More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2176 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2409  cytoplasmic alpha-amylase  64.27 
 
 		 494 aa  664    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2176  cytoplasmic alpha-amylase  100 
 
 		 488 aa  1012    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1263  alpha amylase catalytic region  57.67 
 
 		 499 aa  579  1e-164  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.796062 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1719  alpha amylase catalytic region  52.56 
 
 		 495 aa  547  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1254  cytoplasmic alpha-amylase  52.56 
 
 		 495 aa  548  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.345137 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2162  cytoplasmic alpha-amylase  52.56 
 
 		 495 aa  548  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1057  cytoplasmic alpha-amylase  52.35 
 
 		 495 aa  546  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0627984  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2027  cytoplasmic alpha-amylase  52.56 
 
 		 495 aa  548  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1712  cytoplasmic alpha-amylase  52.56 
 
 		 495 aa  547  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2702  cytoplasmic alpha-amylase  52.15 
 
 		 495 aa  544  1e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.363407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1157  cytoplasmic alpha-amylase  50.72 
 
 		 494 aa  539  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00381479  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1387  cytoplasmic alpha-amylase  52.15 
 
 		 496 aa  539  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2526  cytoplasmic alpha-amylase  52.16 
 
 		 495 aa  539  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2120  cytoplasmic alpha-amylase  50.31 
 
 		 494 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.070724  normal  0.352748 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2125  cytoplasmic alpha-amylase  50.51 
 
 		 494 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.172028  hitchhiker  0.0000021601 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2178  cytoplasmic alpha-amylase  50.51 
 
 		 494 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170616  normal  0.0297459 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1280  cytoplasmic alpha-amylase  50.31 
 
 		 494 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0337681  normal  0.462612 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000056  cytoplasmic alpha-amylase  51.12 
 
 		 507 aa  491  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0351894  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1800  alpha amylase, catalytic region  48.77 
 
 		 627 aa  485  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.847837  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05679  cytoplasmic alpha-amylase  50.62 
 
 		 507 aa  485  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3273  cytoplasmic alpha-amylase  48.97 
 
 		 549 aa  464  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1812  cytoplasmic alpha-amylase  46.91 
 
 		 492 aa  450  1e-125  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0328907  normal  0.0314505 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0708  cytoplasmic alpha-amylase  45.7 
 
 		 488 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0434693  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3487  cytoplasmic alpha-amylase  44.86 
 
 		 513 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1500  cytoplasmic alpha-amylase  46.22 
 
 		 483 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2394  cytoplasmic alpha-amylase  45.15 
 
 		 472 aa  436  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1758  cytoplasmic alpha-amylase  44.65 
 
 		 513 aa  434  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591182  normal  0.938186 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3508  cytoplasmic alpha-amylase  44.44 
 
 		 513 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3291  cytoplasmic alpha-amylase  44.24 
 
 		 513 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000922062  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3261  cytoplasmic alpha-amylase  44.03 
 
 		 513 aa  430  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0208363  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3551  cytoplasmic alpha-amylase  44.24 
 
 		 513 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3200  cytoplasmic alpha-amylase  43.74 
 
 		 513 aa  430  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.570134  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2808  alpha amylase catalytic region  44.15 
 
 		 481 aa  416  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00730774  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3249  alpha amylase catalytic region  43.12 
 
 		 480 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04200  alpha-amylase, putative  43.24 
 
 		 486 aa  394  1e-108  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917737  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1537  cytoplasmic alpha-amylase  42.33 
 
 		 483 aa  379  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0143259  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03309  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15150)  37.6 
 
 		 576 aa  329  7e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.979768  normal  0.838039 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18240  cytoplasmic alpha-amylase  34.52 
 
 		 623 aa  268  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1139  cytoplasmic alpha-amylase  33.79 
 
 		 516 aa  255  1.0000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18730  cytoplasmic alpha-amylase  29.48 
 
 		 442 aa  168  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0631  cytoplasmic alpha-amylase  29.41 
 
 		 469 aa  166  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1948  cytoplasmic alpha-amylase  26.64 
 
 		 479 aa  146  9e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581984  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00080  alpha-amylase  27.98 
 
