amylase  33.06 
 
 		 495 aa  59.3  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.363407 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14460  glucan-binding domain-containing protein  25.25 
 
 		 757 aa  59.3  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.706218  normal  0.855897 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1057  cytoplasmic alpha-amylase  33.06 
 
 		 495 aa  59.3  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0627984  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3487  cytoplasmic alpha-amylase  33.04 
 
 		 513 aa  57.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3249  alpha amylase catalytic region  35.35 
 
 		 480 aa  57.4  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1812  cytoplasmic alpha-amylase  30 
 
 		 492 aa  57  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0328907  normal  0.0314505 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0611  cell wall binding repeat-containing protein  25.21 
 
 		 430 aa  57.4  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2808  alpha amylase catalytic region  33.64 
 
 		 481 aa  56.6  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00730774  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0605  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  29.73 
 
 		 807 aa  57  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  33.05 
 
 		 811 aa  55.5  0.000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1139  cytoplasmic alpha-amylase  27.74 
 
 		 516 aa  55.1  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18240  cytoplasmic alpha-amylase  25.71 
 
 		 623 aa  54.7  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14450  glucan-binding domain-containing protein  28.88 
 
 		 532 aa  54.7  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.521361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14470  putative cell wall binding protein  26.19 
 
 		 512 aa  55.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.444931 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3273  cytoplasmic alpha-amylase  33.33 
 
 		 549 aa  54.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14530  glucan-binding domain-containing protein  27.59 
 
 		 602 aa  53.5  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.259034 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  25.13 
 
 		 454 aa  53.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0708  cytoplasmic alpha-amylase  26.56 
 
 		 488 aa  53.5  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0434693  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1537  cytoplasmic alpha-amylase  30.09 
 
 		 483 aa  53.1  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0143259  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1263  alpha amylase catalytic region  32.03 
 
 		 499 aa  53.5  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.796062 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1800  alpha amylase, catalytic region  35.87 
 
 		 627 aa  53.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.847837  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2526  cytoplasmic alpha-amylase  29.75 
 
 		 495 aa  52.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0077  S-layer protein  26.06 
 
 		 697 aa  52.4  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0803176  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05190  putative cell wall binding protein  31.3 
 
 		 440 aa  51.6  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2178  cytoplasmic alpha-amylase  29.75 
 
 		 494 aa  51.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170616  normal  0.0297459 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02530  glucan-binding domain-containing protein  23.79 
 
 		 377 aa  51.6  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459016  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1157  cytoplasmic alpha-amylase  29.75 
 
 		 494 aa  51.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00381479  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  26.28 
 
 		 1131 aa  51.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1280  cytoplasmic alpha-amylase  29.75 
 
 		 494 aa  51.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0337681  normal  0.462612 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  27.22 
 
 		 1131 aa  51.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  28.75 
 
 		 750 aa  50.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18730  cytoplasmic alpha-amylase  32.71 
 
 		 442 aa  50.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2409  cytoplasmic alpha-amylase  30.19 
 
 		 494 aa  50.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2120  cytoplasmic alpha-amylase  29.75 
 
 		 494 aa  50.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.070724  normal  0.352748 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2125  cytoplasmic alpha-amylase  29.75 
 
 		 494 aa  50.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.172028  hitchhiker  0.0000021601 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  37.04 
 
 		 555 aa  49.7  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16000  putative cell wall binding protein  26.42 
 
 		 316 aa  50.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000272933 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1500  cytoplasmic alpha-amylase  28.68 
 
 		 483 aa  50.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  37.04 
 
 		 555 aa  50.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2394  cytoplasmic alpha-amylase  29.67 
 
 		 472 aa  49.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05679  cytoplasmic alpha-amylase  25.83 
 
 		 507 aa  49.3  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02410  alpha amylase  32.94 
 
 		 364 aa  49.3  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04260  putative cell wall binding protein  30.21 
 
 		 465 aa  48.9  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.878918  normal  0.401989 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18258  predicted protein  25.9 
 
 		 517 aa  48.5  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0834  alpha amylase catalytic region  30.38 
 
 		 650 aa  47.8  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0550  cell wall binding repeat-containing protein  23.83 
 
 		 330 aa  47.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.515915  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000056  cytoplasmic alpha-amylase  25.36 
 
 		 507 aa  47.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0351894  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  24 
 
 		 762 aa  48.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0223841  normal  0.138276 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0544  alpha amylase catalytic region  35.19 
 
 		 758 aa  47  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  31.25 
 
 		 619 aa  45.8  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09550  putative cell wall binding protein  31.33 
 
 		 331 aa  45.8  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0189396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5584  cell wall binding repeat-containing protein  39.47 
 
 		 737 aa  45.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1176  alpha amylase catalytic region  35.37 
 
 		 647 aa  45.4  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0615  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  44.23 
 
 		 341 aa  45.1  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.131346  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11960  putative cell wall binding protein  28.38 
 
 		 578 aa  45.1  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000480831  normal  0.155715 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>