 		 456 aa  145  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.52316  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02410  alpha amylase  26.3 
 
 		 364 aa  107  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18258  predicted protein  23.48 
 
 		 517 aa  80.9  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36075  predicted protein  24.04 
 
 		 447 aa  80.1  0.00000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00709127  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46693  predicted protein  24.09 
 
 		 979 aa  72  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.649333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  26.09 
 
 		 499 aa  70.9  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  27.05 
 
 		 583 aa  70.5  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  25.74 
 
 		 462 aa  69.7  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  29.67 
 
 		 595 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1727  alpha amylase catalytic region  23.58 
 
 		 454 aa  67.8  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000518329  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5240  alpha amylase catalytic region  23.75 
 
 		 624 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2593  alpha amylase catalytic region  28.38 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191559  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0563  Alpha-amylase  22.31 
 
 		 607 aa  64.7  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.611678  normal  0.295943 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  22.28 
 
 		 493 aa  64.3  0.000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  28.57 
 
 		 593 aa  64.7  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  31.09 
 
 		 1363 aa  63.9  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1595  alpha-D-1,4-glucosidase  26.85 
 
 		 549 aa  63.2  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1564  alpha-D-1,4-glucosidase  26.85 
 
 		 549 aa  63.2  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  24.78 
 
 		 600 aa  63.2  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  26.16 
 
 		 556 aa  61.6  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  23.98 
 
 		 509 aa  62  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0433  trehalose-6-phosphate hydrolase  26.64 
 
 		 562 aa  61.6  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000180763  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35756  predicted protein  22.54 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.558305 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  27.16 
 
 		 604 aa  60.8  0.00000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  24.43 
 
 		 511 aa  60.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2341  alpha amylase catalytic region  26.58 
 
 		 554 aa  60.5  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0554  alpha amylase, catalytic region  25.14 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0002426  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1785  alpha amylase, catalytic region  21.11 
 
 		 639 aa  60.1  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48062  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4038  alpha amylase catalytic region  23.84 
 
 		 544 aa  58.9  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0583407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0568  alpha amylase catalytic region  23.76 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.489897  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3136  glucan 1,4-alpha-maltotetraohydrolase  22.84 
 
 		 555 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.815174  hitchhiker  0.00720592 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1070  alpha-glucosidase  26.39 
 
 		 551 aa  57.8  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297332  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  26.03 
 
 		 515 aa  57.4  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  23.92 
 
 		 609 aa  57  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  24.22 
 
 		 654 aa  57  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0770  alpha amylase, catalytic region  21.35 
 
 		 455 aa  56.6  0.0000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04843  Putative alpha-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B3N7]  24.88 
 
 		 591 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145231  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0357  glycosyl hydrolase family protein  27.1 
 
 		 554 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000071861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0347  alpha-glucosidase  27.1 
 
 		 554 aa  56.2  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225343  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0343  alpha-glucosidase  27.1 
 
 		 554 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  27.19 
 
 		 544 aa  56.2  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0371  glycosyl hydrolase family protein  27.1 
 
 		 554 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000236448  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0470  glycosyl hydrolase family protein  27.1 
 
 		 554 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0413  glycosyl hydrolase family protein  27.1 
 
 		 554 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000830485 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0578  trehalose-6-phosphate hydrolase  24.16 
 
 		 556 aa  56.2  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0481  glycosyl hydrolase family protein  27.1 
 
 		 554 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000250656  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  41.67 
 
 		 563 aa  55.8  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  24.25 
 
 		 2068 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  22.82 
 
 		 570 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  22.4 
 
 		 815 aa  55.5  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004234  trehalose-6-phosphate hydrolase  25.51 
 
 		 561 aa  55.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0161937  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  26.51 
 
 		 562 aa  55.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  26.7 
 
 		 510 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  25.23 
 
 		 566 aa  55.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0523  trehalose-6-phosphate hydrolase  24.77 
 
 		 560 aa  54.7  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  24.54 
 
 		 557 aa  55.1  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4891  glycosyl hydrolase family protein  26.42 
 
 		 554 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000186881  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0427  glycosyl hydrolase family protein  26.42 
 
 		 554 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>